The sensitivity enhancement provided by dissolution dynamic nuclear polarization (DNP) enables following metabolic processes in real time by NMR and MRI. The characteristics and performances of a dedicated dissolution DNP setup designed for study enzymatic reactions are discussed.
המגבלה העיקרית של חקירות מבוססות NMR היא רגישות נמוכה. זו מבקש לזמני רכישה ארוכים, ובכך למנוע מדידות NMR בזמן האמת של טרנספורמציות מטבולית. Hyperpolarization באמצעות פירוק DNP עוקף חלק הרגישות מנפיק הודות המגנטיזציה הגרעיני מחוץ לשיווי משקל הגדול הנובע מהעברת קיטוב אלקטרון אל גרעין ספין. אות התמ"ג הגבוהה המתקבלות ניתן להשתמש כדי לפקח על תגובות כימיות בזמן אמת. החסרון של hyperpolarized NMR מתגורר בחלון הזמן הקצר העומד לרשותם לרכישת אות, שהיא בדרך כלל בסדר גודל של קבוע זמן רגיעת אורך הספין הגרעיני, T 1, או, במקרים חיוביים, על הסדר קבוע הרפית הזמן הקשורים את סינגלט של גרעינים מצמידים, T LLS. ספיגת הסלולר של מולקולות אנדוגני קצב חילוף חומרים יכולה לספק מידע חיוני על התפתחות גידולים ותגובת תרופה. נומחקרים תמ"ג הקודם merous hyperpolarized הוכיחו את הרלוונטיות של פירובט כמו מצע מטבולית לניטור הפעילות האנזימטית in vivo. מחקר זה מספק תיאור מפורט של הגדרת הניסוי ושיטות נדרש לחקר תגובות אנזימטיות, בפרט ההמרה פירובט אל לקטט שיעור בנוכחותו של לקטט דהידרוגנאז (LDH), על ידי התמ"ג hyperpolarized.
קיטוב גרעיני דינמי (DNP), 1,2 טכניקה שנועדה לשפר את הקיטוב הספין הגרעיני, כלומר, את חוסר האיזון בין "למעלה" ו "למטה" אוכלוסיות ספין (P = [↑ N – N ↓] / [N ↑ + N ↓]), הוצג לראשונה בשנת 1950. ספינים גרעיניים כגון 13 C יכולים להיות מקוטב עד P = 10 -1 בתנאים נוחים, בדרך כלל בטמפרטורה בסדר גודל של 1 K וב שדה המגנטי של 3.357 ט 3,4 פריצת דרך עבור יישומים ביולוגיים הגיעה 2000 מוקדם של עם התפתחות הפירוק DNP אשר מורכב המסת דגימות קפואות מקוטבות שחון מים תוך שמירה על רמת הקיטוב הגרעינית הגבוהה מתקבלת בטמפרטורה נמוכה. 5 האות נוזל מדינת התמ"ג מוגבר על ידי גורם 10 3 -10 4 לעומת מְשׁוּתָףתרמית מקוטב תנאי NMR RT. פירוק DNP ולכן מספק דרך שיעורי תגובה הלא פולשני ביוכימיים מידה באתרו בזמן אמת, ומאפשר דינמיקת ניטור ידי NMR עם רזולוציה זמנית של 1 שניות או פחות – 6. 10 כמו כן ניתן היה לזהות analytes בריכוזים נמוכים מאוד 11.
