Summary

迅速なワンステップ酵素合成とトレハロース類似体のすべての水精製

Published: February 17, 2017
doi:

Summary

Trehalose analogues are emerging as important molecules for bio(techno)logical and biomedical applications. We describe an optimized protocol for enzymatically synthesizing and purifying trehalose analogues that is simple, efficient, fast, and environmentally friendly. Its application to the rapid production and administration of a probe for the detection of mycobacteria is demonstrated.

Abstract

化学的に修飾されたトレハロースのバージョン、またはトレハロース類似体は、他の分野の中で、生物学、バイオテクノロジー、および製薬科学の用途を有します。例えば、検出可能なタグを有するトレハロースアナログは結核菌を検出するために使用されており、結核診断用造影剤としての用途を有することができます。トレハロースの加水分解的に安定したバージョンはまた、ノンカロリー甘味料およびbioprotective剤としての使用のためのそれらの潜在的に追求されています。様々なアプリケーションのための化合物のこのクラスの魅力にもかかわらず、彼らの可能性は、それらの製造のための強固なルートがないために満たされていないままです。ここでは、化学合成に関連する問題を回避トレハロース類似体の迅速かつ効率的な一段階の生体触媒合成のための詳細なプロトコルを報告します。 サーモテナックスから耐熱性トレハロースシンターゼ(TRET)酵素を利用することにより、トレハロースアナログはgeneratすることができグルコース類似体および15から60分で(定量的変換まで)高い収率でウリジン二リン酸グルコースから一工程で編。スピン透析とイオン交換で構成されて簡単かつ迅速な非クロマトグラフィー精製プロトコルは、わずか45として分で水溶液中の濃度が既知の多くのトレハロースの類似体を提供することができます。未反応のグルコース類似体が残る場合には、トレハロースアナログ生成物のクロマトグラフィー精製を行うことができます。全体的に、この方法は効率的で、非化学者にアクセス可能であるトレハロース類似体の迅速合成および精製のための「グリーン」生体触媒のプラットフォームを提供します。この方法の適用を例示するために、我々は、合成、すべての水精製、および1時間未満とマイコバクテリアの有効蛍光検出を取ったそのすべてがマイコバクテリアのトレハロースベースのクリック化学プローブの投与のためのプロトコルについて説明します。今後は、OTHの中で、ということを想定しますERアプリケーションは、このプロトコルは、結核の診断のためのトレハロースベースのプローブの迅速な合成に適用することができます。例えば、短寿命放射性核種修飾トレハロースアナログ( 例えば 、18 F修飾トレハロース)は、陽電子放出断層撮影、コンピュータ断層撮影法(PET-CT)などの高度な臨床イメージング様式を使用することができます。

Introduction

トレハロースは、1,1-α、αグリコシド結合( 図1A)によって結合された2つのグルコース部分からなる対称な非還元性二糖類です。トレハロースは、ヒトおよび他の哺乳動物には存在しないが、それは、細菌、真菌、植物、無脊椎動物1に一般的に見出されます。ほとんどの生物におけるトレハロースの主な役割は、乾燥1などの環境ストレスから保護することです。また、いくつかのヒト病原体は、細胞エンベロープ生合成のメディエーターとしておよび免疫脂質2の構築のためのビルディングブロックとしてトレハロースを用いる結核を引き起こす結核菌を含む、毒性のためにトレハロースを必要とします。

図1
図1: トレハロースとトレハロース類似体。 (Xは構造的な変更であり、天然トレハロースと不自然なトレハロースアナログの)構造。 (B)バイオプリザベーションとバイオイメージングにおける潜在的なアプリケーションを持っている文献に報告トレハロースアナログの例を。

