Summary

Синтез белка биоконъюгатов<em> с помощью</em> Цистеин-малеимид химии

Published: July 20, 2016
doi:

Summary

Этот протокол подробно описываются важные шаги, необходимые для биоконъюгации цистеина, содержащего белок малеимид, в том числе очистки реагентов, условий реакции, очистки Bioconjugate и Bioconjugate характеристики.

Abstract

The chemical linking or bioconjugation of proteins to fluorescent dyes, drugs, polymers and other proteins has a broad range of applications, such as the development of antibody drug conjugates (ADCs) and nanomedicine, fluorescent microscopy and systems chemistry. For many of these applications, specificity of the bioconjugation method used is of prime concern. The Michael addition of maleimides with cysteine(s) on the target proteins is highly selective and proceeds rapidly under mild conditions, making it one of the most popular methods for protein bioconjugation.

We demonstrate here the modification of the only surface-accessible cysteine residue on yeast cytochrome c with a ruthenium(II) bisterpyridine maleimide. The protein bioconjugation is verified by gel electrophoresis and purified by aqueous-based fast protein liquid chromatography in 27% yield of isolated protein material. Structural characterization with MALDI-TOF MS and UV-Vis is then used to verify that the bioconjugation is successful. The protocol shown here is easily applicable to other cysteine – maleimide coupling of proteins to other proteins, dyes, drugs or polymers.

Introduction

Биоконъюгации включает ковалентного связывания одного биомолекул с другим или с синтетической молекулой, такой как краситель, лекарственного средства или полимера. Методы биоконъюгации белка в настоящее время широко используется во многих химии, биологии и нанотехнологических исследовательских групп с приложениями , начиная от маркировки флуоресцентного красителя 1,2, что делает белок (антитела) -prodrugs 3 (антитела наркотиков конъюгатов – АСДУ) синтез белковых димеров 4,5 , вплоть до самосборки белково-полимерных гибридов , используемых в 6,7 наномедицинскими 8 и 9 систем химии.

Специфичность химии используется для биоконъюгации, в то время как не всегда критично, имеет огромное значение для большинства функциональных белковых биоконъюгатов, с тем, чтобы не мешать активным сайтом белка-мишени. Идеальная реакция биоконъюгации необходимо выполнить несколько критериев, в том числе: I), ориентированных на редких или уникальных сайтов интересующего белка,б) быть селективным к этой цели, III) протекают в неденатурирующих условиях, чтобы избежать разворачивания белка и IV) быть высокоурожайных, как белок-мишень, как правило, доступны только на суб-миллимолярной концентрации. Малеимидная – цистеин Михаэлю приближается к выполнению всех этих критериев, и имеет по этой причине долгое время утверждал , особый статус в области химии Bioconjugate 10. Это происходит потому, что я) многие белки, содержащие только один остаток цистеина на их поверхности могут быть методами генной инженерии там, II) при правильном рН реакция имеет высокую селективность по отношению к цистеина, III) она протекает гладко в водных буферах и IV) он очень быстро со второй константой скорости порядка малеимидам в цистеин-содержащих белков , о которых превышает 5000 м -1 с -1 в некоторых случаях 11. При условии , что интерес белок может выдержать небольшое (≈ 5-10%) количество органического сорастворителя 12, почти любой малеимид-функционализированного красителя, роищейка, поверхность или другой белок, может быть связан с белками. Кроме того, малеинимидов более специфичны для цистеина на белках, чем iodoacetamides, которые более склонны к взаимодействию с другими нуклеофилами при повышенном значении рН; и более стабильны , чем на основе дисульфида конъюгации , которые должны храниться при кислом рН , чтобы предотвратить дисульфидный обмен 13.

Мы сообщаем обобщенный протокол сопряжения малеимид-функционализированного молекул с белком , содержащим единственный остаток цистеина с использованием реакции между Ru (II) основе хромофора и редокс – белка цитохрома С в качестве примера. Этот протокол в равной степени применима и к большинству других белков, содержащих доступный остаток цистеина поверхность и соответствующую малеимидную функционализованных мишень, будь то другой белок, флуоресцентный краситель, хромофор или синтетический полимер.

