Methods to accurately measure retinoic acid (RA) levels in small amounts of tissue do not exist. This protocol describes the easy, quantitative measurement of relative RA levels in E8.5 embryos and neurospheres using an RA reporter cell line.
Retinoic acid (RA) is an important developmental morphogen that coordinates anteroposterior and dorsoventral axis patterning, somitic differentiation, neurogenesis, patterning of the hindbrain and spinal cord, and the development of multiple organ systems. Due to its chemical nature as a small amphipathic lipid, direct detection and visualization of RA histologically remains technically impossible. Currently, methods used to infer the presence and localization of RA make use of reporter systems that detect the biological activity of RA. Most established reporter systems, both transgenic mice and cell lines, make use of the highly potent RA response element (RARE) upstream of the RAR-beta gene to drive RA-inducible expression of reporter genes, such as beta-galactosidase or luciferase. The transgenic RARE-LacZ mouse is useful in visualizing spatiotemporal changes in RA signaling especially during embryonic development. However, it does not directly measure overall RA levels. As a reporter system, the F9 RARE-LacZ cell line can be used in a variety of ways, from simple detection of RA to quantitative measurements of RA levels in tissue explants. Here we describe the quantitative determination of relative RA levels generated in embryos and neurosphere cultures using the F9 RARE-LacZ reporter cell line.
L'acido retinoico (RA) è un derivato metabolita di retinolo o vitamina A ed è prodotto attraverso l'attività sequenziali di diversi deidrogenasi cellulari 1. A causa della sua natura chimica amphiphatic, attraversa facilmente le membrane lipidiche e può agire come fattore morfogenetico solubile 1. E 'una molecola essenziale che regola numerosi processi cellulari sviluppo e adulti agendo come ligando per i recettori nucleari dei retinoidi e attivazione genica 2-10. Senza RA, questi recettori RA (RAR) RARE legano a DNA e ad agire come repressori; RA legandosi a questi recettori li trasforma in attivatori trascrizionali conseguente obiettivo di espressione genica 1,5,6.
Anche se il percorso di segnalazione RA è ben caratterizzato, le piccole dimensioni (~ 300 Da) e la natura amphipathic di RA rende la visualizzazione diretta istologico e la misurazione di RA attualmente tecnicamente irrealizzabile 11. L'unico metodo per direct misurazione dei livelli di Ra è attraverso l'isolamento di RA da campioni di tessuto mediante cromatografia liquida ad alte prestazioni (HPLC) 11. Questo metodo richiede tipicamente grandi quantità di tessuto, facilitato mettendo in comune diversi campioni 12. Così, questa tecnica è poco adatta per la misurazione dei livelli di RA nei singoli embrioni o piccole quantità di campione / tessuto.
Per studiare la funzione cellulare di RA, vari metodi sono stati sviluppati per inferire indirettamente la presenza di RA. Questi metodi fanno uso di sistemi giornalista che contengono il altamente reattivo RAR-beta RARE guida l'espressione di beta-galattosidasi o luciferasi 11,13,14. Il topo transgenico giornalista RARE-LacZ generato da Rossant et al. 13 è un sistema ideale per la visualizzazione regioni spazio-temporali di segnalazione RA in situ 11,13,15,16, ma non è adatto per misurazioni quantitative. La linea cellulare RARE-LacZ F9 14, su tlui, invece, è utile per il rilevamento di RA e misurazioni quantitative dei livelli di RA in espianti di tessuto 11,12,14,17,18.
Cellule teratocarcinoma F9 esprimono alfa endogena, beta, e acido gamma-retinoico recettori 19, e avviare la differenziazione in parietale endoderma dopo l'esposizione al RA 19-21. cellule F9 sono stati da tempo stabilito come modello per la differenziazione cellulare indotta dal RA, è per questo che è stato scelto come una linea cellulare ideale per un test RA giornalista. La linea cellulare giornalista F9-derivato Sil-15 RA generato da Wagner et al. 14 contiene una E. coli'LacZ gene a valle di una copia del retinoico elemento di risposta acido 64-bp (RARE) del gene del recettore beta dell'acido retinoico umano (RAR-beta). Al fine di selezionare e mantenere cloni stabili, il costrutto contiene inoltre il gene aminoglicoside fosfotransferasi (r NEO) come marcatore selezionabile in presenza di G418. Questo costrutto confers espressione inducibile di b-galattosidasi in presenza di RA, che può essere visualizzato mediante colorazione LacZ e questa risposta può essere successivamente quantificata utilizzando metodi colorimetrici 11,12,14,18.
