Summary

Высокое разрешение Структурная магнитно-резонансная томография в подкорке человека<I> В Vivo</I> И Посмертный

Published: December 30, 2015
doi:

Summary

Here we present a protocol to determine the minimum number images that needed to be registered and averaged to resolve subcortical structures and test whether the individual layers of the LGN could be resolved in the absence of physiological noise.

Abstract

В центре внимания данного исследования было проверить пределы разрешения структурных МРТ посмертных мозга по сравнению с живой человеческий мозг. Разрешение структурной МРТ в естественных условиях, в конечном счете ограничивается физиологической шума, в том числе пульсации, дыхании и движении головы. Хотя изображения аппаратного продолжает улучшаться, он по-прежнему трудно решить структуры на миллиметровой шкале. Например, первичный визуальный сенсорные пути синапса в латерального коленчатого тела (ЛГН), визуальный контроль реле и ядро ​​в таламуса, который обычно состоит из шести слоев чередующихся монокулярных. Сканирование мозга исследований не смогли надежно различать эти слои из-за их небольшого размера, которые толщиной менее 1 мм.

Разрешающая предел структурной МРТ, в посмертной мозга был протестирован с использованием нескольких изображений в среднем в течение длительного срока (~ 24 ч). Цель в том, чтобы проверить, можно ли было разрешить отдельные лЭлис о ЛГН в отсутствие физиологической шума. Плотность протонов (PD) 1 взвешенное последовательность импульсов был использован с различными разрешение и другие параметры, чтобы определить минимальное количество изображений, необходимых для регистрации и в среднем надежно отличить LGN и другие подкорковых областях. Результаты были также по сравнению с изображений, полученных в живом человеческий мозг. IN VIVO испытуемым сканирования, чтобы определить дополнительные эффекты физиологической шума на минимальном количестве PD сканирований, необходимых для различения подкорковых структур, полезные в клинической практике.

Introduction

Цель этого исследования было проверить пределы разрешения структурных МРТ в отсутствии физиологического шума. Протон плотности (PD), взвешенные изображения были получены в посмертной мозга в течение длительного срока (два ~ 24 сессий ч), чтобы определить минимальное количество изображений, которые должны быть зарегистрированы и в среднем для решения подкорковые структуры. Для сравнения, PD взвешенные изображения были также приобретены в живых людей в течение нескольких сессий. В частности, была поставлена ​​задача выяснить, будет ли это возможно в лучшем случае, чтобы решить все шесть отдельных слоев человеческого LGN, которые примерно 1 мм толщиной (рисунок 1).

Рисунок 1
Рисунок 1. Человеческий наружного коленчатого тела слои. Схема ламинарного структуры LGN. КРУПНОКЛЕТОЧНЫХ (M) слои состоят из большего нейроновразмер ячейки и меньше плотность клеток, которые ответственны за решения движения и курс очертания (слои 1-2, изображается как темно-серый). Parvocellular слои (P) состоят из меньшего размера нейронов и клеток большей плотности клеток, которые отвечают за решение тонкую форму и цвет (слои 4-6, изображенной в светло-серый). Масштабная линейка 1 мм. Рисунок основан на окрашенном человека LGN 12.

Пространственное разрешение в МРТ улучшается, когда размер матрицы увеличивается, и когда полевой зрения (FOV) и толщина среза, уменьшаются. Тем не менее, повышенное разрешение уменьшает отношение сигнал-шум (SNR), который пропорционален объему воксела. SNR также пропорциональна квадратному корню из числа измерений. В живых людей, хотя несколько изображений могут быть приобретены в течение ряда отдельных сессий изображений, окончательное решение будет ограничено физиологического шума, таких как дыхание, кровообращения пульсаций и движения головы.