、そのユニークな構造と生理機能に、トレハロースは、バイオ(テクノ)で使用するための論理的および生物医学的応用3を大きな注目を集めています。 nature- 例えばで観察されたトレハロースの保護特性は、その印象的な能力は4 -haveはバイオプリザベーション・アプリケーションでその広範な使用に拍車をかけ極度の脱水を受けた"復活"植物の生活を維持するのに役立ちます。トレハロースは、核酸、タンパク質、細胞、および組織3のような生物学的サンプルの広い配列を保存するために使用されてきました。例えば、トレハロースは、医薬品tの数で安定化添加剤として使用されています帽子は3いくつかの抗癌モノクローナル抗体を含む、市販されています。同様に、トレハロースは、食品業界で甘味料として使用され、それが広く両方食品および化粧品産業における製品の保存のために使用されます。商用アプリケーションのこれらの種類のトレハロースの採用は、当初、天然の供給源から、または合成により純粋なトレハロースの大量を得ることができないことによって制限されていました。しかしながら、澱粉からトレハロースの経済的な生産のための効率的な酵素的方法は、最近、広範な商業的使用に拍車をかけている、開発されています 5。

図1Aに示される一般構造、 図1(b)に示すトレハロース類似体の具体例)化学トレハロース類似体と呼ぶ、トレハロース誘導体を改変、様々な用途にますます注目を集めている6。例えば、ラクトトレハロース、ガラクトースで置き換え、そのグルコース単位のいずれかのトレハロースアナログであり、従って、その4位のヒドロキシル基が反転立体化学構成を有しています。ラクトトレハロースはトレハロースと同様の安定化特性を有するが、ノンカロリー食品添加物6,7などが魅力的、腸の酵素による分解に耐性です。

トレハロース類似体における当社グループの持分は、主にマイコバクテリア特異的プローブおよび阻害剤としてのそれらの値に関係します。バリーとデイビス基は蛍光顕微鏡8によりその検出を可能にする、生結核菌の細胞壁を標識代謝することが示されたFITCケトトレハロース命名フルオレセイン共役ケトトレハロースアナログを開発しました。ベルトッツィラボは、代謝、細胞壁にラベルを付け、その後DET可能性が小さいアジドトレハロース(TreAz)類似体を開発しましたクリック化学と蛍光分析9を使用してected。これらの進歩は、結核のための画像診断剤としてトレハロースベースのプローブを使用する可能性を指します。トレハロース類似体はまた、生存率および病原10、11、12のために必須である細菌で経路を破壊するために、それらの潜在的に結核菌の阻害剤として追求されてきました。

これまで、バイオ(テクノ)論理及び生物医学的用途のためにトレハロースアナログを開発する主な障害は、効率的な合成方法がないことです。トレハロースの類似体を製造するには2つの伝統的なルートは、化学合成( 図2)に依存しています。他が適切に官能単糖ビルディングブロックで始まり、に化学的グリコシル化を実行する必要が、一方の経路は、天然トレハロースの非対称化/変更を伴います1,1-α、αグリコシド結合を築きます。最近の総説13、14で議論されてきたこれらのアプローチは、 結核菌 15からそのようなスルホ脂質-1のような複雑なトレハロース含有天然物、少量の多段階合成を達成するために有用であることが判明しました。しかしながら、両方のアプローチは、非化学者に一般的に、時間がかかり、非効率的なアクセス不能であり、そして、さらに、環境に優しいとはみなされません。したがって、トレハロース類似体の特定の種類を合成するため、これらの戦略は理想的ではありません。

図2
図2: トレハロースアナログ合成へのアプローチ。化学は難しいPROTECを伴う多段階の手順を使用し、左に示し、トレハロースアナログ合成へのアプローチ化/脱保護、非対称化、および/またはグリコシル化のステップ。右側に示す酵素合成は、立体選択的に水溶液中で類似体をトレハロースするための簡単な、保護されていない基質を変換する酵素(複数可)を使用しています。本明細書で報告酵素プロトコルは、単一のステップでトレハロースの類似体へのグルコース類似体およびUDP-グルコースを変換するトレハロース合成酵素(TRET)酵素を使用しています。 この図の拡大版をご覧になるにはこちらをクリックしてください。

