sheathless多孔チップインタフェース設計を使用してキャピラリー電気泳動 – 質量分析法による生体試料の代謝プロファイリングのためのプロトコルが提供されます。
メタボロミクスは、分析技術の広い範囲は、複雑なサンプル中の(内因性)代謝物のグローバルなプロファイリングのために使用されます。この論文では、プロトコルは、キャピラリー電気泳動 – 質量分析(CE-MS)により、生体試料中のアニオン性およびカチオン性代謝物の分析のために提示されています。化合物は、それらの電荷対サイズ比に基づいて分離されるCEは、高極性および荷電代謝物の分析に適しています。最近開発sheathlessインターフェース設計、 すなわち、多孔質先端インターフェイスは、イオン化(ESI)MSをエレクトロするCEを結合するために使用されます。このインターフェースアプローチは、極性代謝物クラスの広い範囲のためのナノモル検出限界で、その結果、MSと組み合わせたCEの本質低流動性を有効に利用することができます。ここに提示プロトコルは、分析のために低pH分離条件で多孔質先端エミッタと裸の溶融シリカキャピラリーを使用するに基づいています生体試料中の代謝物クラスの幅広いです。同じsheathlessのCE-MS法のみMS検出を切り替えることにより、糖リン酸、ヌクレオチドおよび有機酸を含むアミノ酸、ヌクレオシド、および小ペプチド、またはアニオン性代謝物を含むカチオン性代謝産物のプロファイリングのために使用することができることが実証され分離電圧極性。尿、脳脊髄液、および神経膠芽腫細胞株の抽出物などの様々な生物学的試料中の非常に情報豊富な代謝プロファイルは、CE-MS分析の1時間未満で、このプロトコルによって得ることができます。
現代のメタボロミクスにおいて、ハイエンド分析分離技術は、生体1の生理学的状態の代表的な読出しを得るために代謝産物クラスの広い範囲を分析するために使用されます。メタボロミクス研究の究極の目的は、所定の生物学的/臨床の質問への答えを得ることです。現時点では、ヒューマン・メタボローム・データベースは、内因性および外因性の両方の化合物を表す40,000以上の代謝産物のエントリ(栄養素、微生物、薬物および他のソースから後者の発信)2から構成されています。物理化学的性質とこれらの代謝産物の濃度範囲で大きな多様性を考えると、異なる分離メカニズムを有する複数の分析技術は、所与の生物学的試料中のできるだけ多くの代謝産物をプロファイルするために一緒に使用されるべきです。例えば、Psychogios らは、代謝の教授のための5つの分析分離技術の組み合わせを使用しました4,000人以上の化学的に多様な代謝物3の検出結果としてヒト血清のiling。
本論文では、注意が生物学的試料4,5の代謝プロファイリングのために最近開発されたCE-MSの戦略に支払われます。 CEは、より具体的には、キャピラリーゾーン電気泳動(CZE、通常CEと称する)は、化合物は、従って、この分析法は、極性および荷電した代謝物の分析のために非常に適している、それらの電荷対サイズ比に基づいて分離されています。 CEの分離機構により生物学的試料6-8の代謝組成物に相補的なビューを提供し、クロマトグラフィーに基づく技術とは根本的に異なっています。曽我および共同研究者は、生物学的サンプル9,10中の代謝物の世界的プロファイリングのためのCE-MSの有用性を示すために最初でした。今までは、メタボロミクスのためのCE-MSの実現可能性と有用性が広く11-15を実証されています。CEは、一般的にシース液のインタフェース技術16,17を介してMSに結合されています。しかしながら、シース液による毛細管流出物の希釈のために、検出感度を本質的に損なわれています。
最近、それは古典的なシース液界面5,18,19を用いた CE-MSに比べてsheathlessインタフェースの使用が大幅に様々な生物学的サンプル中に存在する代謝物の検出範囲を改善することが示されました。約300の分子機能はシース液CE-MS 5で観察したのに対し、例えば、900年頃分子の機能はsheathless CE-MSによるヒト尿中に検出されました。使用sheathlessインタフェースは、ナノESI-MSと組み合わせたCEの本質低流動性の効果的な使用を可能にする、Moini 20によって発明された多孔質先端エミッタ、に基づいていました。
メタボロミクスの分野でsheathless CE-MSの使用を促進するために、プロトコルは、神経膠芽腫細胞株からの抽出物の分析のために例示されるように、このアプローチは、生物学的サンプル中の高極性代謝物の分析のために使用することができる方法を説明提示されます。陽イオン性代謝物プロファイリングのためsheathless CE-MS法は、また、それによって、分析時間を短縮し、グローバルプロファイリングに単一の分析プラットフォームを提供し、正確に同一の毛細管及び分離条件を使用して、アニオン性代謝物プロファイリングのために使用することができることが示されています帯電した代謝物。プロトコルは、MS機器とsheathless多孔質先端エミッタの効果的な位置合わせのための戦略を説明します。
多孔質先端エミッタを用いsheathless CE-MS法は、高極性および荷電代謝物の分析のために提示されています。このアプローチの独特な特徴は、アニオン性またはカチオン性の代謝物のみMS検出およびCE電圧の極性を切り替えることによってプロファイリングすることができることです。生体試料中の高極性および荷電代謝物の広い範囲を構造的に類似した代謝物のために重要である、と(低い)ナノモル範囲の検出限界と高い分離効率で分析することができます。提示されたプロトコルは、生体試料の代謝プロファイリングのための方法の有用性を例示するために、細胞抽出物の代謝プロファイリング用sheathless CE-MSの使用に焦点を当てました。ここで説明するアプローチは、適切なサンプル前処理手順が使用されていることを考えると、そのようなヒト尿5のような生物学的サンプルの他のタイプの代謝プロファイリングのために使用することができます。