Высокая-Разрешение (0,35 мм в плоскости вокселы) PD взвешенные сканы были приобретены. PD проверяет повышения серый и белый контраст в таламус 1, и в результате изображение, чтобы свести к минимуму Т 1 и Т 2 последствия. Его изображение зависит от плотности протонов в виде воды и макромолекул, таких как белки и жиры в объеме изображения. Увеличение числа протонов в ткани приводит к более светлому сигнала на изображении из-за более высокой продольной составляющей намагниченности 2.

PD-взвешенные сканы были собраны, так как они обеспечивают более высокую контрастность подкорковых структур с окружающих тканей. Другие контрасты, такие как Т1 и Т2-взвешенных изображениях привести к трудности в разграничении подкорковые структуры, как в LGN-за небольших соотношениях контраст-шум, как определено ƒ 1,3.

Точно так же, более ранние исследования обнаружили, что PD-взвешенные изображения формалина фиксированной посмертных мозги resulteд в высших отличий между контрастными серого и белого вещества по сравнению с Т1 и Т2-взвешенные изображения, которые имели подобные серый и белый интенсивности независимо от того, изображение 3,4. Лежащие в основе биофизических детерминант может объяснить эти различия. T1 (продольного) и T2 (поперечная) времена релаксации протонов водорода зависит от того, как вода движется внутри ткани. Фиксаторы, такие как формалин работе сшивающих белков. Различия между подвижности воды уменьшается между различными типами тканей, когда фиксаторы используются. Снижение контрастности тканей Т1 наблюдалась после фиксации, в то время как различия в относительной плотности протонов в пределах тканях мозга увеличилась с фиксацией, обеспечивая лучший контраст дифференциацию 3, 4.

Предыдущие исследования выявили LGN в ПД-взвешенный сканирования с использованием 1,5 T 5,6,7, и в 3 T сканера 8,9. Очень важно, чтобы получить эти сканирования, чтобы иметь возможность точно выделить степеньЛГН. Для поддержания полного охвата подкорковых ядер в 18 PD-взвешенные срезы были получены в таламус. Каждый том был вновь выбран, чтобы в два раза разрешение 1024 матрицы (0,15 мм в плоскости размер воксела), сцепленных, движение исправлены и усреднены для получения 3D изображение высокого разрешения подкорковых структур. Оптимальное количество БП изображений, необходимых для следующего рецепта ломтик 5, сокращая время сканирования до менее чем 15 мин в живых людей. Только 1 PD изображений требуется четко разграничить подкорковых областях в посмертном мозге, уменьшая время сканирования до менее чем 3 мин (рис 2 и 3).

Целый формалином фиксированной вскрытие образец мозг сканируется от женщины, которая умерла от остановки сердца в возрасте 82 лет. Обзор медицинских записей показал, что она была: хроническая обструктивная болезнь легких, стенокардия, тройной шунтирование 8 лет до смерти, рак матки обрабатывают гистерэктомии7 лет до смерти, гиперлипидемии, глаукомы, катаракты и хирургии. Вскрытие образец мозг погружения фиксировали в 10% нейтральном формалине с буфером по крайней мере 3 недели при 4 ° С c.The посмертной мозга был отсканирован с тем же протоколом изображения, а также с другими параметрами в течение многих часов для сравнения качества изображения , Только оптимизированные параметры будут описаны в протоколе.

Protocol

1. Участник и Посмертный Мозг настройки Примечание: Все изображения были получены с использованием 3 T томограф с катушкой головки 32-канала и всех сканирования МРТ проводили при комнатной температуре, примерно 20 ° C. Все участники были правой рукой и дали письменное информированное с?…

Representative Results

После того, как подкорки назначают в таламус, PD взвешенные изображения собраны в окне выбора среза (рис 4). ОСШ улучшена путем увеличения количества средних и в посмертных и в естественных сканирования. Чтобы определить качество изображения, ОСШ из разных средних сканиров?…

Discussion

Это исследование описывает оптимизированный протокол в приобретении и методики анализа с целью получения высокого разрешения PD взвешенные изображения подкорковых областей. Ряд параметров сканирования были проверены и изменены с наиболее значимых, относящихся к размеру матрицы, раз…

Disclosures

The authors have nothing to disclose.

