Представленная здесь простая методика для конфокальной высококонтрастной визуализации развития корня и гипокотиля с высокой разрешающей способностью на срок до 3 дней с использованием высоких численно-апертурных целей и перфтордекалина в качестве иммерсионной среды.
Некоторые аспекты развития растений, такие как морфогенез боковых корней, происходят во временных промежутках в несколько дней. Для изучения лежащих в основе клеточных и субклеточных процессов необходимы стратегии микроскопии с высоким разрешением, которые сохраняют физиологические условия. Ткани растений должны иметь достаточное количество питательных веществ и воды с устойчивым газовым обменом, но при погружении и иммобилизации под покровным стеклом они особенно чувствительны к гипоксии. Одна из стратегий, которая была успешно применена, заключается в использовании перфузионной системы для поддержания постоянной подачи кислорода и питательных веществ. Однако такие меры могут быть сложными, громоздкими и требуют специального оборудования. Представленная здесь альтернативная стратегия для простой системы визуализации с использованием перфтордекалина в качестве иммерсионной среды. Эта система проста в настройке, требует минимального оборудования и легко устанавливается на подставку микроскопа, позволяя устанавливать и отображать несколько камер визуализации по номиналуаллель. В этой системе скорости роста боковых корней неотличимы от темпов роста в стандартных условиях на чашках с агаром в течение первых двух дней, а рост боковых корней продолжается со сниженными скоростями, по меньшей мере, в течение еще одного дня. Ткани растений снабжаются питательными веществами через агар-сляб, который также может использоваться для введения ряда фармакологических соединений. Система была создана для мониторинга развития боковых корней, но легко адаптируется к изображениям других органов растений, таких как гипокотилии и первичные корни.
Для изучения клеточных и субклеточных процессов, лежащих в основе развития растений, растет спрос на долгосрочные технологии получения изображений с высокой разрешающей способностью. Ключевая проблема в таких экспериментах по визуализации заключается в поддержании физиологических условий, включая достаточный газообмен, плюс подачу воды и питательных веществ 1 , 2 , 3 . Чтобы использовать цели с высокими числовыми отверстиями для оптимального оптического разрешения, образцы должны располагаться в непосредственной близости и ориентироваться параллельно покровному стеклу. Движение в направлениях x, y и z в идеале должно быть минимальным во время изображения.
Хотя сеянцы часто устанавливают в воде или водном растворе для кратковременной визуализации, вода обладает низкой способностью растворять CO 2 и O 2 (1,54 мг / мл и 0,04 мг / мл соответственно при 20 o C, 0,1 МПа) 4 , что делаетОн непригоден для длительных экспериментов. Системы перфузии, которые поддерживают постоянный уровень кислорода и питательных веществ, являются одним из решений этой проблемы и разработаны для конфокальной лазерной сканирующей микроскопии (CLSM) 1 , 2 , 3 и световой листовой микроскопии (LSM) 5 . Такие системы, как RootChip 2 и RootArray 3 , были специально разработаны для визуализации временных развитий развивающихся корней и включают проращивание семян в устройстве для создания нескольких образцов на заказ. Эти устройства обеспечивают минимальное механическое возмущение и предназначены для параллельного анализа нескольких сеянцев, но не оптимизированы для визуализации субклеточных структур. Кальдер и его коллеги разработали более сложную камеру для получения изображений на основе перфузии, оптимизированную для визуализации субклеточных структур, в которых образец удерживается на месте сеткойЧтобы позволить использовать линзы с большим увеличением 1 .
Представленное здесь альтернативное, простое решение этой проблемы, которое основано не на перфузионных системах, но использует перфтордекалин (PFD), перфторуглерод, который недавно приобрел популярность в качестве монтажной среды для изображений Arabidopsis 6 , 7 , 8 . В таких применениях высокая пропускная способность PFD для растворения CO 2 и O 2 (1,9 г / мл для O 2 в PFD по сравнению с 0,04 мг / мл в воде) 9 позволяет осуществлять газообмен в погруженной ткани. Кроме того, ПФО не флуоресцентный и его показатель преломления (1,313) сопоставим с показателем преломления воды (1,333) и ближе к цитозолу (1,4), чем по воздуху (1,000) 6 . Сообщается, что перфторуглероды оказывают минимальное физиологическое воздействие на различные растения и растенияВопросы 6 , с семенами редьки легко прорастают при погружении в ПФО и демонстрируют нормальный рост и развитие в течение по крайней мере двух полных дней, когда снабжаются водой 10 . Аналогичные наблюдения были сделаны для прорастания семян Arabidopsis 6 . На основании ВКР-рассеяния, чтобы непосредственно отобразить распределение ПФО в тканях листьев Arabidopsis после инфильтрации, Литлджон и коллеги заключают, что ПФД, вероятно, не поглощается живыми клетками 8 . Ранее ПФД использовался преимущественно для аэрофотосъемки изображения, где он значительно увеличивает глубину изображения, поскольку он легко проникает в воздушные пространства из-за его низкого поверхностного натяжения 6 . Здесь ПФО принимается для долгосрочного конфокального изображения развивающихся латеральных корешков. В этой конфигурации одну или несколько проростков помещают на плиту питательной среды, отвержденной агаром и погруженной в ПФД. PFD позволяет gВ результате чего достигается равномерный обмен в камере визуализации, предотвращающий аноксию. PFD является очень летучим, поэтому он удерживается прокладкой из полидиметилсилоксановой смолы, которая также обладает высокой газопроницаемостью (1,5 × 10 -12 пмоль / м · с -1 Па -1 для CO 2 ) 11 . Питательные вещества и вода подаются слябом из среды, отвержденной агаром. В то же время эта агарная плита мягко прижимает корень к покровному стеклу, фиксируя его относительное положение в камере формирования изображения и позволяя использовать линзы с погружением в воду с высоким разрешением. Кроме того, агарную плиту можно использовать для введения ряда фармакологических обработок, включая дексаметазон, оризалин и изоксабен. Камера формирования изображения может быть собрана в большом количестве со стандартных слайдов для микроскопа, используя минимальное оборудование. Камеры визуализации были разработаны и охарактеризованы для изучения развития боковых корней, но адаптированы к визуализации других органов рассады, таких как наконечники первичного корня игипокотиль.
