We describe a method to establish human enteroids from small intestinal crypts and colonoids from colon crypts collected from both surgical tissue and biopsies. In this methodological article, we present the culture modalities that are essential for the successful growth and maintenance of human enteroids and colonoids.
The epithelium of the gastrointestinal tract is constantly renewed as it turns over. This process is triggered by the proliferation of intestinal stem cells (ISCs) and progeny that progressively migrate and differentiate toward the tip of the villi. These processes, essential for gastrointestinal homeostasis, have been extensively studied using multiple approaches. Ex vivo technologies, especially primary cell cultures have proven to be promising for understanding intestinal epithelial functions. A long-term primary culture system for mouse intestinal crypts has been established to generate 3-dimensional epithelial organoids. These epithelial structures contain crypt- and villus-like domains reminiscent of normal gut epithelium. Commonly, termed “enteroids” when derived from small intestine and “colonoids” when derived from colon, they are different from organoids that also contain mesenchyme tissue. Additionally, these enteroids/colonoids continuously produce all cell types found normally within the intestinal epithelium. This in vitro organ-like culture system is rapidly becoming the new gold standard for investigation of intestinal stem cell biology and epithelial cell physiology. This technology has been recently transferred to the study of human gut. The establishment of human derived epithelial enteroids and colonoids from small intestine and colon has been possible through the utilization of specific culture media that allow their growth and maintenance over time. Here, we describe a method to establish a small intestinal and colon crypt-derived system from human whole tissue or biopsies. We emphasize the culture modalities that are essential for the successful growth and maintenance of human enteroids and colonoids.
El epitelio de revestimiento del tracto gastrointestinal está en constante renovación. Este proceso es activado por la proliferación de las células madre intestinales (SICS) que producen continuamente progenie para reemplazar rápidamente el epitelio intestinal, ya que da la vuelta. El compartimento proliferativo que comprende las ISC se limita a la parte inferior de las criptas. Los ISC dan lugar a la progenie que finalmente diferenciarse en linajes de absorción o secretoras. Salir de la cripta y en el epitelio de las vellosidades o superficie, las células se diferencian progresivamente a medida que migran hacia arriba antes de la exfoliación en el lumen 1. ISC dan lugar a todos los tipos de células epiteliales intestinales incluyendo los enterocitos, células de micropliegues, células enteroendocrinas, células caliciformes, células de mechones y células de Paneth. El colon se caracteriza por criptas alargados compuestos principalmente de colonocitos y células caliciformes, con enteroendocrinas dispersa y células penacho 2.
Ex vivo culsistemas tura constituyen herramienta prometedora para el estudio de mantenimiento ISC y la homeostasis del tejido intestinal. Sin embargo, es difícil confiar en las tecnologías de cultivo de tejidos como condiciones fisiológicas no están completamente la reproducción y el microambiente epitelial menudo alterados 3,4. Un gran avance en el campo de ISC fue el establecimiento de técnicas de cultivo de tejidos para mantener y ampliar los CSI murinos individuales utilizando factores de crecimiento definidos para reemplazar las señales de nicho intestinal normal. Condiciones de cultivo a largo plazo fueron descritos por Sato et al., En el que criptas individuales o células madre aisladas de el epitelio intestinal crecen para formar estructuras epiteliales 3-dimensionales incluyendo múltiples dominios de cripta 5-7. Estas estructuras tridimensionales experimentan eventos de fisión para expandir continuamente. Curiosamente, se producen todos los tipos de células intestinales específicas para el tejido de origen y así se extruyen en un lumen 8. Utilizando modificaciones de este sistema, epitelialesorganoides se pueden generar desde el estómago, intestino delgado y colon. Más específicamente, organoides epiteliales de intestino delgado son enteroids 9, y los de colon son colonoids 9,10. Estos sistemas de cultivo de organoides epiteliales se han utilizado para probar la capacidad de las células individuales aisladas para funcionar como células madre in vitro, probando así la "stemness" de células aisladas 5,6,10-15. Otros investigadores han utilizado ambos enteroids y colonoids para estudiar la función de las células epiteliales individuales 16-21. Así, las culturas enteroide y colonoid pueden utilizarse para evaluar tanto las funciones de madre y de células no tallo y dar una nueva visión de las interacciones celulares fundamentales dentro de los intestinos.
En 2011, Sato y sus colegas generaron cultivo a largo plazo de los organoides epiteliales derivadas de intestino delgado y colon 22,23 humano. Además de las diferencias en la composición de los medios de comunicación, los enteroids epiteliales humanasy colonoids exhiben las mismas características que su homólogo murino. Además, pueden generarse a partir de los tejidos enfermos, tales como el esófago, el adenoma o adenocarcinoma de Barrett, y la fibrosis quística 22,24. Enteroids humanos constituyen un sistema valioso para estudiar intestinal de células madre y la biología de la mucosa epitelial y servir como un novedoso sistema experimental para estudiar la fisiología gastrointestinal normal y anormal 3.