Protocol

Примечание: Следующий протокол предназначен для синтеза биоконъюгата белок-краситель , как показано на рисунке 1 Это общий протокол для реакции малеимид со свободной поверхностью на цистеин , содержащие белки, с примечаниями , вставленный , где это применимо , чтобы помочь с мембранным бе?…

Representative Results

Синтез биоконъюгатов подтверждается тремя основными способами: Matrix-лазерной десорбцией ионизацией времени пролета масс – спектрометрии (MALDI-TOF – MS), электрофорез в полиакриламидном геле, и видимой области ультрафиолетового (УФ-видимой) спектроскопии, как показано на <st…

Discussion

Очистка исходных материалов до того, как биоконъюгации имеет первостепенное значение. Белки, полученные из коммерческих рекомбинантных источников часто содержат другие изоформы белка, представляющего интерес, который может иметь различную химию поверхности и реакционной способнос?…

Disclosures

The authors have nothing to disclose.

Acknowledgements

We thank the Australian Research Council (ARC) for ARC Future Fellowship (FT120100101) and ARC Centre of Excellence CE140100036) grants to P.T. and the Mark Wainwright Analytical Centre at UNSW for access to mass spectrometry and NMR facilities.

Materials

sodium dihydrogen phosphate Sigma-Aldrich 71496
sodium hydroxide Sigma-Aldrich 71691
sodium chloride Sigma-Aldrich 73575
cytochrome c, from saccaromyces cerevisiae Sigma-Aldrich C2436
dithiothreitol Sigma-Aldrich 43819
TSKgel SP-5PW Sigma-Aldrich Tosoh SP-5PW, 07161 3.3 mL strong cation exchange column
Amicon Ultra-15  Merck-Millipore UFC900308 3.5 kDa spin filter
Slide-A-Lyzer mini dialysis units Thermo Scientific 66333 3.5 kDa dialysis cassetes
Ru(II) bisterpyridine maleimide Lab made see ref (14)
acetonitrile Sigma-Aldrich A3396
ethylenediaminetetraacetic acid Sigma-Aldrich 03609
tris(2-carboxyethyl)phosphine hydrochloride  Sigma-Aldrich 93284
imidazole Sigma-Aldrich 56749
nickel acetate Sigma-Aldrich 244066
AcroSep IMAC Hypercell column Pall via VWR: 569-1008 1 mL IMAC column
0.2 micron cellulose membrane filter Whatman Z697958 47 mm filter for buffers
0.2 micron PVDF membrane filter Merck-Millipore SLGV013SL syringe filters for proteins
hydrochloric acid Sigma-Aldrich 84426 extremely corrosive! Use caution
caffeic acid Sigma-Aldrich 60018 MALDI matrix
trifluoroacetic acid Sigma-Aldrich 91707 extremely corrosive! Use caution
SimplyBlue SafeStain Thermo Scientific LC6060 Coomassie blue solution
NuPAGE Novex 12% Bis-Tris Gel Thermo Scientific NP0342BOX precast protein gels
SeeBlue Plus2 Pre-stained Protein Standard Thermo Scientific LC5925 premade protein ladder
NuPAGE LDS Sample Buffer (4X) Thermo Scientific NP0008 premade gel sample buffer
NuPAGE Sample Reducing Agent (10X) Thermo Scientific NP0004 premade gel reducing agent
NuPAGE MES SDS Running Buffer (20X) Thermo Scientific NP0002 premade gel running buffer
Voyager DE STR MALDI reflectron TOF MS Applied Biosystems
Acta FPLC GE Fast Protein Liquid Chromatography
Cary 50 Bio Spectrophotometer Varian-Agilent UV-Vis
Milli-Q ultrapure water dispenser Merck-Millipore ultrapure water
Low volume UV-Vis Cuvette Hellma 105-201-15-40 100 microliter cuvette