sheathlessのCE-MSメトdはCEの本質低流動性の利用を可能にする多孔質の先端エミッタに基づいています。この文脈において、安定したESI信号が再現可能な代謝プロファイリング研究のための前提条件です。したがって、噴霧器の先端が適切にMS入口の前に配置されることが重要です。このセットアップでは、ESIプロセスは、BGEの性質に主に依存しているため、BGEの最適化が重要です。 sheathless構成は、シース液の組成物のすべての種類のイオン化効率を向上させるために添加することができ、シース液CE-MSシステムと比較してあまり汎用性です。 sheathless ESI噴霧器の針が完全に導電性液体( すなわち 、BGE液)で満たされる必要があります。不安定なESI信号は、部分的または完全に差し込ま毛細血管から生じ得ます。 BGEと高い圧力ですすぎすると、この問題を解決することができます。そうでなければ分離キャピラリーを交換する必要があります。分析性能の評価に先立って、安定したESIのバックグラウンド信号1日から別の一致している最初に生成する必要があります。
代謝プロファイリング研究のためsheathless CE-MS法の分析性能は、代謝産物の標準混合物を用いて毎日チェックする必要があります。同じ実験条件の下では、一貫性の移動時間、 すなわち、内-日の3%以下の変化(N = 10)との間の日(n = 5)で、ピークを代謝物の標準混合物(12.5μM)の20 nlの注入を使用して、 (60,000 400,000の間の範囲)の高さ/地域(15%以下の変動)とプレート番号が得られるはずです。検出限界は、ほとんどの代謝物の規格に対してナノモルの範囲でなければなりません。これらの基準が満たされた場合にのみ、生物学的サンプルの代謝プロファイリングのために準備する方法です。そうでない場合、MS機器は、調整されて再較正される必要があるか、多孔性チップキャピラリーエミッタは変更する必要があります。
CE-MS分析の間の効果的なすすぎ工程がないだけに、非常に重要です潜在的なキャリーオーバーを防止するだけでなく、分離性能を維持します。キャリーオーバーの可能性は、サンプルで汚染されたので、新しいBGEバイアルと交換することで解決BGEバイアルによって引き起こされることがあります。 sheathless CE-MS法を使用しない場合には、分離キャピラリーを切断するために、水に毛細管と、毛細管寿命を延ばすために、水を含むチューブで保護スリーブを有する浸漬外部の入口側を格納することが重要です。
要約すると、提案されたsheathlessのCE-MS法は、このプロトコルで報告された手順に従って使用される生物学的サンプルの代謝プロファイリングのための大きな可能性を示しています。この段階では、相互実験室の比較データは間違いなくメタボロミクスのためのこのアプローチの(長期)再現性および頑健性を評価するためにsheathless CE-MSのために必要とされます。このプロトコルは、このような研究を刺激することができます。様々な分析課題はまだ検討する必要があります。最適なPERFのためormanceは、CEの電流は、好ましくは5μA以下に維持すべきであり、この段階で、キャピラリーの多孔性チップのエミッタのみハイスループットアッセイの開発を妨げることができる91センチの長さで設けられています。また、低pH分離緩衝液は、構造的に関連する糖リン酸のベースライン分離を達成するために最適ではないかもしれないアニオン性、代謝プロファイリングのために使用しました。また、重要な(部分的に)負に用いる分離条件下で荷電されている唯一のアニオン性代謝産物を分析することができることです。次のステップは、現在臨床代謝プロファイリング研究のためsheathless CE-MS法の有用性を評価することで、単一の多孔質先端キャピラリエミッタは、最大100の生物学的試料の分析のために使用することができます。
sheathlessのCE-MS法は、s内の生物学的機能のより深い理解に向けて、すなわち 、メタボロミクスの分野で新たな方向が開かれますが全体的に、さらなる発展十分な制限例。
The authors have nothing to disclose.
Dr. Rawi Ramautar would like to acknowledge the financial support of the Veni grant scheme of the Netherlands Organization of Scientific Research (NWO Veni 722.013.008).
CESI 8000 instrument | Sciex | A98089 | OptiMS adapter required to couple CESI to MS |
OptiMS Fused-Silica Cartridge, 30 μm ID x 90 cm total length | Sciex | B07367 | |
OptiMS Adapter for Sciex Nanospray III source | Sciex | B07363 | |
CESI vials | Sciex | B11648 | |
Micro vials | Sciex | 144709 | |
Glacial acetic acid | Sigma | A6283 | Use in fume hood |
Cationic metabolite mixture | Human Metabolome Technologies | H3304-3034 | |
Anionic metabolite mixture | Human Metabolome Technologies | H3304-1031 | |
Methanol (LC-MS Ultra Chromasolv) | Sigma | 14262 | Use in fume hood |
Sodium hydroxide solution | Sigma | 72079 | 0.1 M |
U-87 MG Glioblastoma cell line | Sigma | 89081402 | |
Chloroform | Sigma | 650498 | Toxic; use in fume hood |