בין שיטות הדמיה מולקולרית לא פולשנית, hyperpolarized תמ"ג היא הטכניקה היחידה שמאפשרת מדידה בו זמנית מצע ומוצרי מטבולית שלה בזמן אמת. DNP הפירוק התקבל בהתלהבות התחומים מדעיות שונים, החלו במבחנת תמ"ג ל- MRI הקליני 12 ואת היישומים המבטיחים ביותר קשורים הניטור באתרו של חילוף חומרים. 13,14 המגבלה העיקרית של DNP הפירוק היא, שאחרי זמן על הסדר חמש פעמים בזמן הרגיעה האורכת T 1 מתמיד, משופרת קוטבization הולך לאיבוד. לכן, יש להשתמש מולקולות נושאות ספינים גרעיניים מפגין ארוך יחסית T 1. כדי להאריך את תוחלת זמן של שיפור הקיטוב, לאט-מרגיע במצבי ספין גרעיני, המכונה מדינות חיים ארוכים (LLS), ניתן להשתמש 15 -. 17 LLS יהיו רגישים האינטראקציה דיפול דיפול התוך-זוג, כך שלהם זמן הרפיה מאפיין קבוע, T LLS, יכול להיות הרבה יותר זמן מאשר T 1. 18 חיים שלמים המגנטיזציה של עשרות דקות עד שעה 1 יכול אפוא להיות מושגת, 19,20 ו LLS הוצעו שני ספקטרוסקופיה בתהודה מגנטית (MRS) ו- MRI. 21
עיקרי כי צריך להיות מותאם בקפידה ללימוד שיעורי התגובה האנזימטית ידי NMR hyperpolarized הם: (i) למקסם את הקיטוב מצב מוצק ו (ii) למזער את ההפסד הקיטוב במהלך ההעברה של הפתרון hyperpolarized מןמקטב אל ספקטרומטר התמ"ג. מאמר זה מתאר את התאמת מנגנון DNP פירוק מחוייט הזרקת מערכת ללמוד תגובות אנזימטיות. המאפיינים והביצועים של ההתקנה יהיו הפגינו עם מצע hyperpolarized הידוע ו-בשימוש נרחב [1 13 C] פירובט. הסיבות עיקריות לבחירה זו הן, ראשית, שלה ארוכה טבעי 13 זמן הרגיעה האורך C (T 1> 50 שניות על שדות וטמפרטורות מגנטיים גבוהים מעל 293 K) המאפשרות תגובות ניטור במהלך כמה דקות, ושנית, תפקידה המרכזי מטבוליזם סרטן. 13,14 שימוש פירוק DNP NMR ומערכת הזרקה מותאמת אישית שפותח, החמצון של פירובט מזורזת על ידי לקטט דהידרוגנאז (LDH) ניתן לנטר בנוכחותו של ברכה ראשונית של לקטט נטולות-תווית 9,22 או ללא לקטט נטולות-תווית הוסיף , כפי שמוצג כאן. הוכח כי האות [1- 13 C] לקטט נמדד viVO (כולל בתאים) בעקבות ההזרקה [1- 13 C] פירובט hyperpolarized נובע בעיקר חילוף תווית מהירה בין פירובט ומיניק ולא לייצור חומצת חלב. 6
אנו בזאת להציג את הייצור בזמן אמת של [1- 13 C] לקטט מ hyperpolarized [1- 13 C] פירובט מוזרק לתוך צינור NMR המכיל LDH אבל בתחילה לא לקטט.
תיאור מערכת
ישנם שני חלקים עיקריים בתוך התקנת DNP פירוק (איור 1): מקטב DNP ואת ספקטרומטר התמ"ג. המרכיב העיקרי של מקטב DNP הוא cryostat קירור המדגם לכ 1 K באמבט הליום שאוב. Cryostat מוכנס מגנט superconductive 3.35 T ויש לו גיאומטריה שמבטיחה יש המדגם מקטב על isocenter של המגנט (איור 1). בתוך cryostat, המדגם (א) מוקף סליל NMR (ב), כדי למדוד את b הקיטובuildup, כלול חלל מיקרוגל overmoded (ג). המדגם כולו נשמר בטמפרטורה נמוכה באמבט הליום שאוב (ד) ו- מוקרן עם מיקרוגל דרך מוליך הגל. המערכת כולה מנוהלת באמצעות תוכנת מחוייט (איור 2 ד).
החומרה וציוד קריוגני הדרושים לביצוע DNP והתפרקותה לאחר מכן הם עדיין אתגר טכנולוגי. Cryostat DNP חדש 23,24 פותח ונבדק כדי לקבוע הופעות קריוגני שלה ולאחר מכן אופטימיזציה עבור מגניב למטה מהר, הליום להחזיק במשרה וצריכת הליום מינימלית הכוללת במהלך המבצע.