References

  1. Griffin, B. A., Adams, S. R., Tsien, R. Y. Specific covalent labeling of recombinant protein molecules inside live cells. Science. 281, 269-272 (1998).
  2. Sletten, E. M., Bertozzi, C. R. Bioorthogonal chemistry: Fishing for selectivity in a sea of functionality. Angew. Chem. Int. Ed. 48, 6974-6998 (2009).
  3. Lyon, R. P., Meyer, D. L., Setter, J. R., Senter, P. D. Conjugation of anticancer drugs through endogenous monoclonal antibody cysteine residues. Meth. Enzymol. 502, 123-138 (2012).
  4. Natarajan, A., Xiong, C. Y., Albrecht, H., DeNardo, G. L., DeNardo, S. J. Characterization of site-specific ScFv PEGylation for tumor-targeting pharmaceuticals. Bioconjug. Chem. 16, 113-121 (2005).
  5. Hvasanov, D., et al. One-Pot Synthesis of High Molecular Weight Synthetic Heteroprotein Dimers Driven by Charge Complementarity Electrostatic Interactions. J. Org. Chem. 79, 9594-9602 (2014).
  6. Thordarson, P., Le Droumaguet, B., Velonia, K. Well-defined protein-polymer conjugates–synthesis and potential applications. Appl. Microbiol. Biotechnol. 73, 243-254 (2006).
  7. Lutz, J. F., Börner, H. G. Modern trends in polymer bioconjugates design. Prog. Polym. Sci. 33, 1-39 (2008).
  8. Nicolas, J., Mura, S., Brambilla, D., Mackiewicz, N., Couvreur, P. Design, functionalization strategies and biomedical applications of targeted biodegradable/biocompatible polymer-based nanocarriers for drug delivery. Chem. Soc. Rev. 42, 1147-1235 (2013).
  9. Wong, C. K., et al. Polymersomes Prepared from Thermoresponsive Fluorescent Protein-Polymer Bioconjugates: Capture of and Report on Drug and Protein Payloads. Angew. Chem. Int. Ed. , 5317-5322 (2015).
  10. Hermanson, G. T. . Bioconjugate Techniques. , (2013).
  11. Li, J., Xu, Q., Cortes, D. M., Perozo, E., Laskey, A., Karlin, A. Reactions of cysteines substituted in the amphipathic N-terminal tail of a bacterial potassium channel with hydrophilic and hydrophobic maleimides. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 99 (18), 11605-11610 (2002).
  12. Peterson, J. R., Smith, T. A., Thordarson, P. Synthesis and room temperature photo-induced electron transfer in biologically active bis(terpyridine)ruthenium(II)-cytochrome c bioconjugates and the effect of solvents on the bioconjugation of cytochrome c. Org. Biomol. Chem. 8, 151-162 (2010).
  13. Borges, C. R., Sherma, N. D. Techniques for the Analysis of Cysteine Sulfhydryls and Oxidative Protein Folding. Antioxid. Redox Signal. (3), 1-21 (2014).
  14. Peterson, J. R., Thordarson, P. Optimising the purification of terpyridine-cytochrome c bioconjugates. Chiang Mai J. Sci. 36 (2), 236-246 (2009).
  15. Hvasanov, D., Mason, A. F., Goldstein, D. C., Bhadbhade, M., Thordarson, P. Optimising the synthesis, polymer membrane encapsulation and photoreduction performance of Ru(II)- and Ir(III)-bis(terpyridine) cytochrome c bioconjugates. Org. Biomol. Chem. 11 (28), 4602-4612 (2013).
  16. Signor, L., Boeri Erba, E. Matrix-assisted Laser Desorption/Ionization Time of Flight (MALDI-TOF) Mass Spectrometric Analysis of Intact Proteins Larger than 100 kDa. J. Vis. Exp. , e50635 (2013).
  17. Foucher, M., Verdière, J., Lederer, F., Slonimski, P. P. On the presence of a non-trimethylated iso-1 cytochrome c in a wild-type strain of Saccharomyces cerevisiae). Eur. J. Biochem. 31, 139-143 (1972).
  18. Müller, M., Azzi, A. Selective labeling of beef heart cytochrome oxidase subunit III with eosin-5-maleimide. FEBS Lett. 184 (1), 110-114 (1985).
  19. Shen, B. Q., et al. Conjugation site modulates the in vivo stability and therapeutic activity of antibody-drug conjugates. Nat. Biotechnol. 30 (2), 184-189 (2012).

Play Video

Cite This Article
Mason, A. F., Thordarson, P. Synthesis of Protein Bioconjugates via Cysteine-maleimide Chemistry. J. Vis. Exp. (113), e54157, doi:10.3791/54157 (2016).

View Video