Methods to accurately measure retinoic acid (RA) levels in small amounts of tissue do not exist. This protocol describes the easy, quantitative measurement of relative RA levels in E8.5 embryos and neurospheres using an RA reporter cell line.
Retinoic acid (RA) is an important developmental morphogen that coordinates anteroposterior and dorsoventral axis patterning, somitic differentiation, neurogenesis, patterning of the hindbrain and spinal cord, and the development of multiple organ systems. Due to its chemical nature as a small amphipathic lipid, direct detection and visualization of RA histologically remains technically impossible. Currently, methods used to infer the presence and localization of RA make use of reporter systems that detect the biological activity of RA. Most established reporter systems, both transgenic mice and cell lines, make use of the highly potent RA response element (RARE) upstream of the RAR-beta gene to drive RA-inducible expression of reporter genes, such as beta-galactosidase or luciferase. The transgenic RARE-LacZ mouse is useful in visualizing spatiotemporal changes in RA signaling especially during embryonic development. However, it does not directly measure overall RA levels. As a reporter system, the F9 RARE-LacZ cell line can be used in a variety of ways, from simple detection of RA to quantitative measurements of RA levels in tissue explants. Here we describe the quantitative determination of relative RA levels generated in embryos and neurosphere cultures using the F9 RARE-LacZ reporter cell line.
Ретиноевой кислоты (RA) является метаболитом производное ретинола или витамина А и производится путем последовательной активности некоторых клеточных дегидрогеназ 1. Из – за своей амфипатической химической природы, он легко проникает через липидные мембраны и может выступать в качестве растворимого фактора морфогенетического 1. Это существенная молекула , которая регулирует многочисленные развития и взрослых клеточные процессы, действуя в качестве лиганда для ядерных рецепторов ретиноидов и активируя экспрессию генов 2-10. Без РА, эти рецепторы RA (РАКС) связывают Rares в ДНК и действуют как репрессоры; РА связывание с этими рецепторами , превращает их в транскрипционных активаторов приводит к экспрессии гена – мишени 1,5,6.
Хотя передача сигналов RA путь хорошо характеризуется, небольшой размер (~ 300 Да) и амфипатической природы РА делает прямой гистологическую визуализацию и измерение RA в настоящее время технически неосуществимой 11. Способ только для режECT измерение уровней РА путем изоляции РА из образцов ткани , с использованием высокоэффективной жидкостной хроматографии (ВЭЖХ) 11. Этот метод , как правило , требует большого количества ткани, облегченные за счет объединения различных образцов 12. Таким образом, эта техника плохо подходит для измерения уровней РА у отдельных эмбрионов или небольших количеств проб / ткани.
Для того чтобы исследовать клеточную функцию RA, несколько методов были разработаны, чтобы косвенно сделать вывод о наличии RA. Эти методы используют репортерных систем , содержащих высокочувствительную RAR-бета РЕДКИЙ вождения экспрессию бета-галактозидазы или люциферазы 11,13,14. Трансгенные RARE-LacZ репортер мыши генерируется Rossant и др. , 13 является идеальной системой для визуализации пространственно – временные области передачи сигналов RA на месте 11,13,15,16 , но не подходит для количественных измерений. F9 клеточная линия RARE-LacZ 14, по тон с другой стороны, является полезным для выявления РА и количественных измерений уровней RA в ткани эксплантов 11,12,14,17,18.
Тератокарциномы клетки F9 выразить эндогенный альфа-, бета- и гамма-рецепторов ретиноевой кислоты 19, и инициировать дифференцировку в теменной энтодермы после воздействия RA 19-21. Клетки F9 уже давно был создан в качестве модели для RA-индуцированной клеточной дифференцировки, поэтому она была выбрана в качестве идеальной линии клеток Для анализа репортера РА. F9 происхождения репортер клеточная линия Sil-15 RA порождена Вагнера и др. 14 содержит Е. coli'LacZ гена вниз по течению одной копии 64 п.н. ретиноевой элемент ответа кислоты (RARE) из (RAR-бета) гена рецептора человеческого бета-ретиноевой кислоты. Для того чтобы выбрать и сохранить стабильные клоны, конструкция также содержит ген аминогликозидфосфотрансферазы (ОКО г) в качестве селективного маркера в присутствии G418. Эта конструкция соnfers индуцируемой экспрессии б-галактозидазы в присутствии RA, которые могут быть визуализированы с помощью LacZ окрашивания и этот ответ может быть впоследствии количественно с использованием колориметрических методов 11,12,14,18.