トレハロースアナログへの効率的な生体触媒ルートは、製造、評価し、分子のこの有望なクラスの適用を容易にするであろう。トレハロースの生産5用の市販の酵素処理は、それが基質として澱粉を使用しているため類縁体を合成に適応可能ではありませんが、他の生合成経路がありますトレハロースアナログ合成のために利用することができる自然の中での方法。しかし、最近6を検討したこの地域での研究は、制限されています。一つのレポートには、対応するフルオログルコースからの単一フルオロトレハロースアナログにアクセスするには、 大腸菌(Escherichia coli)トレハロース生合成経路に触発されたメソッドを使用していました。しかしながら、このアプローチは、限られた効率と汎用8を有する三酵素系を必要とします。探索された別のアプローチは、原理的にはグルコースアナログおよびグルコース-1-リン酸6、16、17からトレハロース類似体の一段階合成を可能にする逆方向にトレハロースホス(TREP)を使用することです。このアプローチは、将来有望であることができるが、両方の反転と保持TrePs現在アナログ合成のための欠点を有します。例えば、反転TrePsは法外EXPEを持っていますnsiveドナー分子(β-D-グルコース1-リン酸)と保持TrePsが悪い酵素発現収量/安定性と限られた基板の混乱を持っています。 TREP媒介アナログ合成が実用的である前に(酵素工学を介して、例えば )重要な改善が必要とされるであろう。

現時点では、トレハロース類似体の酵素合成のための最も実用的なアプローチは、グルコースおよびウリジン二リン酸(UDP)は、単一のステップ6でトレハロースに-グルコース変換トレハロース合成酵素(TRET)酵素を使用することです。我々は最近、グルコース類似体およびUDP-グルコース( 3)19からトレハロース類似体を合成-to サーモテナックス TRET、耐熱性および一方向の酵素18の使用を報告しました。この酵素は、合成方向に動作し、TREPのシステムで検出されたトレハロースの劣化の問題を回避できます。このワンステップ反応coul1時間で完了さD、及び(高速液体クロマトグラフィー(HPLC)によって決定されるように> 99%まで)トレハロースアナログの広範な種々の高収率でアクセスされた容易に入手可能なグルコース類似体基質から(代表的な結果の表1を参照セクション)。

図3
図3: トレハロースアナログのTRET触媒による一段階合成。 T.テナックスからTRET酵素は、立体選択的に1ステップでトレハロースの類似体を形成するために容易に利用可能なグルコース類似体およびUDP-グルコースに参加することができます。 R 1〜R 4 =可変構造変更、例えばアジド、フルオロ、デオキシ、チオ、立体化学、または同位体ラベルの変更のため、 Yは、例えば、酸素または硫黄、または同位体標識されたヘテロための変数のヘテロ原子を=。

ここでは、広告を提供します発現および精製TRETの大腸菌から、最適化されたTRET反応条件、および完全に水性相で行われる改良された精製法を含む、TRET合成処理するためのプロトコルをetailed。この修正されたプロトコルは、セミ分取スケール(10-100 mg)を上の多様なトレハロースアナログの好都合かつ効率的な合成及び精製を可能にします。我々はまた、マイコバクテリア細胞の迅速な蛍光検出を有効にして1時間未満でマイコバクテリアにトレハロースベースのプローブを調製し、投与するために、このプロトコルの使用を実証します。

Protocol

トップ10 大腸菌から1発現及びTRETの精製注:TRETを発現する大腸菌株を要求するために、著者に連絡してください(、のpBAD TRETプラスミドをのAraCタンパク質の制御下T.テナックスのTRET遺伝子を含む、トップ10 E.に変換19を 大腸菌 )とそれに付随する材料移転契約。以下のプロトコルは、典型的には、約4 mg / Lでのタンパク質収量を与えま?…

Representative Results

T.テナックス TRETは、標準的なタンパク質発現および精製技術を使用して、約4ミリグラム/ Lの収量で大腸菌から得ました。単一ニッケルアフィニティークロマトグラフィー工程は、(代表FPLCのトレースを図4に示されている)、大腸菌溶解物からTRETを精製するのに十分でした。 TRET合成プロセスに私たちの最初の出版物に設立されたよ…

Discussion

トレハロース類似体は、食品や医薬品の保全から微生物感染症6の診断と治療のために、さまざまな分野に影響を与える可能性を持っています。既存の多段階の化学合成法( 例えば 、天然に複雑なマイコバクテリア糖を生じる)の変形例の複数の部位を有する複雑なトレハロース類似体を製造するために有用です。しかしながら、これらの方法は、比較的簡単な一置?…

Disclosures

The authors have nothing to disclose.

