כתב יד זה מתאר כיצד ליישם ניתוח האינטראקציה פסיכופיזיולוגיות לגלות שינויים תלויי-פעילות פונקציונלית קישוריות בין אזור שנבחר זרע voxels באזורים אחרים של המוח. ניתוח האינטראקציה פסיכופיזיולוגיות הוא שיטה פופולארית לבחון השפעות פעילות על חיבוריות במוח, נבדל univariate מסורתי הפעלת אפקטים.
בדימות מוחי, דימות תהודה מגנטי תפקודי (fMRI) מודד את האות (מודגש) התלויים דם ברמת חמצון במוח. מידת המתאם של והנועז אות ב במרחב אזורים עצמאיים של המוח מגדיר קישוריות פונקציונלי של אזורים אלה. במהלך פעילות קוגניטיבית fMRI, ניתוח פסיכופיזיולוגיות אינטראקציה (PPI) ניתן לבחון שינויים קישוריות תפקודית במהלך בהקשרים ספציפיים שהוגדרו על-ידי הפעילות הקוגניטיבית. דוגמה של משימה כזו הוא אחד שעושה. את מערכת הזיכרון, מבקש ממשתתפים ללמוד זוגות של מילים שאינן קשורות (קידוד), זוכר את המילה השנייה בזוג כאשר מוצג עם המילה הראשונה (אחזור). במחקר הנוכחי, השתמשנו סוג זה של ניתוח PPI (gPPI) מוכללת של זיכרון אסוציאטיבי פעילות כדי להשוות בין שינויים בהיפוקמפוס בקישוריות של אנשים מבוגרים שאינם נשאים של (אפסילון-4 אפוליפופרוטאין-E מחלת אלצהיימר (AD) גורם סיכון גנטי APOEΕ4). באופן ספציפי, אנו מראים כי קישוריות פונקציונלי של לאזורי משנה של השינויים ההיפוקמפוס במהלך הקידוד, אחזור, את שני השלבים פעיל של הפעילות זיכרון אסוציאטיבי. שינויים תלויי-ההקשר קישוריות פונקציונלי של ההיפוקמפוס היו שונים באופן משמעותי בנשאים של APOEε4 בהשוואה ללא-נשאים. ניתוחים PPI מאפשרים לבחון שינויים באופן פונקציונלי קישוריות, נבדל univariate אפקטים עיקריים, וכדי להשוות את השינויים האלה על פני קבוצות. לפיכך, ניתוח PPI עלול לגלות תופעות המשימה המורכבת גדודים ספציפי זה בשיטות מסורתיות univariate אינם לוכדים. PPI ניתוחים לא יכול, עם זאת, לקבוע כיוון או סיבתיות בין אזורים מחוברים באופן פונקציונלי. ובכל זאת, ניתוחים PPI לספק אמצעי רב עוצמה ליצירת וההשערות ספציפית לגבי יחסים פונקציונליים, אשר יכול להיבדק באמצעות מודלים סיבתי. כפי המוח יותר ויותר מתואר במונחים של קישוריות ורשתות PPI היא שיטה חשובה עבור ניתוח נתונים פעילות fMRI זה עולה בקנה אחד עם התפיסה הנוכחית של המוח האנושי.
המונח “connectome” נטבע בשנת 2005 מסמן שינוי פרדיגמה במדעי המוח שממשיך עד היום1. המוח הוא יותר ויותר מתואר במונחים של רשתות פונקציונלי, קישוריות, אינטראקציות בין ובין אזורים בקנה מידה גדול. ובכל זאת, התיחום של אזורי התמחות תפקודית ואגודות בין פעילות נמדד ב- fMRI דרישות המשימה הן גישות עדיין תקפים ושימושיים. לאור ההתעניינות הגוברת ב connectomics קישוריות פונקציונלי גישות ניתוח fMRI של פעילות הגדלים הפופולריות. גישה אחת כדי מדידת שינויים פונקציונליים קישוריות תלויה המשימה דורשת עושה שימוש של המושג PPI. PPI היא האינטראקציה של המשימות הפעילה שלב או פעילות מסוימת לפי דרישה (“פסיכו”) עם קישוריות פונקציונלי (“פיזיו’) של אזור מעניינים או”זרע”במוח. PPI שונה מניתוח bivariate, המבוססים על המתאם של קישוריות פונקציונלי, אשר בדרך כלל מודד את מידת הקורלציה בין הפעילות שני אזורים ללא אילוצים כלשהם הקשורים לדרישות המשימה.