Cryostat מורכב משני חלקים. החלק הראשון של cryostat הוא דיואר הבידוד (איור 2 א) כי ניתן להפריד בערך חלק עליון (א) הזנב, או מרחב המדגם (ב), ואת תא הוואקום החיצוני (OVC) כל זמן תחת גבוה ואקום הדיור מסכי קרינה (ג). החלק השני של cryostat הוא ראשי בבהלבשה (איור 2 ב), להציב לתוך דיואר בידוד, שבו כל התקנות זרימת מנוהלים. ההליום הנוזלי מאגף דיואר האחסון החיצוני דרך קו ההעברה (א), נמצא בשלב הראשון המרוכז ב המפריד (ב), תא ביניים משמש הוא כדי לשמור על החלק העליון של קור cryostat וכדי להסיר את הליום התאדה במהלך ההעברה. הלחץ המפריד הוא הוריד על ידי שאיבה באמצעות נימים (ג) עטופות סביב החלק העליון של cryostat; זרימת הליום קר נימים זה משמשת כדי לצנן את המתסכל (ד) ומסכי קרינת דיואר הבידוד (OVC). המדגם מושם ומקוטבת במרחב המדגם. חלל המדגם מחובר אל מפריד דרך נימים אחרות (ה), עטוף סביב הזנב של כנס cryostat הראשי. נימי זה יכול להיות פתוח או סגור דרך שסתום מחט פעלו באופן ידני מבחוץ.
כדי להשיג את הטמפרטורה הנמוכה שימוש במהלך יח"צ DNPocess, הליום נוזלי צריך להיות שנאספו במרחב מדגם cryostat והלחץ שלה הוריד לטווח mbar. הפעילות דרושה לפעולה cryostat מבוצעת באמצעות מערכת שאיבה מורכבת למדי עם שלושה סטים של משאבות, פיקוח ומופעלים בנקודות שונות עם מכשירים אלקטרוניים ואלקטרו-מכונאי (איור 2 ג). OVC cryostat צריך להישאב אל ואקום גבוה על ידי מערכת השאיבה הראשונה. מערכת זו מורכבת משאבה טורבו-מולקולרית מגובים על ידי משאבה סיבובית (א). ההליום הנוזלי מועבר מן דיואר אחסון (ב) דרך כניסת קו העברת cryostat אל מפריד cryostat. המפריד יש פורקן ומחובר למכשיר השאיבה השנייה. קבוצה זו מורכבת משאבת קרום 35 מ '3 / hr (ג). קו זה מאפשר הסרת גז הליום מבושל במהלך ההעברה מן דיואר ובמהלך קירור מפריד. ההליום הנוזלי שנאסף מפריד מכן, ניתן להעביר למרחב המדגם דרך הכובעצינורות illary שתוארו לעיל. כדי להעביר הליום נוזלי מן המפריד למרחב המדגם ובהמשך ללחץ מרחב מדגם נמוך יותר mbar טווח, מערכת שאיבה שלישית המורכב 250 מ '3 / שורשים hr משאבה מגובה על ידי המשאבה סיבובית 65 מ 3 / שעה (ד) מחובר cryostat דרך שסתום פרפר ידני (ה).
כל הפעולות במערכת ואקום נשלטים מוסדר על ידי מכשיר מחוייט אלקטרו (f). התקן זה שולט קשרים קו ואקום בין מפריד cryostat (ז) ו- מדגם החלל (ח) שקעים, מערכות שאיבה שנייה / שלישית (ג, ד), בקבוק הליום דחוס (i) וגם מבחוץ. תקשורת בין (ו) ו- מבחוץ עוברת דרך שסתום חד כיווני (j). מכשיר אלקטרו פנאומטי (ו) כמו גם את כל הפרמטרים של המערכת ואת חומרת הפירוק נשלטים ומופעלים על ידי USB ממשק מכשיר האלקטרוני מחוייט עם מחשב משותף. לבסוף כל המערכת, הדרך האלקטרוניתמכשיר, מנוהל באמצעות תוכנה עצמאית מחוייט (איור 2 ד) שבו פעילות רלוונטית משוגרות באמצעות ממשק משתמש כפתורי תוכנה.