Acknowledgements

This work was funded by a grant from the National Institutes of Health (R15 AI117670) to B.M.S and P.J.W, as well as a Cottrell College Scholar Award from the Research Corporation (20185) to P.J.W. L.M.M. was supported by a Provost’s Fellowship from CMU.

Materials

LB agar Research Products International L24021
Ampicillin sodium salt Sigma Aldrich A9518
Luria broth Research Products International L24045
Terrific Broth Research Products International T15050
L-(+)-Arabinose Sigma Aldrich A3256
Phosphate-buffered Saline GE Healthcare SH30256
Imidazole Sigma Aldrich I5513
Sodium chloride BDH BDH9286
Sodium phosphate, Fisher Scientific S374
monobasic
Syringe filter, 0.45 µm Fisher Scientific 09719D
Protease Inhibitor mini-tablets, EDTA-free Thermo Scientific 88666
HisTrap HP nickel affinity column, 5 mL GE Healthcare 17-5248-02
TRIS base ultrapure Research Products International T60040
Dialysis tubing, MWCO 12–14,000 Fisher Scientific 21-152-16
Glucose analogues CarboSynth, Examples of vendors that offer numerous glucose analogues
Sigma Aldrich,
Santa Cruz Biotechnology, American Radiolabeled Chemicals
6-Azido-6-deoxy glucopyranose (6-GlcAz) CarboSynth MA02620
UDP-Glucose abcam Biochemicals ab120384
Magnesium chloride hexahydrate  Fisher Scientific M33
Amicon Ultra-15 centrifugal filter unit EMD Millipore UFC901008
Bio-Rex RG 501-X8 mixed-bed ion-exchange resin Bio-Rad 444-9999
Extra-Fine Bio-Gel P2 media Bio-Rad 150-4118
Glass-backed silica gel thin-layer chromatography plates EMD Millipore 1056280001
n-Butanol Fisher Scientific A399
Ethanol Fisher Scientific S25310A
Sulfuric acid Fisher Scientific A300
Acetonitrile EMD Millipore AX0145
Deuterium oxide, 99.8% Acros Organics 351430075
Aminopropyl HPLC column Sigma Aldrich 58338
Bovine serum albumin Sigma Aldrich 5470
Para-formaldehyde Ted Pella 18505
Alkyne-488 Sigma Aldrich 761621
Sodium ascorbate Sigma Aldrich A7631
Tris[(1-benzyl-1H-1,2,3-triazol-4-yl)methyl]amine (TBTA) Click Chemistry Tools 1061
tert-Butanol Sigma Aldrich 360538
Dimethylsulfoxide Sigma Aldrich W387520
Copper(II) sulfate Sigma Aldrich C1297
Fluoromount-G mounting medium Southern Biotechnology 10001