Представленный здесь метод представляет собой простую стратегию для конфокальной визуализации высокого разрешения развивающихся боковых корней в течение двух и до трех дней. Для периодов до 48 ч не наблюдалось отрицательных эффектов системы формирования изображения на развитие боковых корней. Через 48 часов средний рост боковых корней начал замедляться, хотя значительное количество корней (37%) продолжало расти со скоростью, сопоставимой со средним ростом корня на пластинах. Поэтому при визуализации достаточно большого количества корней можно исключить корни, рост которых замедляется через 48 часов. Систематические тесты камер визуализации не проводились в течение более чем 72 часов, но рекомендуются альтернативные стратегии, если желательны длительные периоды визуализации. Камеры отображения могут оставаться на стадии микроскопа непрерывно, если имеются подходящие условия окружающей среды, или удаляться в средство роста и периодически возвращаться в микроскоп. Это позволяет отображать многочисленные камеры параллельно. </ Р>
Одно из преимуществ описанных здесь камер состоит в том, что боковые корни фиксируются в их положении и могут быть отображены с использованием линз с погружением в воду с высоким разрешением. Пространственная стабильность критически зависит от концентрации агара, используемой в плите опорного агара. Сначала тестировали диапазон различных концентраций от 0,8% агара до 2% агара, показав, что высокие концентрации в этом диапазоне стабильно фиксируют корни в пространстве, но рост корней замедляется быстрее, а некоторые корни проявляют признаки механического напряжения, в том числе уменьшенное удлинение клетки. Напротив, низкие концентрации агара не обеспечивали необходимую поддержку, и корни дрейфовали по x, y и z во время получения изображения. Оптимальная 1,5% агаровая плита фиксирует положение образца без неблагоприятных механических воздействий. В этих условиях после оседания в первые 30 мин или около того корни стабильны в течение многих часов, что позволяет получать данные за ночь. Во время сбора 4D-данных диапазоны z-стека обычно были bРэкетом еще на 5-10 мкм, но это было главным образом для обеспечения внеплоскостного роста боковых корней, а не z-дрейфа или колебания. Хотя стандартная концентрация агара обеспечивает некоторое сопротивление проникновению, гравитропно растущие корни, в конечном счете, проникают в агар. Тем не менее, благодаря незначительной модификации камеры формирования изображения, рост корня можно поддерживать параллельно покровному стеклу, позволяя визуализировать более старые боковые корни и первичные корни. Кроме того, базовую камеру формирования изображения можно легко настроить для гипокотилей. Гипокотилы более свободно плавают в этой системе, поэтому скобка для оси Z для получения изображения обычно увеличивается примерно до 20 мкм. В этом исследовании по всему периметру использовался вертикальный микроскоп, который позволял контролировать свойства субстрата. Камера формирования изображения может быть адаптирована к конфигурации инвертированного микроскопа, но необходимо будет оценить зависящее от времени влияние жесткого покровного стекла на перехватывающие органы. </p>
Литлджон и коллеги указали, что сам ПФО не легко растворяет биологические молекулы, а значит, он не может быть использован непосредственно для доставки фармакологических соединений 7 . Эта проблема была решена путем подачи таких соединений через плиту затвердевшей питательной среды, на которой лежит агарная плита. В то время как перфузионные системы остаются методом выбора для экспериментов по промыванию, камера формирования изображения успешно использовалась для введения дексаметазона 12 и других соединений. Одно замечание, в то время как эта статья была в стадии подготовки, фон Вагенхайм и его коллеги [ 18] описали камеру для визуализации развития боковых корней с использованием микроскопа с использованием листа.
The authors have nothing to disclose.
Мы благодарим профессора Джеффри Вастенайса, Университет Британской Колумбии, за семена, выражающего RFP-TUB6, и анонимного рецензента за полезные исправления. Мы благодарны профессору Хью Дикинсону за то, что он предупредил нас об использовании целлюлозной пленки в качестве механической опоры и Джона Бейкера для фотографии. Эта работа была поддержана исследовательскими грантами BBSRC BB / G013993 / 1 и BB / D004055 / 1 для IM, и Докторантурой обучения BBSRC и Стипендией Кларендона в CK
Perfluorodecalin | F2 Chemicals, F2 Chemicals Ltd., Lea Town, Lancashire, UK | FLUTEC PP6 | |
Poly(dimethylsiloxane) gum | Carolina Biological Supply; Burlington, NC, USA | Item # 132700 | Carolina Observation Gel |
Cavity Microscope Slides | VWR International Ltd, Lutterworth, UK | 10118-600 | Cavity is 13mm diameter and 0.2-0.4mm in depth. Any cavity slide will probably suffice |
Cyanoacrylate glue | Loctite | 604753 | Any 'super-glue' suitable for glass will probably suffice |
Cellulosic cellophane membrane | AA Packaging Limited, Preston, UK | 325P cellulose film; 80mm disc |