Stressresistenz ist eines der Markenzeichen für Langlebigkeit und ist bekannt, genetisch geregelt. Hier entwickelten wir eine unvoreingenommene Hochdurchsatzverfahren für Mutationen, die Stress-Resistenz verleihen in ES-Zellen, mit dem Maus-Modelle für Langlebigkeit Studien entwickeln zu screenen.
Phenotype-driven genetic screens in mice is a powerful technique to uncover gene functions, but are often hampered by extremely high costs, which severely limits its potential. We describe here the use of mouse embryonic stem (ES) cells as surrogate cells to screen for a phenotype of interest and subsequently introduce these cells into a host embryo to develop into a living mouse carrying the phenotype. This method provides (1) a cost effective, high-throughput platform for genetic screen in mammalian cells; (2) a rapid way to identify the mutated genes and verify causality; and (3) a short-cut to develop mouse mutants directly from these selected ES cells for whole animal studies. We demonstrated the use of paraquat (PQ) to select resistant mutants and identify mutations that confer oxidative stress resistance. Other stressors or cytotoxic compounds may also be used to screen for resistant mutants to uncover novel genetic determinants of a variety of cellular stress resistance.
Langlebigkeit hat eine intime Beziehung mit Stressresistenz. Im allgemeinen langlebige Spezies weisen häufig erhöhte Resistenz gegen multiple Stressoren, wie Wasserstoffperoxid, Paraquat (PQ), UV, Wärme und Schwermetalle 1,2. Im Gegensatz dazu erhöhte Empfindlichkeit gegenüber Stress verursacht verkürzten Lebensdauer und / oder eine Krankheit anfälligen Phänotyp zusagen. Die Antioxidationsmittel fang Weg war lange spekuliert worden, eine wichtige Rolle bei der Verleihung Stressresistenz für das Tier zu spielen. Mit wenigen Ausnahmen, Studien aus einer Vielzahl von transgenen Tieren mit Manipulationen in verschiedenen antioxidativen Enzymen (zB SOD) zeigen jedoch, dass die Erhöhung des Oxidationsfänger Enzyme nicht die Lebensdauer oder die Gesundheit Spannweite 3 zu erhöhen. Diese Daten legen nahe, dass die Stressresistenz Merkmal konsequent in langlebigen Tieren beobachtet wird von anderen zellulären Wege noch aufgedeckt werden vermittelt.
Wir nahmen eine unvoreingenommene vornegenetischer Ansatz für Gene, die auf mutierten, eine Stressresistenz-Phänotyp in kultivierten embryonalen Stammzellen (ES-Zellen) verleihen könnten. ES-Zellen bieten zwei wesentliche Vorteile in dieser Studie: (1) anspruchsvolle genetische Manipulationen sind vorhanden, um das Genom von ES-Zellen zu modifizieren; und (2) Stress resistente ES-Zellen aus dem Bildschirm wiedergewonnen können direkt für Maus Produktion verwendet werden, was eine schnelle Übersetzung in ganzen Tierstudien zur Lebenserwartung und Gesundheitsspanne zu messen.
In diesem Bericht beschrieben wir die Verwendung von C9 ES-Zelllinie, in welcher die BLM Allele unter Steuerung durch ein Tetracyclin ansprechende Element. Behandlung von Doxycyclin (DOX) vorübergehend von der Expression von Blm führt zu einer erhöhten Vorfall von Schwesterchromatidaustausch gedreht. Diese kurzfristige Blm Knock-out für die Erzeugung homozygoter Mutationen innerhalb der heterozygote Population erlaubt, so dass rezessive Mutationen für Stressresistenz könnte in das Screening-Verfahren erfasst werden. Wirbeschrieben die Verwendung von piggyBac (PB) Transposon als erbgutverändernd nach dem Zufallsprinzip setzen Sie einen Poly-A-Trap-Kassette (PB-UPA), um Gene in das Genom zu mutieren. Zellen, die mit Unterbrechung eines Gens durch die Poly-A-Falle wurden G418-resistente und konnte zurückgewonnen, so dass eine Sammlung von Gen-Trap-Mutanten (Gen-Trap-Bibliothek) können hergestellt werden, und in der Folge für die mutierten Klone, die Stress resistent waren zu sehen sein.
Stress-resistente Klone von der Selektion gewonnen könnte ziemlich rasch durch molekulare Techniken hinsichtlich der Anzahl von Einfügungen (qPCR) charakterisiert werden, der Ort der Insertion (splinkerette PCR), die Identität der unterbrochene Gen (BLAST) und sein Expressionsniveau ( RT-qPCR). Die PB Einsetzen könnte durch transiente Expression mPB Transposase in dem Klon wieder mobilisiert werden, um die Wildtyp-DNA-Sequenz wieder herzustellen und damit zu testen für den Verlust von Stressresistenz. Diese sind leistungsfähige Möglichkeiten, um die Kausalität der Mutation zu bestätigen, die vor getan werden sollteteure Maus Produktion. Frühere Studien haben gezeigt, dass Zellen, die Stressfaktoren ausgesetzt verloren ihre Pluripotenz 4,5. Somit wird in diesem Protokoll ist die Erhaltung einer Replikatgruppe von mutierten Zellen, die nicht mit Stressoren behandelt werden, würde die für den erfolgreichen Produktions Maus.
