This manuscript describes a simple method to measure the phagosomal pH and area as well as the cytoplasmic pH of human and mouse neutrophils using the ratiometric indicator seminaphthorhodafluor (SNARF)-1, or S-1. This is achieved using live-cell confocal fluorescence microscopy and image analysis.
נויטרופילים הם קריטיים לארח הגנת מולד, וכתוצאה מכך, מהווים תחום חשוב של מחקר רפואי. Phagosome, התא התאי שבו ההרג והעיכול של חלקיקים הציפו להתקיים, הוא הזירה העיקרית הרג הפתוגן נויטרופילים הדורש רגולציה הדוקה. Phagosomal pH הוא היבט אחד כי נשלט בקפידה, בתורו מסדיר פעילות הפרוטאז מיקרוביאלית. רבים ניאון צבעי pH רגיש שימשו כדי להמחיש את הסביבה phagosomal. יש S-1 מספר יתרונות על פני צבעי pH אחרים רגיש, כוללים ספקטרום הפליטה הכפול שלה, עמידותו-הלבנת תמונה, ואת pKa הגבוהה שלה. באמצעות שיטה זו, אנו הוכחנו כי phagosome נויטרופילים הוא אלקליין חריג בהשוואת פגוציטים אחרים. באמצעות הטיות ביוכימיים שונים של הצבע, phagosome ניתן שמסומן מן הציטופלסמה כך ששינויים בגודל ובצורה של phagosome ניתן להעריך. זה מאפשר Fאו ניטור נוסף של תנועה יונית.
נויטרופילים הם תא החיסון המולד בשכיחותו בגוף. תפקידה העיקרי שלו מורכב המסיירים הדם ואת ומלטפות, מעכלים את החלקיקים הזרים כי היא עשויה להיתקל בתהליך המכונה phagocytosis 1, 2. החלקיקים מפורקים בתא של תאיים שנקרא phagosome. הפעלת האנזים מונואמין NADPH נויטרופילים, את NOX2 איזופורם, יוזם מפל של תגובות ביוכימיות המסתיימת במותו של הפתוגן. יחידות משנה חלבון NOX2 להמשיך לגבש מורכבת שרשרת העברת אלקטרונים בקרום phagosomal 3. לאחר הפעלה, זה מעביר אלקטרונים מן NADPH דרך הממברנה לחמצן מולקולרי בתוך phagosome, הפקת אניוני דיסמוטאז ומיני חמצן תגובתי נוספת. תופעה זו ידועה בשם פרץ הנשימה, והוא נחשב חיוני הרג חיידקים יעיל בעיכול 2 </sup>. עם זאת, תנועה בלעדית זו של מטען שלילי על פני הקרום שבקרוב להשבית NOX2 אם זה לא יפוצה על ידי מטען חיובי נעים ו / או מטען שלילי נע מתוך phagosome. זה הוכח גם כי הרוב המכריע של פיצוי תשלום נויטרופילים מתבצע על ידי ערוץ הפרוטון 4 HVCN1, 5. ערוץ זה מאפשר תנועה פסיבית של פרוטונים לאורך שיפוע אלקטרוכימיים שלהם מן cytosol לתוך phagosome. ריכוז Proton משתקף על ידי pH, כך על רמה מסוימת של פעילות אנזים מונואמין, מדידת pH של phagosome יכול לספק מידע על ההשתתפות היחסית של מסלולי protonic ולא protonic כפיצוי תשלום.
Phagosome נויטרופילים האנושי יש pH בסיסי של כ 8.5 עבור 20-30 דקות לאחר phagocytosis 5. זה מרמז על קיומו של תעלות יונים הלא-פרוטונים נוספים NOX2-induced פיצוי תשלום, כמו פיוז'ן ושחרור תכולתו של גרגרי חומצי ופיצוי בלעדי ידי HVCN1 ישמור בסביבת חומצית, בניגוד לזה שנצפה. התנועה של יונים לפצות מטען שלילי זה עשוי גם להפעיל שינויים בגודל phagosome באמצעות אוסמוזה. יונים יכול להיות אלה הנמצאים נויטרופילים בריכוזים פיסיולוגיים גבוהים: יוני אשלגן הוכחו לנוע לתוך phagosome 6, ותנועה יונית כלוריד היא עוד מועמד חשוב נויטרופילים פונקציה 7.