Это чрезвычайно универсальный линия репортер клеток широко используется в обнаружении эндогенной продукции РА посредством совместного культивирования образцов тканей с репортером клетками, такими как кохлеарная 17 и эмбриональных эксплантов 14 плиты пола. Кроме того, этот репортер линия была использована для количественной оценки уровней RA в развивающемся спинном мозге при культивировании объединенных участков эмбриональных спинного мозга отдельно и добавление кондиционированной среды от этих культур до F9 RARE-LacZ клеток 18. Их количественную оценку проводили после LacZ окрашивания с помощью колориметрического чтения с помощью стандартной ELISA планшет – ридер 11,12,18. И, наконец, эта клеточная линия репортер был использован в обнаружении присутствия ферментов метаболизма РА по Мониторинговойнг изменения в уровнях RA 12,18.
Мы сообщаем, что чувствительность этой клеточной линии репортер также позволяет для измерения уровней RA, полученных от отдельных сокультивируют E8.5 эмбрионов. Это дает возможность сравнения между отдельными эмбрионами различных генотипов. В качестве конкретного примера, Gpr161 сирота GPCR , который регулирует нейруляция частично через путь 22 передачи сигналов RA, и мы сообщаем , используя этот репортер клеточную линию , чтобы исследовать влияние рецессивных мутаций в Gpr161 (Gpr161 Вл) на общие уровни RA в эмбрион. В дополнение к этому, универсальность и простоту использования этого репортера системы позволяет свободу измерять и сравнивать уровни RA в различных образцах тканей, даже в нейросфера культурах, полученных от взрослых спинного мозга стволовых клеток. Здесь мы опишем количественное определение относительных уровней RA у эмбрионов и нейросфера культур посредством прямого совместного культивирования с F9 редко- LacZ повторении РАклеточная линия orter.
F9 , линию клеток RARE-LacZ – 14 представляет собой мощную систему , которая может быть использована для обнаружения RA производимого тканевых эксплантов 12,14,17,18. Он чувствителен к концентрации RA , как низко как 100 Fm, без неспецифического ответа обнаруженного в клетках необработанных с РА 12,14,18. Кроме того, репортер клетки реагируют на все-транс – ретиноевой линейным образом в пределах определенного диапазона концентраций, таким образом , дава реакции , LacZ быть количественно и используется для определения величины уровней RA 12,14,18. Быстрый и простой анализ репортер RA , представленный здесь использует линию F9 репортер клеток RARE-LacZ для визуализации (рис 2) и относительного количественного измерения (рисунок 3) эмбрионов и культивируют взрослых нервных стволовых клеток. Эта система репортер позволяет проводить сравнение эндогенных уровней RA между отдельными образцами, как показано на рисунке 2. Он достаточно чувствителен , чтобы иметь возможность обнаружить RAгенерироваться отдельными эмбрионами E8.5 (фиг.2А), а также RA , производимых культивируемых нейросферах (рис 2В). Дозозависимый ответ этой клеточной линии в различных концентрациях RA позволяет квантификации уровней RA (рис 3А) в образцах, а также сопоставление относительных уровней RA между образцами (фигура 3В). Важно отметить, что линия F9 РЕДКОГО репортер ячейка измеряет общее количество RA, генерируемый образцов ткани в течение времени инкубации. Это эквивалентно чистый баланс синтеза и катаболизма РА.