Unser Labor hat den C9 ES-Zelllinie und der PB-UPA-Vektor entwickelt, die beide zur Verfügung stehen, um anderen Forschern auf Anfrage. Das Protokoll die hier berichtet wird durch die Erzeugung von de novo Bibliothek von Gen-gefangen ES-Zellen mit PB-UPA (1A), gefolgt von Replika-Plattierung und Streßselektion auf Stress-resistente Klone (1B) zu isolieren, zu starten. Wir haben gezeigt, die Auswahl mit Paraquat, ein potenter Radikalerzeuger innerhalb der Zellen. Praktisch jede zytotoxische Verbindung oder ein Toxin, beispielsweise ER Stressoren (zB Thapsigargin und Tunicamycin), neuronale Oxidationsmittel (zB MPP +, 6-Hydroxy Dopamin und Rotenon), Wärme und SchwerMetalle (zB Cd, Se) könnten mit dem Verfahren geeignet ist, für die jeweiligen resistenten Mutanten auszuwählen.
Forward genetic analysis allows for an unbiased interrogation of the genome for genes responsible for a specific phenotype. This method is very powerful to uncover novel gene functions. It has been widely used in lower organisms but not in mammal, such as the mouse, mainly due to the extremely high cost associated with the infrastructure and logistics that would entail. Here, we moved the genetic screening process to the ES cell culture platform, greatly increasing the efficiency and throughput in generating mutants a…
The authors have nothing to disclose.
We would like to thank the Wellcome Trust Sanger Institute for the gifts of piggyBac transposon and piggyBac transposase. This work was supported by the Butcher grant of Colorado and the NIH R01 AG041801 (W.S.C).
Vector | ||
PB-UPA | ||
mPBase | ||
mPBasePuro | ||
Tissue Culture | ||
500-ml Stericup filters | EMD Millipore | SCGPU05RE |
250-ml Stericup filters | EMD Millipore | SCGPU02RE |
50-ml Steriflip-GV filters | EMD Millipore | SE1M179M6 |
KO DMEM | Life Technologies | 10829-018 |
DMEM | Sigma-Aldrich | D6429 |
FBS | Tissue Culture Biologicals | 104 |
Heat Inactivated FBS | Sigma-Aldrich | F4135-500 |
LIF | EMD Millipore | ESG1107 |
Non-essential Amino Acids | Life Technologies | 11140-050 |
GlutaMAX | Life Technologies | 35050-061 |
Pen/Strep | Life Technologies | 15140148 |
β-Mercaptoethanol | Life Technologies | 21985-023 |
Methyl Viologen dichloride (Paraquat) | Sigma-Aldrich | 856177 |
Dimethyl Sulphoxide Hybri-MAX | Sigma-Aldrich | D2650 |
EmbryoMAX 0.1% gelatin | EMD Millipore | ES006B |
DPBS/Modified | HyClone | SH30028.02 |
0.25% Trypsin-EDTA | Life Technologies | 25200-056 |
T25 Flask | Corning | 353108 |
T75 flask | Corning | 353135 |
100-mm plate | Corning | 353003 |
150-mm plate | Corning | 430599 |
96-well plate | Corning | 3585 |
96-well U-bottom plate | Corning | 3799 |
24-well plate | Corning | 3526 |
50-ml reservoir | Corning | 4870 |
15-ml tubes | VWR International, LLC | 82050-276 |
Primary Mouse Embryonic Fibroblasts | EMD Millipore | PMEF-NL |
DR4 Mouse Embryonic Fibroblasts | Applied StemCell | ASF-1001 |
Mitomycin C | Fisher BioReagents | BP25312 |
Geneticin (G418) | Life Technologies | 11811-023 |
Doxycycline | Fisher BioReagents | BP26531 |
Cryotubes | Thermo Scientific | 377267 |
Centrifuge | Eppendorf | Centrifuge 5702 |
TC10 cell counter | Bio-Rad | |
Counting Slides (for TC10) | Bio-Rad | 1450011 |
Electroporation | ||
Gene Pulser Xcell | Bio-Rad | 1652611 |
Gene Pulser Cuvettes (4 mm gap) | Bio-Rad | 1652088 |
Molecular Biology | ||
Thermal Cycler | Eppendorf | Mastercylcer ep Gradient S |
Puregene Core kit B | Qiagen | 158745 |
Topo-TA Cloning kit | Life Technologies | 450030 |
High Capacity cDNA synthesis kit | Applied Biosystems | 4368814 |
NaCl | Fisher BioReagents | BP358-212 |
100% ethanol | Decon Laboratories, Inc. | 2716 |
Double Processed Tissue Culture Water | Sigma-Aldrich | W3500 |
Sau3A1 | New England BioLabs | R0169L |
T4 DNA Ligase | New England BioLabs | M0202T |
EcoRV | New England BioLabs | R3195S |
96-well Lysis Buffer (Ramires-Solis et al. 1992) | ||
Trizma Base | Sigma-Aldrich | T1503 |
Hydrochloric Acid | Fisher BioReagents | A144-212 |
EDTA | Sigma-Aldrich | E5134 |
N-Lauroylsarcosine sodium salt | Sigma-Aldrich | L5777 |
Proteinase-K | Fisher BioReagents | BP1700 |
Electrophoresis | ||
Mini-Sub Cell GT | Bio-Rad | 170-4469EDU |
LE Agarose | GeneMate | E3120500 |
Ethidium Bromide | Fisher BioReagents | BP1302 |
100 BP DNA Ladder | New England BioLabs | N3231S |
1Kb DNA Ladder | New England BioLabs | N3232S |
2-log DNA Ladder | New England BioLabs | N3200L |