Aquí se describen los métodos para establecer enteroids y colonoids de intestino delgado humano y criptas del colon (Figura 1). En esta revisión metodológica, destacamos la colección cripta de todo el tejido y biopsias. Nos Recapitulemos las modalidades de cultivo que son esenciales para el crecimiento y mantenimiento de enteroids y colonoids humanos y las posibles estrategias experimentales llevadas a cabo por este exitoso modelo.
Este método proporciona un sistema completo de reproducción de linajes epiteliales intestinales y la dinámica epiteliales que constituyen una herramienta útil para estudiar la biología epitelial intestinal. El método presentado en este documento es una adaptación del estudio murino original por Sato y Clevers 22 que resulta eficiente en enteroids humanos y colonoids. Aquí, nos recogieron manualmente las criptas por microdisección para evitar contaminantes celulares. Este método permite una visualización directa de las criptas y conduce a las horas extraordinarias consistencia en comparación con la colección cripta original de "agitación". Otros grupos desarrollaron técnicas similares utilizando enfoques ligeramente diferentes, especialmente la sustitución de la quelación con EDTA con colagenasa 25. Además de las diferencias en la recopilación de cripta, esas técnicas utilizan un medio definido que se requiere para crecer las enteroids humanas en cultivo 22. Para aumentar la eficiencia de crecimiento en la siembra cripta, añadimos un inhibidor de GSK3 (CHIR99021)durante los dos primeros días de 12.
La manipulación del tejido o biopsias es importante y el aislamiento cripta debe realizarse tan pronto como llega el tejido en el laboratorio. Sin embargo, el retraso en el aislamiento y cultivo cripta se podían realizar hasta 24 horas después de la recogida de tejidos (datos no mostrados) como se describe previamente para el tejido murino 26. El tejido intestinal se debe colocar en un tubo cónico completamente lleno con DPBS para evitar la interrupción del tejido y debe mantenerse a 4 ° C. La preparación retardada permite el envío tejido, pero la variación de temperatura se debe evitar durante el transporte. El tiempo total necesario para el cultivo inicial cripta es de aproximadamente 2 horas con 15 a 30 min para procesar el tejido y de 1 a 2 horas para aislar y la placa de la cripta. La microdisección del tejido es un determinante crítico y el predicado de una preparación cripta limpio. Sin embargo, el comunicado de la cripta por agitación manual como se describe en varios protocolos es posible 22,23.
A pesar de las similitudes con el sistema enteroide murino (enteroids), los enteroids humanos requieren moléculas específicas para mejorar y sostener su crecimiento en el tiempo. Los factores de crecimiento, EGF, Noggin, R-espondina se utilizan de manera similar a los organoides epiteliales murinas. Sin embargo, el uso de Wnt-3A es crítica. Hemos observado que la formación, así como la eficiencia de crecimiento es mayor utilizando un medio acondicionado Wnt-3A de la proteína recombinante humana. Al mismo tiempo, hemos demostrado la mejora de las condiciones de cultivo utilizando un inhibidor de la glucógeno sintasa quinasa 3 (CHIR99021) 12. Factores de crecimiento recombinantes podrían ser reemplazadas por Wnt-3A, R-espondina, y Noggin acondicionado medios de comunicación. Una línea de células L Wnt-3A-expresión está disponible comercialmente (ATCC). Otros grupos han desarrollado R-espondina 1- 23,27, Noggin- 19, y Wnt-3A / R-spondin3 / Noggin- 28 líneas celulares que expresan. Dos inhibidores de moléculas pequeñas se utilizan en la cultura mede diámetro y son necesarios para el mantenimiento de la cultura 29. A-83-01 es un inhibidor selectivo de la transformación del factor de crecimiento β y activina / receptores nodal (activina-quinasa como 4, 5, 7) y SB202190 es un inhibidor de la proteína quinasa activada por mitógenos p38 (MAPK). Tanto los inhibidores se han utilizado respectivamente para sostener inducidas pluripotentes células madre de auto-renovación humana y establecer células pluripotentes ingenuos humanos madre 30-32. Además, la nicotinamida, un precursor de la nicotinamida adenina dinucleótido, se requiere para mantener enteroids y expansión colonoids de una manera a largo plazo 22,29.
La quelación con EDTA es un paso importante, ya que determina el rendimiento de la preparación cripta. Hemos tenido éxito con el tratamiento 2 mM EDTA. Sin embargo, la concentración de EDTA se puede modificar desde 2 mM a 15 mM con respecto al tipo de tejido. En ese caso, el tiempo de incubación tiene que ser determinado empíricamente. Después de la placa inicial, la cripta redondeará-up y, finalmente, forman enteroids. Sin embargo, los enteroids o colonoids menudo demuestran un fenotipo "tallo" mediante la formación de esferas con poco o nada de células diferenciadas. En ese caso, la diferenciación se puede iniciar mediante la retirada de Wnt-3A, la nicotinamida y el inhibidor de p38 MAPK. El uso de inhibidores de Notch como DAPT o DBZ ayuda a aumentar la diferenciación dentro de los enteroids 22.