Questa linea cellulare giornalista estremamente versatile è stato ampiamente utilizzato nella rilevazione della produzione RA endogena tramite co-coltura di campioni di tessuto con le cellule giornalista, come cocleari 17 e embrionali espianti piatto piano 14. Inoltre, questa linea giornalista è stato utilizzato per la quantificazione dei livelli di RA in via di sviluppo midollo spinale coltivando sezioni pool di midolli spinali embrionali separatamente e l'aggiunta di mezzi condizionati da queste culture a cellule rare-LacZ F9 18. La quantificazione è stata eseguita dopo LacZ colorazione attraverso la lettura colorimetrica utilizzando un lettore di piastre ELISA standard 11,12,18. Infine, questa linea cellulare giornalista è stato utilizzato nella rilevazione della presenza di RA enzimi metabolici monitoring cambiamenti nei livelli di RA 12,18.
Qui riportiamo che la sensibilità di questa linea cellulare giornalista consente anche per la misurazione dei livelli di RA generati dai singoli embrioni E8.5 co-coltura. Ciò permette il confronto tra i singoli embrioni di diversi genotipi. Come esempio specifico, Gpr161 è un GPCR orfano che regola neurulazione in parte attraverso il percorso di segnalazione RA 22, e riportiamo utilizzare questa linea cellulare giornalista per indagare l'effetto di una mutazione recessiva in Gpr161 (Gpr161 vl) sui livelli di RA complessivi del embrione. In aggiunta a questo, la versatilità e la facilità d'uso di questo sistema reporter permette la libertà di misurare e confrontare i livelli di RA in diversi campioni di tessuto, anche in colture di neurosfere ottenute da cellule staminali adulte del midollo spinale. Qui si descrive la determinazione quantitativa dei livelli relativi RA negli embrioni e culture neurosfere attraverso co-coltura diretto con il F9 RARE-LacZ RA replinea cellulare Orter.
La linea cellulare F9 RARE-LacZ 14 è un potente sistema che può essere utilizzato per il rilevamento di RA prodotto da espianti tissutali 12,14,17,18. E 'sensibile a concentrazioni RA a partire da 100 Fm, con nessuna risposta non specifica rilevata in cellule non trattate con RA 12,14,18. Inoltre, le cellule giornalista rispondono a tutto-trans RA in modo lineare in un intervallo specifico di concentrazione, permettendo così la reazione LacZ da quantificare e utilizzato per determinare l'entità di livelli RA 12,14,18. Il test rapido e facile RA giornalista qui presentata utilizza la linea cellulare giornalista F9 RARE-LacZ per la visualizzazione (Figura 2) e la misurazione quantitativa relativa (Figura 3) di embrioni e cellule staminali neurali in coltura per adulti. Questo sistema reporter permette confronto dei livelli endogeni RA tra singoli campioni, come mostrato in Figura 2. È abbastanza sensibile da poter rilevare RAgenerato dai singoli embrioni E8.5 (Figura 2A) e RA prodotti da neurospheres coltura (Figura 2B). La risposta dose-dipendente di questa linea cellulare di concentrazioni variabili di RA consente la quantificazione dei livelli RA (Figura 3A) nei campioni così come il confronto dei livelli relativi RA tra i campioni (Figura 3B). E 'importante notare che la linea cellulare giornalista RARE F9 misura la quantità complessiva di RA generato dai campioni di tessuto nel tempo di incubazione. Questo è equivalente al saldo netto della sintesi RA e catabolismo.