הסדרת pH של phagosome חיונית עבור פעילות הפרוטאז מיקרוביאלית 5. Myeloperoxidase (MPO) נראה שיש פעילות אופטימלית ב- pH 6, בעוד שעבור cathepsin G ו אלסטט, רמות אופטימליות הן pH 7-9 ו pH 8-10, בהתאמה 5. לכן, שינוי חולף ב pH phagosomal עשוי לספק נישות פעילות אנזימים שונים כיףction. הבנה כיצד pH מעורב בהרג חיידקים נויטרופילים עשויה לספק מידע שימושי עבור העיצוב של סוכני מיקרוביאלית רומן משלים-נויטרופילים.
Phagosome נויטרופילים היא סביבה מאוד תגובתי. זה עושה את זה קשה להעריך במדויק pH, בגלל צבע ניתן חמצון בקלות, מה שמוביל חפצים טכניים. מבחינה היסטורית, isothiocyanate והעמסת (FITC) כבר צבע של בחירה למדוד תאיים pH 8, 9. עם זאת, יש כמה חסרונות לשימוש שלה במדידת pH נויטרופילים phagosomal. יש לה pKa של 6.4 10, מה שאומר שזה יכול במדויק רק לשמש כדי להעריך את רמות מה PH 5 עד 7.5 8, כמו מרווה ב- pH <8 11. כמו pH נויטרופילים phagosomal יכול להיות הרבה יותר אלקליין 5, FITC לא יכול ללכוד מגוון רחב של שינויים pH פוטנציאל. Signifi נוספתהבעיה צביעות עם FITC בהקשר של נויטרופילים היא שזה נחשב להיות photobleached ידי MPO 12. מעכב MPO, יזיד הנתרן, יכול לשמש כדי להגביל photobleaching 13, אבל זה הוכח כי יזיד הנתרן ישירות מוריד את רמת חומציות phagosomal באופן MPO עצמאי ולכן היא בלתי הולמת לשימוש מבחנים כגון 5.
לעומת צבעי תאיים אחרים, S-1 יש pKa גבוה יחסית של 7.5 10. בתנאים חומציים, המולקולה היא protonated ומייצרת אות פליטה בין 560 ו 600 ננומטר כאשר נרגש על 488 ננומטר ומעלה. כאשר המולקולה היא deprotonated בלמעלה תנאי בסיסי, גל הפליטה נגמר 600 ננומטר. יחס של עוצמות הקרינה בשני אורכי גל אלה מצביע על שינוי הפליטה, המהווה יותר הוא אמין יותר מאשר מדידות קרינה יחידות, כפי שהוא אינו מושפע על ידי ריכוז fluorophore ואת מבנה תא. S-1 ניתן מצומדות חומר אנטיגני, כגון zymosan 14, אם כי-הרג חום (HK) קנדידה אלביקנס היא מועדף, שכן שטח הפנים הגדול יותר נותן קריאת קרינה עקבית יותר.
השתמשנו גם שינוי של השיטה בחקר שינויים זמניים ב pH (איור 3) 5. שיטה זו למדידת pH cytosolic ניתן ליישם בקלות סוגי תאים אחרים, כמתואר במקום אחר 15, 16, ו תאים עם phagosomes אלקליין יותר 14.
Once the appropriate reagents, microscope settings, and calibration experiments are set up, this method is relatively simple to perform. The critical steps include: labeling the Candida with S-1 to ensure that there is no overloading of the dye, calibrating, and analyzing the image.
S-1 is a reagent suited to more alkaline pH environments, which is particularly important for neutrophils21 but limits its use in certain cell types. For more acidic environments, such as macrophage phagosomes, SNARF-4, or S-4, is more suitable because of its lower pKa22. Moreover, for more accurate cytoplasmic readings, it is better to use S-4, as the standard curve for S-1 shows that fluorescence ratios begin to plateau below pH 6 (Figure 3). Other dyes, such as 2',7'-Bis-(2-Carboxyethyl)-5-(and-6)-Carboxyfluorescein (BCECF) or pHrodo Red may also be more suitable in a context that is expected to be acidic. Yet the cytoplasm staining is still necessary for correct identification of the phagosomes containing Candida.