Este modelo recapitula la fisiología intestinal con los eventos de las criptas-ciernes continuas derivadas de un compartimento de células madre, así como dominios epiteliales de las vellosidades similares que contienen tanto de absorción y secretoras diferenciadas linajes. Curiosamente, este sistema no contiene células mesenquimales y utiliza condiciones de medios específicos para cumplir con los requisitos de la señal nicho.
Al igual que el modelo murino, enteroids humanos pueden ser generados a partir de células epiteliales intestinales aislados para poner a prueba la capacidad de estas células para funcionar como una célula madre. SeveRAL estudios han utilizado grupo de marcadores de diferenciación (CD44, CD24 o CD166) y células positivas EPHB2 para enriquecer en células madre con propiedades 12,23,33. Juntos, estos estudios demuestran la utilidad de las culturas enteroids humanos para probar la stemness. Otros investigadores están utilizando este modelo para investigar las enfermedades intestinales, como enfermedades infecciosas diarreicas, la fibrosis quística, o cánceres colorrectales 22,34-37. Estos estudios demuestran que enteroids humanos constituyen un modelo fiable de la enfermedad humana, con la posibilidad de avanzar hacia una proyección personalizada. Enteroids humanos pueden ser modificados genéticamente mediante transfección de ADN o infección con partículas virales 38. Esto proporciona una poderosa herramienta para estudiar las funciones de genes específicos dentro de los organoides epiteliales humanas o mutaciones genéticas correctas. Recientemente, Schwank y sus colegas demostraron la posibilidad de editar el genoma con el sistema CRISPR / Cas9 y corregir la mutación en el gen CFTR que causa acfibrosis ystic 24. Enteroids humanos constituyen un sistema valioso para estudiar intestinal de células madre y la biología de la mucosa epitelial y servir como un novedoso sistema experimental para estudiar la fisiología gastrointestinal tanto normal como anormal.
The authors have nothing to disclose.
We gratefully acknowledge Dr. Hans Clevers (Hubrecht Institute for Developmental Biology and Stem Cell Research, Netherlands) for the kind gift of TOPflash cells.
This project was supported in part by NIH-R01DK083325 (MAH); NIH P30 DK078392 (Digestive Health Center); NIH UL1RR026314 (CTSA).
Name of Reagent | Company | Catalog Number |
Dulbecco’s Phosphate buffered saline Ca2+, Mg2+ free (DPBS) | Life technologies; Gibco | 14190-144 |
Ethylenediaminetetraacetic acid (EDTA) | Sigma-Aldrich | 431788 |
Sorbitol | Fischer Scientific | BP439-500 |
Sucrose | Fischer Scientific | BP220-1 |
Bovine serum albumin (BSA) Fraction V | Fischer Scientific | BP1600-100 |
Gzntamycin/Amphotericin B solution | Life technologies; Gibco | R-015-10 |
Wnt-3A conditionned medium | in house | – |
Advanced DMEM/F12 | Life technologies; Gibco | 12634-028 |
HEPES 1M | Life technologies; Gibco | 15630-080 |
GlutaMAX (glutamine) | Life technologies; Gibco | 35050-061 |
Penicillin-Streptomycin (10,000 U/mL) | Life technologies; Gibco | 15140-148 |
N2 Supplement | Life technologies; Gibco | 17502-048 |
B27 Supplement | Life technologies; Gibco | 17504-044 |
N-Acetylcysteine | Sigma-Aldrich | A9165-5G |
Nicotidamide | Sigma-Aldrich | N0636 |
Matrigel, GFR, Phenol free (basement membrane matrix) | Corning | 356231 |
human recombinant Noggin | R&D | 6057-NG/CF |
human recombinant R-Spondin | Preprotech | 120-38 |
human recombinant EGF | Sigma-Aldrich | E9644-.2MG |
Y-27632 | Sigma-Aldrich | Y0503-1MG |
A-83-01 | Tocris | 2939 |
SB202190 | Sigma-Aldrich | S7067-5MG |
human [Leu]15-Gastrin 1 | Sigma-Aldrich | G9145-.1MG |
CHIR99021 | Stemgent | 04-0004 |
Thiazovivin | Stemgent | 04-0017 |
TrypLE Express Enzyme (1X), phenol red (cell dissociation enzyme) | Life technologies; Gibco | 12605-010 |
Fetal Bovine Serum | Life technologies; Gibco | 10082-147 |
CTS Synth-a-Freeze Medium (freezing medium) | Life technologies; Gibco | A13713-01 |
L Wnt-3A cell line | ATCC | CRL-2647 |
Renilla luciferase assay | Promega | E2710 |
human recombinant Wnt-3A | R&D | 5036-WN/CF |
HEK293 TOPflash cell line | – | – |