Mentre il F9 sistema reporter cellule RARE-LacZ è altamente sensibile e versatile, ci sono diversi passaggi di risoluzione dei problemi critici che abbiamo incorporato per garantire l'affidabilità del sistema. In primo luogo, come mostrato nella Figura 1, è importante mantenere la salute di queste cellule di passaggi regolari senza farli gremare a confluenza. Secondo, abbiamo osservato dopo passaggi tendono a provocare risposte RA inconsistenti, anche se le culture sono costantemente mantenuti in selezione con G418. Per risolvere questo, si consiglia di scartare culture dopo 20 passaggi e scongelare un nuovo flacone. Inoltre, i controlli periodici devono essere eseguiti per garantire che le cellule giornalista ancora forti responder alla presenza di RA nei media. In terzo luogo, se i primi passaggi mostrano scarsa risposta o non uniforme di RA (Figura 1B, a sinistra), uno o più giri di subcloning possono essere necessarie fino a quando responder forti sono ottenuti (Figura 1B, a de stra). Infine, prima della co-coltura, si raccomanda che i campioni di tessuto come embrioni e neurosfere sono dissociati per singole cellule. Abbiamo osservato che la dissociazione dei campioni risultati delle misurazioni colorimetriche più coerenti. Ciò può essere dovuto ad una distribuzione più uniforme delle RA nei pozzetti di coltura, le cellule dissociate sono in uniFormulario di contatto con le cellule Reporter.
Diverse modifiche sono state apportate anche al protocollo originale 14. In primo luogo, la risposta RA delle cellule RARE-LacZ F9 sono stati quantificati fissando direttamente le cellule e misurare l'assorbanza a 610 nm, invece di raccogliere le cellule e l'analisi di lisato per l'attività b-galattosidasi 14. Un'altra modifica è la co-coltura diretta di campioni dissociate con F9 RARE-LacZ prima quantificazione della risposta RA. I metodi precedenti hanno riportato la coltura di campioni separatamente e aggiungendo solo il supporto da queste culture a F9 RARE-LacZ 16,18.
Nonostante il suo essere un sistema potente, il saggio giornalista RARE-LacZ F9 ha diversi limiti. Una limitazione di questa linea cellulare giornalista è che anche se risponde fortemente alla presenza di tutto-trans RA, risponde anche ad altri isomeri dell'acido retinoico cui 9-cis-RA e 13-cis-RA; tuttavia, sono 100 volte più sensibili a tutto-trans compa RArosso per gli altri isomeri 18. Un altro limite di questo sistema è che la risposta lineare dose-dipendente cade tra il 10 -13 M a 10 -7 M at-RA 14,18; pertanto, se si confrontano i livelli RA fuori di questi limiti, potrebbe essere necessario eseguire una diluizione seriale del campione fino a quando le misurazioni rientrano nel range lineare. Infine, poiché questo è soprattutto un saggio colorimetrico, il punto finale di sviluppo del colore può variare tra i campioni ed esperimenti. Pertanto, è importante che una curva standard sempre essere placcato in parallelo per ogni singolo esperimento per usarlo per la quantificazione della risposta cellulare giornalista.
In conclusione, abbiamo riportato l'utilizzo della linea cellulare giornalista RARE-LacZ RA F9 per misurare i livelli di RA quantitativamente negli embrioni E8.5 e, in precedenza non dichiarata, in neurosfere. La versatilità di questo sistema reporter può consentire la quantificazione dei livelli di RA praticamente in qualsiasi tipo di cellula o tessuto, e may portare allo sviluppo di varie applicazioni in futuro.
The authors have nothing to disclose.
We would like to acknowledge Dr. Michael Wagner (SUNY Downstate Medical Center) and Ben Thiede (Dr. Jeff Corwin lab, University of Virginia) for providing us with the F9 RARE-LacZ cells and technical support. This study is funded by the New Jersey Commission on Spinal Cord Research (NJCSCR) (Grantnumber:10-3092-SCR-E-0) and the New Jersey Commission on Brain Injury Research (NJCBIR) (Grant number: CBIR13FEL006).