Acknowledgements

The authors acknowledge the following funding sources, the Natural Sciences and Engineering Research Council of Canada (NSERC), the Dorothy Pitts Research Fund (NG), and the Nicky and Thor Eaton Research Fund. The authors acknowledge Kevin DeSimone, and Aman Goyal and for their knowledge in MRI acquisition and analysis expertise.

Materials

Magnetom Trio 3T  MRI Siemens (Erlangen, Germany).
Vacuum cushion hand Siemens Mat No: 4765454 Manufactured by: Johannes-Stark-Stk. 8 D-92224 Amberg

References

  1. Devlin, J. T., et al. Reliable identification of the auditory thalamus using multi-modal structural analyses. NeuroImage. 30 (4), 1112-1120 (2006).
  2. Fellner, F., et al. True proton density and T2-weighted turbo spin-echo sequences for routine MRI of the brain. Neuroradiology. 36 (8), 591-597 (1994).
  3. Schumann, C. M., Buonocore, M. H., Amaral, D. G. Magnetic resonance imaging of the post-mortem autistic brain. J Autism Dev Disord. 31 (6), 561-568 (2001).
  4. Tovi, M., Ericsson, A. Measurements of T1 and T2 over time in formalin-fixed human whole-brain specimens. Acta Radiol. 33 (5), 400-404 (1992).
  5. Fujita, N., et al. Lateral geniculate nucleus: anatomic and functional identification by use of MR imaging. Am J Neuroradiol. 22 (9), 1719-1726 (2001).
  6. Bridge, H., Thomas, O., Jbabdi, S., Cowey, A. Changes in connectivity after visual cortical brain damage underlie altered visual function. Brain. 131 (6), 1433-1444 (2008).
  7. Gupta, N., et al. Atrophy of the lateral geniculate nucleus in human glaucoma detected by magnetic resonance imaging. Br J Opthalmol. 93 (1), 56-60 (2009).
  8. Dai, H., et al. Assessment of lateral geniculate nucleus atrophy with 3T MR imaging and correlation with clinical stage of glaucoma. Am J Neuroradiol. 32 (7), 1347-1353 (2011).
  9. McKetton, L., Kelly, K. R., Schneider, K. A. Abnormal lateral geniculate nucleus and optic chiasm in human albinism. J Comp Neurol. 522 (11), 2680-2687 (2014).
  10. Jenkinson, M., Bannister, P., Brady, M., Smith, S. Improved optimization for the robust and accurate linear registration and motion correction of brain images. NeuroImage. 17 (2), 825-841 (2002).
  11. Dietrich, O., Raya, J. G., Reeder, S. B., Reiser, M. F., Schoenberg, S. O. Measurement of signal-to-noise ratios in MR images: influence of multichannel coils, parallel imaging, and reconstruction filters. J Magn Reson Imaging. 26 (2), 375-385 (2007).
  12. Andrews, T. J., Halpern, S. D., Purves, D. Correlated size variations in human visual cortex, lateral geniculate nucleus, and optic tract. J Neurosci. 17 (8), 2859-2868 (1997).
  13. Pfefferbaum, A., Sullivan, E. V., Adalsteinsson, E., Garrick, T., Harper, C. Postmortem MR imaging of formalin-fixed human brain. NeuroImage. 21 (4), 1585-1595 (2004).

Play Video

Cite This Article
McKetton, L., Williams, J., Viviano, J. D., Yücel, Y. H., Gupta, N., Schneider, K. A. High-resolution Structural Magnetic Resonance Imaging of the Human Subcortex In Vivo and Postmortem. J. Vis. Exp. (106), e53309, doi:10.3791/53309 (2015).

View Video