An important feature of a phagosomal pH indicator is that it is not irreversibly altered by the reactive phagosomal environment. S-1 seems to be resistant to the neutrophil milieu. This is shown by Levine et al.5 (see Supplementary Video 4 of reference5) which demonstrate the phagocytosis and subsequent release of an S-1-labeled Candida particle by an Hvcn1-/- neutrophil. When phagocytosed, the particle turns from yellow/orange to red (neutral to alkaline pH), but when the particle is released by the neutrophil, it returns to its original color.
It is important to mention some of the limitations associated with using S-1. The fact that this dye has two emission spectra allowing ratiometric measurement is an advantage, but specialist equipment is needed to acquire images; the microscope used for the experiments must be able to record two images simultaneously or with an insignificant time delay. The authors assume that the researcher attempting this protocol has experience using confocal microscopy, or has access to a trained professional. We cannot list all the specific microscope parameters as they will differ for each microscope and need to be optimized by the researcher. The acetoxymethyl ester conjugated to S-1 that allows the dye to diffuse into the cell cytoplasm is degraded by non-specific esterases in the cell cytoplasm to form the fluorescent molecule. Esterases, such as alkaline phosphatase, are present in human serum and fetal bovine serum, which are used to supplement cell culture media. Accordingly, the medium in which the cells are loaded with S-1-AM (section 4.5) must not contain serum. This may prove challenging if using cells that require a more nutrient-rich medium to sustain them than the balanced salt solution used throughout this protocol. Similarly, other fluorescent medium components, such as phenol red, may interfere with S-1 measurements.
The error bars in Figure 3 indicate that there is some variation in the ratio measurements at each pH. A suitable number of repeats of each experiment (at least n = 3) and as many individual measurements in each single experiment are needed to overcome the inter-vacuolar variation. It is thus advisable to measure the pH of at least 100 phagosomes for each condition and as many phagosomal areas that appear to contain only one Candida. The phagosomes to be measured for quantitation should be those that have completely engulfed a Candida particle (i.e., those completely surrounded by cytoplasm). To mitigate against unintentional biases in the selection of cells/phagosomes for quantitation, all analyses should be performed while blind to the experimental conditions.
Here, we describe the isolation of neutrophils by dextran sedimentation of whole blood followed by centrifugation of the plasma layer through a density gradient. We use this technique as it quickly and efficiently produces a pure (>95%) population of neutrophils, although there are other methods available, such as whole blood centrifugation through other density gradient formulas or negative selection of neutrophils using specialist kits with antibodies or magnetic beads. However, the latter can be prohibitively expensive for most groups who isolate neutrophils routinely. In addition, we use the anticoagulant heparin in the blood-collecting tube, whereas other researchers may be more accustomed to using ethylenediaminetetraacetic acid (EDTA) or acid citrate sodium (ACD). As there are many different methods to choose from, it is up to the personal preference of the researcher.
Furthermore, when isolating and manipulating neutrophils they should be handled with some care to avoid excessive activation. Precautionary steps include: only using plastic ware, no glass; filter-sterilize all buffers to remove any contaminating endotoxin; when spinning neutrophils make sure the centrifuge is well balanced to avoid excessive vibrations; limit as much as possible the time neutrophils remain in a pellet after centrifugation; do not maintain neutrophils in solution of more than 5 x 106/mL; and perform the experiment as soon as possible after isolation.
This method can be adapted to measure changes in the pH and phagosomal area over time by using a heated stage set to 37 °C on the microscope and taking snapshots once every 30-60 s from the same position, as described for the calibration steps. It could also theoretically be adapted for higher-throughput experiments, such as in 96-well plates, and for flow cytometry experiments, where S-1 can be used as a pH indicator23. However, in these settings, the emphasis on individual cell activity is replaced by a more global effect on the cell population.
This method aims to provide a relatively simple experimental setup upon which individual researchers can adapt to suit their area of interest. Researchers may want to explore neutrophil phagosomal pH and area whilst also measuring movement of other ions, for example, intracellular calcium concentration. There are several fluorescent Ca2+ indicators readily available for confocal microscopy, such as Indo-1, which also has dual emission spectra at 400 and 475 nm24. These emission wavelengths do not overlap with S-1 emission spectra, but the excitation wavelength is at the ultraviolet (UV) end of the spectrum, which can be damaging to cells, and a UV laser is not commonplace on all microscopes. A comprehensive review of the different indicators to measure intracellular calcium flux is covered by Takahashi et al.25 and Hillson et al.26.