C3H/HeSn-Gpr161vl/J mouse strain | Jackson Laboratory | 000316 | |
F9 RARE-LacZ reporter cell line | from Dr. Michael Wagner (SUNY Downstate Medical Center) and Ben Thiede (Dr. Jeff Corwin lab, University of Virginia) | ||
DMEM/F-12 (with L-glutamine and HEPES) | ThermoFisher Scientific | 11330-057 | |
Fetal Bovine Serum (FBS), qualified | ThermoFisher Scientific | 26140-079 | Store at -20 °C in 10-ml aliquots to avoid repeated freeze-thaw; warm in 37 C for media preparation |
Penicillin/Streptomycin | ThermoFisher Scientific | 15140-122 | Store at -20 °C in 10-ml aliquots to avoid repeated freeze-thaw; light-sensitive |
G418 | ThermoFisher Scientific | 10131-027 | Store at 4 °C; light-sensitive |
2% Gelatin | Sigma Aldrich | G1393 | Store at 4 °C |
B-27 supplement (2 % stock solution) | ThermoFisher Scientific | 17504-044 | Store at -20 °C in 1-ml aliquots to avoid repeated freeze-thaw; warm at room temperature for media preparation |
Murine Epidermal Growth Factor (EGF) | PeproTech | 315-09 | Prepare 100 μg/ml stock solution in 0.1% bovine serum albumin (BSA) in 1X PBS; prepare working concentrations by diluting with 1X PBS; store at -20 °C |
Murine Fibroblast Growth Factor (FGF)-basic | PeproTech | 450-33 | Prepare 100 μg/ml stock solution in 0.1% bovine serum albumin (BSA) in 1X PBS; prepare working concentrations by diluting with 1X PBS; store at -20 °C |
50% glutaraldehyde | Amresco | M155 | Store at 4 C |
Sodium deoxycholate monohydrate (C24H39NaO4 · H2O) | Sigma Aldrich | D5670 | Store at room temperature |
potassium ferrocyanide (K₄[Fe(CN)₆] · 3H₂O) | Sigma Aldrich | P-9387 | Store at room temperature |
potassium ferricyanide (K₃[Fe(CN)₆]) | Sigma Aldrich | P-8131 | Store at room temperature |
X-gal (5-bromo-4-chloro-3-indolyl-β-d-galactopyranoside) | Promega | V3941 | Store stock at -20 °C |
Dimethyl sulfoxide (DMSO) | Sigma Aldrich | 41639 | Store at room temperature |
all-trans Retinoic Acid (at-RA) | Sigma Aldrich | R-2625 | Store 1 ml aliquots of stock in -80 °C; extremely sensitive to light |
TrypLE Express | ThermoFisher Scientific | 12605-010 | Store at room temperature |
0.25% trypsin-EDTA | ThermoFisher Scientific | 25200-056 | alternative to TrypLE Express; aliquot and store at -20 C |
Hank's Balanced Salt Solution (HBSS) | ThermoFisher Scientific | 14170-112 | Store at 4 C |
10X phosphate buffered solution (PBS) | ThermoFisher Scientific | 10010-023 | Store at 4 C |
Papain | Worthington | LK003176 | Store at 4 °C. |
Trypsin | Worthington | LS003703 | Store in 1 ml aliquots at -20 °C. |
Hyaluronic acid | Calbiochem | 385908 | Store 200 μl aliquots at -20 °C. |
DNaseI | Worthington | LS002139 | Store in 200 μl aliquots at -20 C |
Kynurenic acid | Sigma Aldrich | K3375 | Store in 200 μl aliquots at -20 C |
95% ethanol | |||
Mr. Frosty Freezing container | ThermoFisher Scientific | 5100-0001 | |
10 cm culture dish (non-cell culture treated) | |||
10 cm culture dish (cell culture treated) | |||
6 cm culture dish (non-cell culture treated) | |||
96-well cell culture plates | |||
1.5 ml microcentrifuge tubes | |||
1.5 ml amber microcentrifuge tubes | |||
1.5 ml cryovials | |||
37 °C water bath | |||
surgical scissors | |||
fine surgical scissors | |||
no. 5 forceps | |||
blunt-ended forceps | |||
scalpel blade | |||
glass pasteur pipettes | |||
cotton | |||
alcohol lamp | |||
ELISA plate reader | |||
stereomicroscope |