הקונספט ואת המסגרת של ניתוח PPI תוארה לראשונה על ידי Friston ועמיתיו בשנת 19972. המחברים טענה כי הגישה שלהם היה חשוב כי זה יאפשר החקירה של קישוריות לדייק יותר פונקציונלית ולאפשר מסקנות פעילות דיסטלי זרע יכול להתכוונן פעילות הנובע דרישה פעילות. בשנת 2012, מקלארן ועמיתיו להוסיף מסגרת מקורית זו תיאר בגישה gPPI שבו כל שלבי הפעילות ואת האינטראקציות שלהם כלולים דגם אחד3. גישה זו מובילה לתוצאות שהן יותר רגיש וספציפי שלב המשימות ואת האינטראקציה נחקר. זה גישה זו gPPI מעודכן זה אנו מעסיקים בהווה ללמוד (ראה שלב 6.2.2 בפרוטוקול). הגישה gPPI עכשיו ציטט מחקרים מעל 200. למען הבהירות להלן נשתמש ‘PPI’ כדי לתאר תכונות משותפות של שני הגירסה סטנדרטי, כללית. ‘gPPI’ ישמש כדי לדון בפיתוחים ספציפיים הקשורים למסגרת חדשה יותר.
המטרה הכוללת של ניתוח PPI הוא להבין כיצד הדרישות של פעילות קוגניטיבית להשפיע או לווסת את קישוריות פונקציונלי של אזור זרע. ניתוח PPI דורש השערה חזקה א-פריורי . פעילות באזור הזרע חייב להיות מווסת על ידי הפעילות על מנת הגישה PPI לעבוד ביעילות4. לדוגמה, במחקר הנוכחי, אנחנו מבוסס שלנו מבחר זרע על הראיות חזקה כי פעילות בהיפוקמפוס הוא מווסת על ידי הדרישות הקוגניטיביות של פעילות זיכרון. באמצעות PPI, אזורים המחוברים באופן משמעותי פחות או יותר פונקציונלית בהיפוקמפוס במהלך שלבי פעילות מסוימת יכול להיות מזוהה. בקיצור, נשאל את השאלה, “בבאילו אזורים היא פעילות יותר בקורלציה עם הזרע במהלך הקשר A לעומת בסיסית?” אפשר גם לבקש ההפך לוגיים (כפי חשוב להבין את ההבדל): “אילו אזורים היא פעילות פחות מתואם עם הזרע במהלך הקשר A לעומת בסיסית?” בעת פירוש קבוצה הבדלים אפקטים PPI, חשוב לבחון את הנתונים ואת שינוי חיובי או שלילי קישוריות תפקודית או שניהם, הוא נוהג קבוצה הבדלים.
הגישה PPI שימש ללמוד רכזות בקרת פעילות דינאמית בפקדים בריא, איך אפנון של קישוריות פונקציונלי קשורה ביצועים קוגניטיביים של מחלת אלצהיימר (AD), אינטליגנציה אצל אנשים עם אוטיזם, קישוריות רשת מנוע אצל אנשים עם מחלת פרקינסון, הפנים עיבוד אצל אנשים עם הפרעת גוף דיסמורפית, אנורקסיה, טורדניות, זיכרון, ועוד שאלות רבות נוספות ספציפיות הקשורות קישוריות5,6,7 ,8,9,10,11. במחקר הנוכחי, אנו משווים שינויים פונקציונליים בקישוריות של לאזורי משנה של ההיפוקמפוס במהלך קידוד הזיכרון ואחזור בין קבוצה של אנשים בסיכון גנטי מוגבר המודעה כדי קבוצה ללא גורם סיכון12. להלן תיאור הפרוטוקול שבהן השתמשנו, החלת הגישה gPPI, כדי לאפשר לנו לבדוק אם הפעילות-elicited לשינויים פונקציונליים קישוריות שונים בשיתוף עם הנוכחות של APOEε4, מהווה גורם סיכון גנטי לספירה.
לימודי fMRI מבוסס-משימות שנועדו לחשוף קשרים סטטיסטיים בין תהליכים קוגניטיביים מסוים או דרישות ושינויים והנועז אות ביחס מידה בסיסית. גישה מסורתית זו שימושית לזיהוי אזורים ספציפיים במוח שבו פעילות הוא מווסת על ידי פעילות ניסיוני. לעומת זאת, ניתוח PPI בעיקר עוסקת של האפנון של קישוריות פונקציונ…
The authors have nothing to disclose.
עבודה זו נתמכה על ידי נבחרת המכון של הזדקנות (גרנט מספר R01AG013308 כדי SYB, F31AG047041 כדי TMH). המחברים השתמשו חישובית, שירותי אחסון המשויך Hoffman2 המשותפים באשכול שסופקו על-ידי המכון UCLA עבור קבוצת הטכנולוגיה הדיגיטלית מחקר והדרכה של מחקר.
3T manetic resonance imaging scanner | Siemens Medical Solutions | MAGNETOM Trio, A Tim System | 3T MRI Scanner |
FSL (FMRIB Software Library) | Oxford University | Version 6.0 | Functional Imaging Processing Software |
AFNI (Analysis of Functional Neuroimaging) | National Institute of Mental Health, National Institutes of Health | Any version after May 2015 | Functional Imaging Processing Software |
SPM8 (Statistical Parametric Mapping) | University College of London | SPM8 | Functional Imaging Processing Software |
Matlab Software | The Mathworks, Inc | Version R2012a | Computing Software |
SDS Software | Applied Biosystems, Inc | 7900HT Fast Real-Time PCR System | Real Time PCR |
Taqman Assays | ThermoFisher Scientific | Specific to SNP | SNP Genotyping |