Here, we introduce a method, cocem3D, to unveil the ultrastructure of a specific cell in its native tissue by bridging confocal and serial block-face scanning electron microscopy.
Afbakening van ultrastructuur een cel is van belang voor het begrijpen van zijn functie. Dit kan een ontmoedigende project zeldzame celtypen verspreid gedurende weefsels van diverse celtypen, zoals entero-endocriene cellen van het darmepitheel zijn. Deze gastrointestinale sensoren van voedsel en bacteriën moeilijk te bestuderen omdat ze verspreid zijn onder andere epitheliale cellen bij een verhouding van 1: 1000. Onlangs hebben transgene reporter muizen werden gegenereerd om entero-endocriene cellen te identificeren met behulp van fluorescentie. Een daarvan is het peptide YY-GFP muis. Met deze muis, ontwikkelden we een methode om confocale en serieblok-face scanning elektronenmicroscopie correleren. We noemden de methode cocem3D en toegepast op een specifiek entero-endocriene cellen te identificeren in het weefsel en onthullen ultrastructuur van de cel in 3D. De resolutie van cocem3D volstaat organellen celmembranen identificeren zo klein secretorische blaasjes en te onderscheiden van volume rendering. Cocem3D kan gemakkelijk worden aangepast aan de 3D ultrastructuur andere specifieke celtypen te bestuderen in hun eigen weefsel.
Het leven in een cel vindt plaats in tijd en ruimte. Veranderingen in de tijd worden vaak bestudeerd met behulp van time-lapse microscopie gecombineerd met fluorescentie beeldvormende technieken, zoals super-resolutie microscopie. Ruimte, in het bijzonder de opstelling van organellen binnen een cel of cel-cel interacties, kunnen alleen worden verkregen door een volledige weergave van fijne structuur van de cel. Een volledig overzicht van fijne structuur van een cel kan ook leiden duidelijkheid genomische functie wanneer het genoom beschikbaar is, zoals C. elegans nematode 1 of de platte Placozoa tricoplax adherens 2. Seriële coupes elektronenmicroscopie is nu een reproduceerbaar, tijd efficiënte en minder kostbare aangelegenheid dankzij de ontwikkeling van geautomatiseerde 3D elektronenmicroscopie technologieën zoals serieblok-face scanning elektronenmicroscopie 3 (SBEM).
De noodzaak van structurele informatie te functioneren opheldering is duidelijk door bepaalde cell types indien functie is afhankelijk van fysieke cel-cel interacties, zoals neuronen, glia of sensorische epitheelcellen. We zijn vooral geïnteresseerd ophelderen hoe zintuiglijke signalen van voedingsstoffen in de lumen van het darmkanaal getransduceerd in een elektrisch signaal dat uiteindelijk moduleert begerend gedrag. Het circuit is complex maar begint aan de darmwand onvoldoende opname in contact komen met sensorische epitheelcellen, genaamd entero-endocriene cellen. In tegenstelling tot andere sensorische epitheelcellen, zoals smaak cellen worden entero-endocriene cellen gedispergeerd door het darmepitheel in een verhouding van 1-1000 4-7. Daarom hebben zij moeilijk te identificeren en bestuderen, en gedurende lange tijd zij werden beschouwd als bron van darmhormonen. Maar met de ontwikkeling van cel-specifieke fluorescentie reporter muizen, de complexe sensorische functie van deze cellen is ontstaan. Met behulp van een van deze reporter muizen, een peptide YY-GFP (PyyGFP) muis, vonden we dat enteroendocrine cellen hebben een prominente cytoplasmastaart dat we de naam neuropod. Het uiterlijk van neuropods suggereerde een geconserveerd functie in cel-tot-cel communicatie. Zo redeneerden we dat documenteren de ultrastructuur van de entero-endocriene cel, de functie van neuropods kan worden afgeleid.
De noodzaak om de structuur van een aanhangsel begrijpen een gedispergeerde cel die moeilijk te identificeren is de belangrijkste reden voor de ontwikkeling van een werkwijze voor confocale microscopie en SBEM combineren. De cel plaats werd geïdentificeerd met behulp PyyGFP entero-endocriene cel-specifieke reporter muizen. De methode liet ons toe om het hele ultrastructuur van een entero-endocriene cellen en zijn neuropod documenteren. Binnen neuropods, vonden we structurele kenmerken van neuronale axonen en buiten neuropods, vonden we een fysieke relatie met enterische glia 8. Inderdaad, neuropods bevatten ongeveer 70% van secretoire vesikels suggereert een belangrijke rol bij de secretoire functie van deze cellen. Voortbouwend op destructuurgegevens onlangs vonden we dat door deze neuropods, entero-endocriene cellen en neuronen innerveren de darm vormen een neuro-epitheliale circuit, vergelijkbaar met die van cellen smaak in de tong 8,9.
Het blootleggen van dergelijke functies van gastro-intestinale chemosensory mechanismen vloeide voort uit structurele gegevens verzameld met behulp van deze correlatieve microscopie methode. Wij geloven dat deze methode kan nuttig zijn in andere gebieden van celbiologie, vooral wanneer cellen worden gedispergeerd in de weefsels op een zeer lage verhouding. We verwezen naar de werkwijze correlatieve confocale en serieblok gezicht scanning elektronenmicroscopie in 3D (Cocem3D). De methode bestaat uit de volgende stappen: weefsel dissectie, confocale microscopie, SBEM imaging, SBEM en confocale image correlation en handmatige segmentatie. In vergelijking met andere methoden correlatieve Het concept is vrij eenvoudig omdat de correlatie fysische plaats van chemische.