В то время как F9, RARE-LacZ, система клеток репортер обладает высокой чувствительностью и универсальным, существует несколько важных шагов по устранению неисправностей, которые мы включили для того, чтобы обеспечить надежность этой системы. Во- первых, как показано на рисунке 1, важно , чтобы поддержать здоровье этих клеток регулярными проходами , не давая им ггрести к сплошности. Во-вторых, мы наблюдали позже проходы, как правило, приводят к несогласованности ответов RA, даже если культуры постоянно поддерживаются при селекции с помощью G418. Для устранения этого, рекомендуется отказаться от культуры после 20 пассажей и оттаивать новый флакон. Кроме того, регулярные проверки должны быть выполнены, чтобы гарантировать, что репортер клетки все еще сильными реагирующих на присутствие RA в средствах массовой информации. В- третьих, если ранние проходы обладают плохой или неравномерную ответ на RA (Фиг.1В, слева), один или несколько этапов субклонирования может быть необходимо , пока сильные ответные меры не будут получены (Фиг.1В, RIGH т). И, наконец, до совместной культуре, рекомендуется, чтобы образцы ткани, такие как эмбрионы и нейросферах диссоциируют на отдельные клетки. Мы наблюдали, что диссоциация результатов выборок в более последовательных колориметрических измерений. Это может быть из-за более равномерного распределения RA в культуре скважин, поскольку диссоциированные клетки находятся в универеформа контакта с репортером клеток.
Некоторые модификации были сделаны к оригинальному протоколу 14. Во- первых, ответ RA из RARE-F9 LacZ клетки были количественно определены путем непосредственного закрепления клеток и измерения оптической плотности при длине волны 610 нм вместо сбора и анализа клеток лизат для б-галактозидазы 14. Другая модификация является прямое совместное культивирование диссоциированных образцов с F9 RARE-LacZ до количественного ответа РА. Предыдущие методы сообщили культивированием образцы отдельно и добавлять только носитель из этих культур до F9 RARE-LacZ 16,18.
Несмотря на будучи мощной системе, репортер анализа F9 RARE-LacZ имеет ряд ограничений. Одно ограничение этой линии клеток-репортер, что, хотя она сильно реагирует на присутствие полностью транс-RA, он также реагирует на другие изомеры ретиноевой кислоты, включая 9-цис-RA и 13-цис-RA; Тем не менее, они в 100 раз более чувствительными к полностью транс-RA комкрасный с другими изомерами 18. Другим ограничением этой системы является то, что линейная доза-зависимый ответ падает только между 10 -13 М до 10 -7 М ат-РА 14,18; Таким образом, если сравнивать уровни RA вне этих пределов, то может быть необходимо выполнить серийное разведение образца до измерений не попадают в пределах линейного диапазона. И наконец, так как это в первую очередь колориметрический анализ, конечная точка проявления цвета будет варьироваться между образцами и экспериментов. Таким образом, важно, что стандартная кривая всегда высевать параллельно для каждого отдельного эксперимента для того, чтобы использовать его для количественной оценки ответа репортер клетки.
В заключение, мы уже сообщали, использование F9 репортер клеточной линии RARE-LacZ РА для измерения уровней RA количественно E8.5 эмбрионов и, ранее незарегистрированного в нейросферах. Универсальность этого репортера системы может позволить количественно оценить уровни RA в практически любой клеток или тканей типа, и мау привести к развитию различных областей применения в будущем.
The authors have nothing to disclose.
We would like to acknowledge Dr. Michael Wagner (SUNY Downstate Medical Center) and Ben Thiede (Dr. Jeff Corwin lab, University of Virginia) for providing us with the F9 RARE-LacZ cells and technical support. This study is funded by the New Jersey Commission on Spinal Cord Research (NJCSCR) (Grantnumber:10-3092-SCR-E-0) and the New Jersey Commission on Brain Injury Research (NJCBIR) (Grant number: CBIR13FEL006).
