Here we describe a simple method for the isolation of spatially distinct murine colonic epithelial surface cells from the underlying crypt-base cells.
The colonic mucosal tissue provides a vital barrier to luminal antigens. This barrier is composed of a monolayer of simple columnar epithelial cells. The colonic epithelium is dynamically turned over and epithelial cells are generated in the stem cell containing crypts of Lieberkühn. Progenitor cells produced in the crypt-bases migrate toward the luminal surface, undergoing a process of cellular differentiation before being shed into the gut lumen. In order to study these processes at the molecular level, we have developed a simple method for the microdissection of two spatially distinct regions of the colonic mucosa; the proliferative crypt zone, and the differentiated surface epithelial cells. Our objective is to isolate specific crypt and surface epithelial cell populations from mouse colonic mucosa for the isolation of RNA and protein.
Il rivestimento epiteliale del colon è un tessuto altamente rigenerativa, con le cellule staminali residenti rifornire il tessuto ogni pochi giorni 1. Questo processo di rigenerazione richiede il mantenimento di un compartimento staminale proliferativa. Nel corso del tempo, le cellule figlie nuova produzione perdono il loro potenziale proliferativo e migrano verso la superficie luminale dell'intestino. In coincidenza con la migrazione, le cellule progenitrici differenziarsi in enterociti-barriera che formano mature o cellule caliciformi che producono muco. Fallimento di questo programma differenziazione è pensato per contribuire alla compromissione barriera epiteliale, come si osserva nella malattia infiammatoria intestinale e del colon 2,3.
Studio dettagliato dei processi di cui sopra richiede metodologie per isolare le popolazioni cripta-base e delle cellule di superficie. Esistono metodi multipli, ciascuno con vantaggi e svantaggi. Gli attuali metodi per l'isolamento delle cellule epiteliali intestinali includono chagenti elating e dissociazione meccanica, con conseguente isolamento di intere cripte, fogli epiteliali, o cellule singole, dipendenti condizioni sperimentali 4,5. Questi sono metodi ad alto rendimento, ma i cambiamenti nella segnalazione intercellulare sono stati riportati in queste condizioni, che non possono rappresentare l'ambiente nativo 6,7. Microdissezione laser consente la raccolta di materiale spaziale distinte, ma realizza bassa resa 8,9 molecolare. Nel tessuto del colon umano, metodi criosezionamento orizzontali di serie sono stati sviluppati 10. Tuttavia, mucose murini sono proibitivamente piccole per appropriazione diretta di questa tecnica. Negli esseri umani, le lunghezze cripta intestinale (la distanza tra la cripta-base e cellule di superficie), nel colon varia tra ~ 100-1.000 micron 11. Nei topi, le lunghezze cripta sono tra ~ 50-300 micron (vedi Figura 1A). Le piccole dimensioni delle cripte murine rappresenta una sfida per l'isolazione di queste due popolazioni cellulari che utilizzano protocolli esistenti.
Descriviamo ora un basso costo, il metodo ad alto rendimento per l'isolamento di cripta-base e la superficie popolazione di cellule epiteliali nel tessuto del colon murino. Tissue raccolti in questo modo può poi essere analizzato da un certo numero di applicazioni a valle standard, tra immunofluorescenza, RT-PCR (Real Time-Polymerase Chain Reaction) o western blotting.
I meccanismi molecolari coinvolti nella proliferazione delle cellule epiteliali del colon e la differenziazione sono poco conosciute. Questo include lacune nella nostra comprensione dell'ambiente segnalazione cellulare del compartimento di cellule staminali alla base delle cripte epiteliali del colon. Vi è anche un crescente interesse per i processi che stanno alla base di differenziazione enterociti. Ad esempio, ha aumentato la comprensione di differenziazione in vivo è necessaria come punto di riferimento per gli studi volti a produrre in vitro sistemi intestinali primarie 16.