Gastro-intestinale chemosensation is in opkomst als een spannende nieuwe veld in het biomedisch onderzoek. Dit is voor een groot deel te wijten aan de ontdekking van functionele smaakreceptoren in enteroendocrine cellen 18. Daaropvolgende studies hebben aangetoond dat enteroendocrine cellen brengen specifieke receptoren voor nutriënten, zoals koolhydraten, vetten en aminozuren 5,6,19,20. De katalytische factor van deze ontdekkingen is de ontwikkeling van reporter muizen, waarbij entero-endocriene cellen fluorescerend gelabeld 20. We ontwikkelden een van deze muizen de PyyGFP muis om entero-endocriene cellen van de distale dunne darm en colon 17,21 bestuderen. Deze cellen zijn van belang omdat zij afscheiden PYY en glucagon-achtige peptide-1, die beide induceren van verzadiging 22,23. Op het moment, een compleet ultra-structurele rekening van deze cellen ontbrak, die we geloofden was essentieel voor hun signalering mechanismen te begrijpen.
NHOUD "> Hier beschreven we een visueel een methode om confocale microscopie te overbruggen met SBEM. De methode wordt aangeduid als Cocem3D, die ons toeliet om het volledige ultrastructuur van entero-endocriene cellen te documenteren. We hebben gemeld dat deze cellen hebben een neuropod dat drie- bevat vierde van alle secretoire vesicles 8. In het neuropod er neurofilaments en net als neuronale axons worden neuropods gevoed door enterische gliacellen 8. Belangrijker is echter dat deze neuropods entero-endocriene cellen fysiek aansluiten op neuronen innerveren de darm en colon 9.Een van de sterke punten van cocem3D is de eenvoud. Vermindering van het weefselmonster in een blok dat kan worden afgebeeld door confocale en SBEM vergemakkelijkt de identificatie van een specifieke cel in een weefsel. Secretorische blaasjes en andere organellen kunnen worden geïdentificeerd met gemak op een resolutie van 7 nm / pixel. Omdat de secties in SBEM worden weggegooid, verdere proceszingen van de weefsels om specifieke eiwitten te identificeren is geen optie op dit punt. De ontwikkeling van methoden zoals ATUM 24, waarbij gedeelten van de weefselblokje bewaard, waarschijnlijk de identificatie van specifieke eiwitten in de cel mogelijk maken. Het bepalen van de specifieke locatie van chemosensory receptoren op entero-endocriene cellen essentiële informatie voor de ontwikkeling van antivirale therapieën voor obesitas, omdat entero-endocriene cellen zintuiglijke interface tussen voedsel in de darm en verzadiging in de hersenen.
The authors have nothing to disclose.
Our sincere appreciation is expressed to the following people: Drs. Sam Johnson and Benjamin Carlson of the Duke Light Microscopy Core Facility for their assistance with data visualization software, and Ms. Valerie Lapham and Dr. John M. Mackenzie, Jr. of the Center for Electron Microscopy at North Carolina State University for their advice on electron microscopy. We thank Dr. Elaine B. Bohórquez for her editorial assistance. Authors contributed in the following manner: DVB, SM, and RAL designed experiments and analyzed data. DVB performed experiments and FH performed manual rendering of data. SM is director of Renovo Neural, where SBEM data was acquired. DVB wrote the manuscript and all authors reviewed and edited the final manuscript. This work was supported by NIH grants R01DK091946 and Veterans Affairs grant I01BX002230 to RAL, and F32DK094704, to DVB.
Phosphate buffered saline | Life technologies | 10010023 | |
Heparin sodium salt | Sigma | H4784 | |
Paraformaldehyde | Sigma | 158127 | 4%, freshly made in PBS, final pH 7.4 |
Glutaraldehyde | Sigma | G5882 | |
Dental wax | Electron Microscopy Sciences | 72660 | |
Low-melting agarose | Life technologies | 16520-100 | 5%, freshly made in PBS |
Standard Tissue-Tek Cryomold | Electron Microscopy Sciences | 62534-25 | |
DAPI nuclear stain | Life technologies | D1306 | |
Postively charged glass slides and coverslips | |||
Fine art paintbrush #1 | |||
Cacodylate buffer | Electron Microscopy Sciences | 11650 | |
Tannic acid | Electron Microscopy Sciences | 21700 | |
EMbed 812 kit | Electron Microscopy Sciences | 14120 | |
Liquid releasing agent | Electron Microscopy Sciences | 70880 | |
Liquid silver colloidal | Electron Microscopy Sciences | 12630 | |
CircuitWorks conductive epoxy | ITW Chemtronics | CW2400 | |
Variable flow peristaltic pump | VWR | 70730-064 | |
VT1200S Vibrating blade microtome | Leica | ||
Zeiss 780i confocal microscope | Carl Zeiss | ||
Sigma VP Scanning Electron Microscope | Carl Zeiss | ||
3view system | Gatan | ||
Renovo Neural Inc (Cleveland, OH) | http://www.renovoneural.com | Renovo provides 3d EM services | |
Fiji software | Open access software | ||
Computer station with 16GB of RAM or more | |||
Data visualization software Imaris 7.5 | Bitplane |