References

  1. Elbein, A. D., Pan, Y. T., Pastuszak, I., Carroll, D. New insights on trehalose: a multifunctional molecule. Glycobiology. 13, 17-27 (2003).
  2. Tournu, H., Fiori, A., Van Dijck, P. Relevance of trehalose in pathogenicity: some general rules, yet many exceptions. PLoS Pathog. 9, 1003447 (2013).
  3. Ohtake, S., Wang, Y. J. Trehalose: Current use and future applications. J. Pharm. Sci. 100, 2020-2053 (2011).
  4. Adams, R. P., Kendall, E., Kartha, K. K. Comparison of free sugars in growing and desiccated plants of Selaginella lepidophylla. Biochem. Syst. Ecol. 18, 107-110 (1990).
  5. Kubota, M., Ohnishi, M. . Glycoenzymes. , (2000).
  6. Walmagh, M., Zhao, R., Desmet, T. Trehalose analogues: latest insights in properties and biocatalytic production. Int. J. Mol. Sci. 16, 13729-13745 (2015).
  7. Kim, H. -. M., Chang, Y. -. K., Ryu, S. -. I., Moon, S. -. G., Lee, S. -. B. Enzymatic synthesis of a galactose-containing trehalose analogue disaccharide by Pyrococcus horikoshii trehalose-synthesizing glycosyltransferase: Inhibitory effects on several disaccharidase activities. J. Mol. Catal. B: Enzym. 49, 98-103 (2007).
  8. Backus, K. M., et al. Uptake of unnatural trehalose analogs as a reporter for Mycobacterium tuberculosis. Nat. Chem. Biol. 7, 228-235 (2011).
  9. Swarts, B. M., et al. Probing the mycobacterial trehalome with bioorthogonal chemistry. J. Am. Chem. Soc. 134, 16123-16126 (2012).
  10. Rose, J. D., et al. Synthesis and biological evaluation of trehalose analogs as potential inhibitors of mycobacterial cell wall biosynthesis. Carbohydr. Res. 337, 105-120 (2002).
  11. Wang, J., et al. Synthesis of trehalose-based compounds and their inhibitory activities against Mycobacterium smegmatis. Bioorg. Med. Chem. 12, 6397-6413 (2004).
  12. Gobec, S., et al. Design, synthesis, biochemical evaluation and antimycobacterial action of phosphonate inhibitors of antigen 85C, a crucial enzyme involved in biosynthesis of the mycobacterial cell wall. Eur. J. Med. Chem. 42, 54-63 (2007).
  13. Sarpe, V. A., Kulkarni, S. S. Regioselective protection and functionalization of trehalose. Trends in Carbohydr. Res. 5, 8-33 (2013).
  14. Chaube, M. A., Kulkarni, S. S. Stereoselective construction of 1,1-alpha,alpha-glycosidic bonds. Trends in Carbohydr. Res. 4, 1-19 (2013).
  15. Leigh, C. D., Bertozzi, C. R. Synthetic studies toward Mycobacterium tuberculosis sulfolipid-I. J. Org. Chem. 73, 1008-1017 (2008).
  16. Chaen, H., et al. Efficient enzymatic synthesis of disaccharide, alpha-D-galactosyl-alpha-D-glucoside, by trehalose phosphorylase from Thermoanaerobacter brockii. J. Appl. Glycosci. 48, 135-137 (2001).
  17. Vander Borght, J., Soetaert, W., Desmet, T. Engineering the acceptor specificity of trehalose phosphorylase for the production of trehalose analogs. Biotechnol. Progr. 28, 1257-1262 (2012).
  18. Kouril, T., Zaparty, M., Marrero, J., Brinkmann, H., Siebers, B. A novel trehalose synthesizing pathway in the hyperthermophilic Crenarchaeon Thermoproteus tenax: the unidirectional TreT pathway. Arch. Microbiol. 190, 355-369 (2008).
  19. Urbanek, B. L., et al. Chemoenzymatic synthesis of trehalose analogues: rapid access to chemical probes for investigating mycobacteria. ChemBioChem. 15, 2066-2070 (2014).
  20. Rostovtsev, V. V., Green, L. G., Fokin, V. V., Sharpless, K. B. A stepwise Huisgen cycloaddition process: copper(I)-catalyzed regioselective “ligation” of azides and terminal alkynes. Angew. Chem. Int. Ed. 41, 2596-2599 (2002).
  21. Tornøe, C. W., Christensen, C., Meldal, M. Peptidotriazoles on solid phase: [1,2,3]-triazoles by regiospecific copper(I)-catalyzed 1,3-dipolar cycloadditions of terminal alkynes to azides. J. Org. Chem. 67, 3057-3064 (2002).
  22. Kalscheuer, R., Weinrick, B., Veeraraghavan, U., Besra, G. S., Jacobs, W. R. Trehalose-recycling ABC transporter LpqY-SugA-SugB-SugC is essential for virulence of Mycobacterium tuberculosis. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 107, 21761-21766 (2010).

Play Video

Cite This Article
Meints, L. M., Poston, A. W., Piligian, B. F., Olson, C. D., Badger, K. S., Woodruff, P. J., Swarts, B. M. Rapid One-step Enzymatic Synthesis and All-aqueous Purification of Trehalose Analogues. J. Vis. Exp. (120), e54485, doi:10.3791/54485 (2017).

View Video