כדי לנהל את המדגם ולמדוד תמ"ג אות הצטברות של מצב מוצק סדרה של מוסיף משמשים (איור 3 א). כדי להכין את cryostat עבור קיטוב, למקם את כנס המדגם העיקרי (א), לתוך cryostat. את כנס המדגם העיקרי מסופק עם סליל NMR (ב) ממוקם בתוך חלל מיקרוגל מצופה זהב overmoded. בהקפאה טרום המצע המכיל הפתרון להיות מקוטב (פתרון מקטב) בטמפרטורת חנקן נוזלי במיכל מדגם מתאים ולמקם אותו בתחתית סוף בעל מדגם פיברגלס (ג). החלק את מחזיק המדגם לתוך כנס המדגם העיקרי להגיע isocenter המגנט. הכנס את מוליך גל מצופה זהב (ד) ב בעל מדגם. מוליך גל מאפשר במיקרוגל שנוצר ממקור מיקרוגל חיצוני לנסוע עם t הפסדים מינימלייםo המדגם.
התוכנה מחוייט לניהול cryostat מטפל באופן אוטומטי, לאחר שלחצתי על כפתור ממשק המתאים, פעולות שונות כמו cooldown (הטמפרטורה cryostat הוא הוריד קרוב לטמפרטורת הליום נוזלי), מילוי (את cryostat מתמלא הליום נוזלי לרמה שנקבעה מראש ), צעד נוסף של קירור 1 K ≈ T (באמבטית הליום הנוזלת נשאבת כדי להשיג את הטמפרטורה הנמוכה ביותר האפשרית), שמירת לחץ קבוע (את cryostat בלחץ מעט מעל לחץ בחדר ב- P = 10-30 mbar לאפשר פתיחת cryostat ללא סיכונים זיהום של cryostat בדרך אוויר) והתפרקות (הליך אוטומטי לפזר מדגם DNP ולהעביר פתרון hyperpolarized וכתוצאה לאתר המדידה, כלומר, ספקטרומטר התמ"ג).
הקיטוב מתבצע irradiating המדגם עם מיקרוגל ב 94 GHz (בשדה מקטב B 0 </sUB> = 3.35 T). מדגם נחשב מקוטב לחלוטין לאחר 3 T DNP, שבו T DNP הפעם הצטברות קיטוב. T DNP הוא מאותו סדר הגודל כמו זמן הרגיעה האורך של גרעיני יעד המצב מוצק בשדה הנתון והטמפרטורה. בכל הניסויים שלנו המדגם היה מקוטב במשך יותר מ 5 T DNP.
בסוף הזמן הקיטוב, המדגם צריך להיות מומסים בתמיסה RT כדי לשמש למדידת הפעילות האנזימטית. במהלך תהליך פירוק, 5 מ"ל של שחון D 2 O מן הדוד של הכנס פירוק (איור 3B) נדחפים על ידי גז הליום דחוס (P = 6-8 בר) להגיע המדגם DNP-משופרת לפזר אותו. פתרון hyperpolarized וכתוצאה מכך נדחף החוצה את כנס הפירוק על ידי גז הליום הדחוס, דרך השקע הכנס פירוק (איור 3 ג-ב </sטרונג>), צינור העברת טפלון בקוטר פנימי 2 מ"מ. משך הזמן הנדרש לתהליך הפירוק הוא 300 אלפיות שני. 23 הזמן הנדרש להעברת המדגם המקטב DNP לאתר ספקטרומטר התמ"ג הוא כ -3 שניות.
