Este estudo descreve métodos para a co-expressão mediada por T7 de múltiplos genes de um único plasmídeo em Escherichia coli usando o sistema de plasmídeo pMGX.
A co-expressão de múltiplas proteínas é cada vez mais essencial para a biologia sintética, estudando complexos proteína-proteína e caracterizando e aproveitando os caminhos biossintéticos. Neste manuscrito, descreve-se o uso de um sistema altamente eficaz para a construção de operões sintéticos multigenes sob o controle de uma polimerase de ARN T7 induzível. Este sistema permite que muitos genes sejam expressos simultaneamente a partir de um plasmídeo. Aqui, um conjunto de quatro vetores relacionados, pMGX-A, pMGX-hisA, pMGX-K e pMGX-hisK, com o marcador selecionável por resistência à ampicilina ou kanamicina (A e K) e possuindo ou não uma hexahistidina N-terminal A tag (his) é divulgada. São fornecidos protocolos detalhados para a construção de operões sintéticos usando este sistema de vetores juntamente com os dados correspondentes, mostrando que um sistema baseado em pMGX contendo cinco genes pode ser facilmente construído e usado para produzir todas as cinco proteínas codificadas em Escherichia coli . Este sistemaEm e protocolo permite que os pesquisadores rotineiramente expressam módulos complexos de múltiplos componentes e caminhos em E. coli .
A co-expressão de múltiplas proteínas é cada vez mais essencial, particularmente em aplicações de biologia sintética, onde vários módulos funcionais devem ser expressos 1 ; No estudo dos complexos proteína-proteína, onde a expressão e função muitas vezes requerem co-expressão 2 , 3 ; E na caracterização e aproveitamento de caminhos biossintéticos, onde cada gene na via deve ser expresso 4 , 5 , 6 , 7 , 8 . Vários sistemas foram desenvolvidos para coexpressão, particularmente no organismo hospedeiro Escherichia coli , o cavalo de trabalho para a expressão de proteína recombinante em laboratório 9 . Por exemplo, múltiplos plasmídeos com diferentes marcadores selecionáveis podem ser usados para expressar proteínas individuais usando uma riqueza de diferentes ex Vetores de pressão 10 , 11 . Os sistemas plasmídicos únicos para expressão múltipla de proteínas utilizaram múltiplos promotores para controlar a expressão de cada gene 10 , 12 ; Operões sintéticos, onde múltiplos genes são codificados em uma única transcrição 2 , 13 ; Ou, em alguns casos, um único gene que codifica um polipéptido que é processado de forma proteolítica, produzindo as proteínas desejadas de interesse 14 .
Figura 1: fluxo de trabalho pMGX que mostra a construção de um vetor policristão. O sistema pMGX fornece uma estratégia flexível e fácil de usar para a construção de operões sintéticos sob o controle de um promotor T7 indutível.E.com/files/ftp_upload/55187/55187fig1large.jpg "target =" _ blank "> Clique aqui para ver uma versão maior deste número.
Neste manuscrito, é descrito o uso de um sistema altamente eficaz para a construção de operões sintéticos multigene sob o controle de uma ARN polimerase T7 indutível ( Figura 1 ). Este sistema permite que muitos genes sejam expressos simultaneamente a partir de um plasmídeo. É baseado em um sistema de plasmídeo, originalmente chamado pKH22, que foi utilizado com sucesso para várias aplicações diferentes 6 , 7 , 8 . Aqui, este conjunto de plasmídeo é expandido para incluir quatro vetores relacionados: pMGX-A, um vetor de expressão que não possui quaisquer marcas C ou N-terminal e com o marcador de resistência à ampicilina; PMGX-hisA, um vetor de expressão que codifica uma etiqueta de hexahistidina N-terminal e com o marcador de resistência à ampicilina; PMGX-K, um vetor de expressão lObtendo quaisquer tags C ou N-terminal e com o marcador de resistência à kanamicina; E pMGX-hisK, um vetor de expressão que codifica uma etiqueta de hexahistidina N-terminal e com o marcador de resistência à canamicina. Neste estudo, o método para a geração de um vetor policristão contendo cinco genes usando o sistema pMGX, especificamente pMGX-A, é demonstrado juntamente com a produção bem-sucedida de cada proteína individual em Escherichia coli .