In conclusion, there are other methods available to measure phagosomal pH using different fluorescent dyes as Nunes et al. have demonstrated13 as well as other groups27,28. Other researchers have also used S-1 to measure cytosolic pH29 or phagosomal pH14. However, this protocol is unique in measuring simultaneously the pH of both cytosol and phagosome, which provides the opportunity to observe changes in phagosomal cross-sectional area and to distinguish between wildtype and Hvcn1-/- mouse neutrophils, and human neutrophils with and without a working NADPH oxidase.
The authors have nothing to disclose.
This work was kindly funded by the Wellcome Trust, the Biotechnology and Biological Sciences Research Council, and the Irwin Joffe Memorial Fellowship.
Candida albicans ATCC 10231 Vitroids 80 CFU | Sigma-Aldrich | RQC14003-10EA | Place directly on a spread agar plate according to the manufacturer's instructions |
YPD broth | Sigma-Aldrich | Y1375 | Follow manufacturer's instructions, various providers exist |
Dextran Clinical grade MW = 200,000-300,000 | MP Biomedicals | 2101514 | Use gloves |
Heparin Sodium solution for infusion (preservative free), 1,000IU/ml | Fannin, Wockhardt UK Ltd | FP1077 | We purchased from UCH inpatient pharmacy |
SNARF-1 Carboxylic Acid, Acetate, Succinimidyl Ester – Special Packaging | Thermo Scientific/Invitrogen | SS22801 | Use gloves |
5-(and-6)-Carboxy SNARF-1, Acetoxymethyl Ester, Acetate | Thermo Scientific/Invitrogen | C1272 | Use gloves |
Vivaglobin human IgG 160mg/ml solution | CSL Behring | received as a gift | Various providers exist |
Normal mouse serum | Abcam | ab7486 | Various providers exist |
Lymphoprep (density gradient medium) | Alere Ltd | 1114547 | Keep sterile and away from direct sunlight, can be substituted by Ficoll-Paque |
Nigericin | Sigma-Aldrich | N7143 | Toxic, use gloves, various providers exist |
Saponin | Sigma-Aldrich | 47036 | Toxic, use gloves, various providers exist |
Dimethyl sulphoxide (DMSO) | Sigma-Aldrich | D8418 | Toxic, use gloves, various providers exist |
4-(2-Hydroxyethyl)piperazine-1-ethanesulfonic acid (HEPES) | Sigma-Aldrich | H3375 | Various providers exist |
Tris(hydroxymethyl)aminomethane (Tris) | Sigma-Aldrich | T1503 | Various providers exist |
Potassium chloride (KCl) | Sigma-Aldrich | P9333 | Various providers exist |
Sodium chloride (NaCl) | Sigma-Aldrich | S7653 | Various providers exist |
Magnesium chloride (MgCl2) | Sigma-Aldrich | M8266 | Various providers exist |
Magnesium sulphate (MgSO4) | Sigma-Aldrich | M7506 | Various providers exist |
Potassium dihydrogen phosphate (KH2PO4) | Sigma-Aldrich | P9791 | Various providers exist |
Calcium chloride (CaCl2) | Sigma-Aldrich | C1016 | Various providers exist |
Glucose | Sigma-Aldrich | D9434 | Various providers exist |
Absolute Ethanol | Sigma-Aldrich | 2860 | Various providers exist |
Diphenylene iodonium (DPI) | Sigma-Aldrich | D2926 | Various providers exist |
Zinc chloride | Sigma-Aldrich | 208086 | Various providers exist, do not dilute in phosphate based buffers as it will precipitate |
Poly L lysine | Sigma | P4707 | Various providers exist |
Laser scanning confocal microscope (Zeiss LSM 700) | Carl Zeiss | The microscope must be able to excite at 555nm and measure emission at two channels simultaneously (560-600nm, >610nm) | |
Ibidi µ slide 8 well ibiTreat | Thistle Scientific | IB-80826 | Other appropriate imaging dishes can be substituted |
Fluorodish Cell Culture Dish-35mm, 23mm well | World Precision Instruments | FD35-100 | Other appropriate imaging dishes can be substituted, different sizes are available |
Soniprep 150 | MSE | Any appropriate sonicator will suffice | |
TC20 Automated Cell Counter | BioRad | Various providers exist | |
1.5ml Protein LoBind Tubes | Sigma-Aldrich | Z666505-100EA | Specially used as Candida can stick to normal eppendorfs |