תהליך הפירוק מתבצע באמצעות הוספה של פירוק (איור 3 ב). את כנס הפירוק מורכב של הרכבה אלקטרונית-פנאומטי (א), מקל סיבי פחמן (ב) המכיל צינורות חיבור בין הדוד באסיפת פנאומטי ואת ההלבשה מיכל המדגם (ג), אשר מאפשר צימוד דליפה חזקה עם מדגם מיכל, ובחזרה אל השקע. הרכבת אלקטרו פנאומטי (איור 3 ג) משמשת לייצור ולנסוע שחון D 2 O באמצעות מקל סיבי פחמן למכל המדגם ולאחר מכן לחלץ את פתרון hyperpolarized מן cryostat. הרכבת אלקטרו פנאומטי מורכבת שסתומי פנאומטיים (א) השולטים קשרים בין השיתוףהליום mpressed (P = 6-8 בר) קו (ב), את הדוד (ג) שבו D 2 O מוזרק דרך שסתום (ד), ולשקע (ה) באמצעות המקל סיבי פחמן (f). המערכת תושלם על ידי G לחץ, מדחום ואת חוט התנגדות חימום בדוד (ג), טריגר (ח) וקופסא חיבור (i) המשמשת ממשק המערכת עם בהתקן ניהול האלקטרוני.
Cryostat DNP ואת ספקטרומטר תמ"ג מחוברים באמצעות קו ההעברה, כלומר, צינור PTFE של 2 מ"מ קוטר פנימי בתוך כשהפתרון hyperpolarized נדחף על ידי הליום דחוס (P = 6-8 בר) כאשר פירוק מופעלת.
רצף פירוק מורכב את הפעולות הבאות: ב -300 אלפיות השניה הראשונה, שחון D 2 O נדחקת מיכל מדגם כדי להמיס להמיס הפתרון קפוא hyperpolarized. לאחר מכן, הפתרון hyperpolarized מופק cryostat ידי מתכוון של פרהsurized (P = 6-8 בר) גז הליום ודחף דרך הצינור PTFE בקוטר 2 מ"מ פנימי (איור 3 ג-ה) לאתר המדידה שבו ההזרקה מבוצעת עם באחד הליכים מתוארים שלב 6.2.1 או שלב 6.2 .2.
המרכיב השני של התקנת פירוק DNP NMR הוא ספקטרומטר התמ"ג. ב ההתקנה כפי שיתואר בהמשך, ספקטרומטר תמ"ג פועל בשדה B 0 = 11.7 טסלה. בדיקת NMR 5 מ"מ משמש כדי למדוד את אות hyperpolarized לאחר פירוק. ספקטרומטר תמ"ג מופעל באמצעות קונסולת NMR, המשמש הן מצב מוצק ונוזל-המדינה מדידות תמ"ג, ואת XWinNMR תוכנה המסופקת על המשרד. מדידה טיפוסית מורכבת דופק קשה זווית נמוכה להעיף (מכויל או עבור liquidstate או בלתי מכויל, למדידות מצב מוצק) ואחריו רכישות האות.
מדידות של אות קיטוב תרמית המצב מוצקי נגזרות DNP סיהצטברות gnal מבוצעות באמצעות סליל מחוייט 13 C באתר של מקטב DNP (איור 3Ab) מצמידים את ספקטרומטר תמ"ג. במצב מסוים הזה ספקטרומטר התמ"ג אינו מבצע נעילת אות. כאשר מדידות מצב מוצק מתבצעים, כדי למנוע הפרעות משמעותיות לקיטוב, השהיית הזמן בין הרכישות צריכה להיות ארוכה מספיק, בערך עוד מ -0.5 T DNP.
השיפור במצב מוצק מוגדר אֵיפֹה הוא אות hyperpolarized (שהושג בשלב 3.3) ו הוא האות של מצב מוצק (שהושג בשיווי משקל תרמי בטמפרטורת הליום נוזלי נשאבים פנימה שלב 3.2) (איור 4 א). ד פרמטר זהefines הקיטוב המקסימאלי זמין עבור ניסויי NMR, לפני הפסדים בלתי נמנעים במהלך ההעברה של פתרון hyperpolarized. המדידה מתבצעת עם רצף דופק לרכוש פשוט באמצעות דופק זווית להעיף נמוך un-מכויל. כיול Pulse הוא דילג נפוץ למדידות solidstate.