La procedura di cui sopra contiene diversi passaggi che richiedono una particolare attenzione. In primo luogo, eliminando i bordi intorno al segmento tessuto congelato (come discusso nella sezione 3.2) è richiesto come i bordi di tessuto riccio durante la dissezione e il congelamento. La mancata spostare questi spigoli risultati è una popolazione mista di cellule superficiali e base cripta. Montaggio il tessuto su una, ottobre blocco livellati pre-raffreddata è anche essenziale. Tsuo protocollo può essere adattato ad altre zone del colon distale modificando il numero di sezioni in ciascun pool. Ad esempio, come mostrato nella Figura 1B, lunghezza cripta mucosa varia tra 150-300 micron. Pertanto, quando si studia la regione tra 4 CM-6 centimetri dall'ano, il numero di sezioni dovrebbe essere aumentato da 15 a 30. È importante sottolineare che questo protocollo non è suggerito per il colon prossimale (7 gli cm-9 cm) a causa di pieghe ( pliche obliquae) che si estendono nel lume rendendo impossibile superficie e la cripta-base celle separate di sezionamento seriale.
Tecniche di sezionamento seriali sono state usate per studiare cripta-base e la superficie popolazioni di cellule epiteliali nell'uomo. Tuttavia, il nostro protocollo aggiunge passaggi aggiuntivi richiesti a causa delle piccole dimensioni del tessuto murino. Proponiamo che il protocollo di cui sopra consentirà la ricerca di cripta-base e la popolazione di cellule epiteliali di superficie nei sistemi geneticamente trattabili mouse. In effetti, le sezioni pool Yield proteine di alta qualità e RNA analisi valle adatto. Le applicazioni future potrebbero includere lo studio delle vie di segnalazione cellulare o immunoprecipitazione della cromatina. Tuttavia, va notato che, come molti dei metodi alternativi descritti sopra, le sezioni ottenute contengono una miscela di cellule lamina propria epiteliali e interstiziali. In conclusione, il protocollo qui descritto fornisce un rapido metodo del rendimento, alta per l'analisi dei processi molecolari in regioni spazialmente distinte della mucosa del colon murino.
The authors have nothing to disclose.
Supported by National Institutes of Health (DK55679, and DK59888 to A.N.). Emory University Integrated Cellular Imaging Microscopy Core of the Winship Cancer Institute comprehensive cancer center grant, P30CA138292, and the Crohn’s and Colitis Foundation of America Career Development award to C.T.C. and Fellowship Award to A.E.F.
Microtome | Leica Biosystems, Nussloch Germany | CM 1510-3 | |
MyiQ real time PCR detector | BioRad | ||
LSM 510 | Carl Zeiss | Confocal microscope | |
Materials | |||
OCT | Tissue-Tek, Sakura Finetek, Torrance CA | 4583 | |
cryo-mold | Tissue-Tek, Sakura Finetek, Torrance CA | 4557 | 25mmx20mmx5mm |
High profile microtome blade | Leica Biosystems, Nussloch germany | 818 | |
GEM industrial blades | American Safety Razor Blades | 62-0314 | |
Sylgard silicon elastomere base | Dow Corning, Midland MI | 3097358 | |
27 1/2 g needle | Becton-Dickinson, Franklin Lakes, NJ | 305109 | pins for dissection |
TRizol | Life Technologies | 15596018 | |
Rneasy | Qiagen | 74104 | |
DNAse | Qiagen | 79254 | |
Reagents | |||
Antibody ZO-1 | Invitrogen | 187430 | |
Antibody KLF4 | Cell Signaling | 4038S | |
Antibody mGAPDH | Sigma | G8795 | |
Antibody Secondary Alexa conjugate | Invitrogen | A11034 | 488 anti-rabbit |
Antibody Secondary HRP conjugate | Jackson | 111/115-001-003 | rabbit/mouse |
Topro-3 | Invitrogen | T3605 | |
HANKs balanced salt buffer | Life Technologies | 14025092 | |
RIPA lysis buffer | 50mM Tris-HCl pH 7.4 150mM NaCl 1% NP40 0.25% Na-deoxycholate | ||
PCR Primers | |||
primer TBP 3' | GGAATTGTACCGCAGCTTCAAA | ||
primer TBP 5' | GATGACTGCAGCAAATCGCTT | ||
primer KLF4 3' | TGTGACTATGCAGGCTGTGGCAAA | ||
primer KLF4 5' | ACAGTGGTAAGGTTTCTCGCCTGT |