C3H/HeSn-Gpr161vl/J mouse strain | Jackson Laboratory | 000316 | |
F9 RARE-LacZ reporter cell line | from Dr. Michael Wagner (SUNY Downstate Medical Center) and Ben Thiede (Dr. Jeff Corwin lab, University of Virginia) | ||
DMEM/F-12 (with L-glutamine and HEPES) | ThermoFisher Scientific | 11330-057 | |
Fetal Bovine Serum (FBS), qualified | ThermoFisher Scientific | 26140-079 | Store at -20 °C in 10-ml aliquots to avoid repeated freeze-thaw; warm in 37 C for media preparation |
Penicillin/Streptomycin | ThermoFisher Scientific | 15140-122 | Store at -20 °C in 10-ml aliquots to avoid repeated freeze-thaw; light-sensitive |
G418 | ThermoFisher Scientific | 10131-027 | Store at 4 °C; light-sensitive |
2% Gelatin | Sigma Aldrich | G1393 | Store at 4 °C |
B-27 supplement (2 % stock solution) | ThermoFisher Scientific | 17504-044 | Store at -20 °C in 1-ml aliquots to avoid repeated freeze-thaw; warm at room temperature for media preparation |
Murine Epidermal Growth Factor (EGF) | PeproTech | 315-09 | Prepare 100 μg/ml stock solution in 0.1% bovine serum albumin (BSA) in 1X PBS; prepare working concentrations by diluting with 1X PBS; store at -20 °C |
Murine Fibroblast Growth Factor (FGF)-basic | PeproTech | 450-33 | Prepare 100 μg/ml stock solution in 0.1% bovine serum albumin (BSA) in 1X PBS; prepare working concentrations by diluting with 1X PBS; store at -20 °C |
50% glutaraldehyde | Amresco | M155 | Store at 4 C |
Sodium deoxycholate monohydrate (C24H39NaO4 · H2O) | Sigma Aldrich | D5670 | Store at room temperature |
potassium ferrocyanide (K₄[Fe(CN)₆] · 3H₂O) | Sigma Aldrich | P-9387 | Store at room temperature |
potassium ferricyanide (K₃[Fe(CN)₆]) | Sigma Aldrich | P-8131 | Store at room temperature |
X-gal (5-bromo-4-chloro-3-indolyl-β-d-galactopyranoside) | Promega | V3941 | Store stock at -20 °C |
Dimethyl sulfoxide (DMSO) | Sigma Aldrich | 41639 | Store at room temperature |
all-trans Retinoic Acid (at-RA) | Sigma Aldrich | R-2625 | Store 1 ml aliquots of stock in -80 °C; extremely sensitive to light |
TrypLE Express | ThermoFisher Scientific | 12605-010 | Store at room temperature |
0.25% trypsin-EDTA | ThermoFisher Scientific | 25200-056 | alternative to TrypLE Express; aliquot and store at -20 C |
Hank's Balanced Salt Solution (HBSS) | ThermoFisher Scientific | 14170-112 | Store at 4 C |
10X phosphate buffered solution (PBS) | ThermoFisher Scientific | 10010-023 | Store at 4 C |
Papain | Worthington | LK003176 | Store at 4 °C. |
Trypsin | Worthington | LS003703 | Store in 1 ml aliquots at -20 °C. |
Hyaluronic acid | Calbiochem | 385908 | Store 200 μl aliquots at -20 °C. |
DNaseI | Worthington | LS002139 | Store in 200 μl aliquots at -20 C |
Kynurenic acid | Sigma Aldrich | K3375 | Store in 200 μl aliquots at -20 C |
95% ethanol | |||
Mr. Frosty Freezing container | ThermoFisher Scientific | 5100-0001 | |
10 cm culture dish (non-cell culture treated) | |||
10 cm culture dish (cell culture treated) | |||
6 cm culture dish (non-cell culture treated) | |||
96-well cell culture plates | |||
1.5 ml microcentrifuge tubes | |||
1.5 ml amber microcentrifuge tubes | |||
1.5 ml cryovials | |||
37 °C water bath | |||
surgical scissors | |||
fine surgical scissors | |||
no. 5 forceps | |||
blunt-ended forceps | |||
scalpel blade | |||
glass pasteur pipettes | |||
cotton | |||
alcohol lamp | |||
ELISA plate reader | |||
stereomicroscope |