A co-expressão de múltiplos genes é cada vez mais essencial, particularmente na caracterização e reconstituição das vias metabólicas complexas multigênicas 3 , 4 , 5 . O sistema pMGX faz co-expressão multigene na rotina 6 , 7 , 8 de E. coli e acessível a diversos pesquisadores. Neste estudo, mostraram-se cinco prote…
The authors have nothing to disclose.
Este trabalho foi apoiado pelo Conselho de Pesquisa em Ciências Naturais e Engenharia do Canadá.
Enzymes | |||
Alkaline Phosphatase, Calf Intestinal (CIP) | New England Biolabs | M0290S | |
AvrII | New England Biolabs | R0174S | |
EcoRI | New England Biolabs | R0101S | |
NdeI | New England Biolabs | R0111S | |
XbaI | New England Biolabs | R0145S | |
Herculase II Fusion DNA Polymerase | Agilent Technologies | 600677 | |
T4 DNA Ligase | New England Biolabs | M0202S | |
Name | Company | Catalog Number | Comments |
Reagents | |||
1 kb DNA ladder | New England Biolabs | N3232L | |
4-20% Mini-PROTEAN TGX Stain-Free Protein Gels | Bio-Rad | 456-8095 | |
50 x TAE | Fisher Thermo Scientific | BP1332-4 | |
Agar | Fisher Thermo Scientific | BP1423-500 | |
Agarose | Fisher Thermo Scientific | BP160-500 | |
Ampicilin | Sigma-Alrich | A9518-5G | |
BL21 (DE3) chemically comeptent cells | Comeptent cell prepared in house | ||
B-PER Bacterial Protein Extraction Reagent | Fisher Thermo Scientific | PI78243 | |
dNTP mix | Agilent Technologies | Supplied with polymerase | |
Gel Extraction Kit | Omega | D2500-02 | E.Z.N.A Gel Extraction, supplied by VWR Cat 3: CA101318-972 |
Glycine | Fisher Thermo Scientific | BP381-1 | |
His Tag Antibody [HRP], mAb, Mouse | GenScript | A00612 | |
Immobilon Western Chemiluminescent HRP Substrate | EMD Millipore | WBKLS0100 | |
IPTG | Sigma-Alrich | 15502-10G | |
LB | Fisher Thermo Scientific | BP1426-500 | |
Methanol | Fisher Thermo Scientific | A411-20 | |
Pasteurized instant skim milk powder | Local grocery store | No-name grocery store milk is adequate | |
Nitrocellulose membrane | Amersham Protran (GE Healthcare Life Sciences) | 10600007 | Membrane PT 0.45 µm 200 mm X 4 m, supplied by VWR Cat #: CA10061-086 |
Plasmid DNA Isolation Kit | Omega | D6943-02 | E.Z.N.A Plasmid DNA MiniKit I, supplied by VWR Cat #: CA101318-898 |
pMGX | Boddy Lab | Request from the Boddy Lab Contact cboddy@uottawa.ca | |
Primers | Intergrated DNA Technologies | Design primers as needed for desired gene | |
Synthetic Gene | Life Technologies | Design and optimize as needed | |
Thick Blot Filter Paper | Bio-Rad | 1703932 | |
Tris base | BioShop | TRS001.1 | |
Tween-20 | Sigma-Alrich | P9416-50ML | |
XL1-Blue chemically competent cells | Comeptent cell prepared in house | ||
Name | Company | Catalog Number | Comments |
Equipment | |||
BioSpectrometer | Eppendorf | RK-83600-07 | |
Gel box – PAGE | Bio-Rad | 1658005 | Mini-PROTEIN Tetra Vertical Electrophoresis Cell |
Gel Imager | Alpha Innotech | AlphaImager EC | |
Incubator-oven | Fisher Thermo Scientific | 11-690-650D | Isotemp |
Incubator-shaker | Fisher Thermo Scientific | SHKE6000-7 | MaxQ 6000 |
Personna Razors | Fisher Thermo Scientific | S04615 | |
Power Pack | Bio-Rad | S65533Q | FB300 |
Transilluminator | VWR International | M-10E,6W | |
Thermocylcer | Eppendorf | Z316091 | Mastercycler Personal, supplied by Sigma |
UV Face-Shield | 18-999-4542 | ||
Waterbath | Fisher Thermo Scientific | 15-460-2SQ | |
Western Transfer Apparatus | Bio-Rad | 1703935 | Mini-Trans Blot Cell |