הליך מקביל ניתן להשתמש כדי לקבוע את שיפור אות hyperpolarized ב-במצב נוזלי. במקרה זה, המדגם להציב צינור ספקטרומטר לפני הזריקה (שלב 6.2) מורכב 500 μl של D 2 O. לאחר פירוק ואת הזריקה, ישנם שני פרמטרים חשובים כדי לפקח. הראשון הוא שיפור hyperpolarized באתר ספקטרומטר תמ"ג, (איור 4B), שם הוא אות רק לאחר הזרקה של Hyper פתרון מקוטב (שהושג בשלב 7.1) ו הוא אות קיטוב התרמי (שהושג בשלב 7.2). השני הוא זמן הרגיעה האורך, 1 T (איור 4 ב ', הבלעה), הקשורים המצע וכל מוצר מטבולית (מתקבל על ידי אותות הולמים מעריכים שהושגו בשלב 7.1). שני פרמטרים אלה מגדירים את ריכוז המצע המינימלי הדרוש כדי לקבל יחס אות לרעש מספיק (SNR) ואת חלון הזמן הפנוי מדידת תמורות מטבולית. היחס בין קיטוב מצב המוצק ואת הקיטוב liquidstate נותן אומדן הפסדי הקיטוב בשל הרפיה במהלך העברת פתרון hyperpolarized. ערךation12 "src =" / files / ftp_upload / 53,548 / 53548equation12.jpg "width =" 80 "/> יש לשים לב בהיעדרו של הפסדים הרפיה.
את הנקודות קריטיות של ניסוי פירוק DNP התמ"ג הם: (i) רמת הקיטוב מושגת עבור המצע, אשר קובע את ריכוז המוצר הנמוך ביותר הדרושה עבור ניסויים כמו גם מספר רכישות אות שניתן לבצע וכן (ii) את תקופות חיים המגנטיזציה, לעומת משך ההעברה בין הקיטוב ואת אתרי איתור לשיעור שינוי מצע. מערכת…
The authors have nothing to disclose.
המחברים מודים ד"ר ג'יי ג'יי ואן דר קלינק על הסיוע בבחירת והרכבה של ציוד, כמו גם ד"ר פ Kateb וד"ר ג Bertho לדיונים מועילים. AC נתמכה על ידי הקרן הלאומית למדע השויצרי (להעניק PPOOP2_157547). אנו מכירים מימון מפריז הסורבון סיטה (NMR @ Com, Analytics DIM, Ville de Paris, מגט de la משוכלל ונדיר Medicale (FRM ING20130526708), ואת Parteneriat הוברט Curien ברנקוזי 32662QK. הצוות שלנו הוא חלק תוכניות Equipex פריז-אן-תהודה ו CACSICE.
DNP polarizer | Vanderklink s.a.r.l (Switzerland) | /// | Cryostat and electronic equipment for sample polarization |
Vacuum system components | Edwards vacuum (France) | Various |
– turbomolecular pumping setup – membrane pumping setup – high capacity roots pumping system – vacuum fittings and components |
DNP 3.35T Magnet | Bruker (France) | ||
500MHz NMR Spectrometer | Bruker (France) | ||
Origin 8.0 | OriginLab (US) | Data analysis software | |
Chemicals | |||
SODIUM PYRUVATE-1-13C, 99 ATOM % 13C | Sigma Aldrich (France) | 490709 | |
ETHANOL-D6, ANHYDROUS, 99.5 ATOM % D | Sigma Aldrich (France) | 186414 | |
4-Hydroxy-TEMPO 97% | Sigma Aldrich (France) | 176141 | |
Deuterium oxide | Sigma Aldrich (France) | 151882 | |
reduced nicotinamide adenine dinucleotide (NADH) | Sigma Aldrich (France) | ||
ethylene-diaminetetraacetic acid (EDTA) | Sigma Aldrich (France) | ||
dithiothreitol (DTT) | Sigma Aldrich (France) | ||
phosphate buffer, pH = 7.0 | Sigma Aldrich (France) | ||
LDH enzyme in | Sigma Aldrich (France) | L-2500 | |
bovine serum albumin, BSA | Sigma Aldrich (France) |