We describe a method to establish human enteroids from small intestinal crypts and colonoids from colon crypts collected from both surgical tissue and biopsies. In this methodological article, we present the culture modalities that are essential for the successful growth and maintenance of human enteroids and colonoids.
The epithelium of the gastrointestinal tract is constantly renewed as it turns over. This process is triggered by the proliferation of intestinal stem cells (ISCs) and progeny that progressively migrate and differentiate toward the tip of the villi. These processes, essential for gastrointestinal homeostasis, have been extensively studied using multiple approaches. Ex vivo technologies, especially primary cell cultures have proven to be promising for understanding intestinal epithelial functions. A long-term primary culture system for mouse intestinal crypts has been established to generate 3-dimensional epithelial organoids. These epithelial structures contain crypt- and villus-like domains reminiscent of normal gut epithelium. Commonly, termed “enteroids” when derived from small intestine and “colonoids” when derived from colon, they are different from organoids that also contain mesenchyme tissue. Additionally, these enteroids/colonoids continuously produce all cell types found normally within the intestinal epithelium. This in vitro organ-like culture system is rapidly becoming the new gold standard for investigation of intestinal stem cell biology and epithelial cell physiology. This technology has been recently transferred to the study of human gut. The establishment of human derived epithelial enteroids and colonoids from small intestine and colon has been possible through the utilization of specific culture media that allow their growth and maintenance over time. Here, we describe a method to establish a small intestinal and colon crypt-derived system from human whole tissue or biopsies. We emphasize the culture modalities that are essential for the successful growth and maintenance of human enteroids and colonoids.
אפיתל הרירית של מערכת העיכול הוא בהתחדשות מתמדת. תהליך זה מופעל על ידי התפשטות של תאי גזע במעי (ISCs) אשר ברציפות לייצר צאצאים להחליף במהירות אפיתל במעי כפי שמתברר מעל. תא השגשוג המרכיב את ISCs מוגבל לחלקו התחתון של מאורות. ISCs להצמיח צאצאים שסופו של דבר להתמיין הקליטה או שושלות הפרשה. נע אל מחוץ לקריפטה ועל האפיתל הסיסי או משטח, תאים להבחין בהדרגה כפי שהם נודדים כלפי מעלה לפני הקילוף לתוך הלום 1. ISCs להצמיח כל סוגי תאי אפיתל במעי כוללים enterocytes, תאי microfold, תאי enteroendocrine, תאי גביע, תאי ציצה ותאי פנט. המעי הגס מאופיין מאורות מוארכים מורכבים בעיקר מcolonocytes ותאי גביע, עם enteroendocrine המפוזר ותאי ציצה 2.
Vivo לשעבר רחוב ללא מוצאמערכות מכשור מהוות כלי מבטיח ללימוד תחזוקת ISC והומאוסטזיס רקמת מעי. עם זאת, קשה להסתמך על טכנולוגיות תרבית רקמה כתנאים פיסיולוגיים אינם לשכפל באופן מלא ומייקרו-סביבת אפיתל לעתים קרובות שינה 3,4. התקדמות גדולה בתחום ISC הייתה הקמתה של טכניקות תרבית רקמה כדי לשמור ולהרחיב ISCs העכברי בודד באמצעות גורמי גדילה הגדירו להחליף את אותות נישה מעיים הרגילים. תנאי תרבות לטווח ארוך תוארו על ידי אל סאטו et., שבו מאורות בודדים או תאי גזע מבודדים מאפיתל במעי לגדול כדי ליצור מבני אפיתל 3 ממדים כוללים תחומים כמו קריפטה-מרובים 5-7. מבני tridimensional אלה עוברים אירועי ביקוע להרחיב ברציפות. מעניין, כל סוגי תאי המעיים ספציפיים לרקמת המוצא מיוצרים וגם נמתחים לתוך לומן 8. באמצעות שינויים במערכת זו, אפיתליכול להיות שנוצר organoids מהקיבה, המעי הדק והמעי הגס. באופן ספציפי יותר, organoids אפיתל מהמעי הדק הם enteroids 9, ואלה מהמעי הגס הם colonoids 9,10. מערכות התרבות אלה אפיתל organoid היו בשימוש על מנת לבחון את היכולת של תאים בודדים מבודדים לתפקד כתאי גזע במבחנה, ובכך בודקים את "stemness" של תאים מבודדים 5,6,10-15. חוקרים אחרים השתמשו בשני enteroids וcolonoids ללמוד את הפונקציה של תאי האפיתל פרט 16-21. כך, ניתן להשתמש בתרבויות enteroid וcolonoid להעריך את שני פונקציות הגזע ותאים הלא-גזע ולתת תובנה חדשה אינטראקציות הסלולר יסודיות בתוך המעיים.
בשינה 2011, סאטו ועמיתים נוצרו תרבות לטווח הארוך של organoids אפיתל נגזר ממעי דק ומעי גס אנושיים 22,23. מלבד הבדלים בהרכב תקשורת, enteroids אפיתל האדםוcolonoids להפגין את אותן תכונות כמו עמיתו העכברי שלהם. יתר על כן, הם יכולים להיות שנוצרו מרקמות חולות כגון הוושט, אדנומה בארט או אדנוקרצינומה, וסיסטיק פיברוזיס 22,24. enteroids האנושי מהווה מערכת רבת ערך כדי ללמוד בתאי גזע במעי וביולוגיה רירית אפיתל וישמש כמערכת ניסיונית רומן ללמוד פיזיולוגיה של מערכת העיכול הן נורמלית ולא נורמלית 3.
כאן אנו מתארים שיטות להקים enteroids וcolonoids ממעי דק אנושי ומאורות מעי גס (איור 1). בסקירה מתודולוגית זו, אנו מדגישים את אוסף קריפטה מכל רקמה וביופסיות. אנחנו לשחזר את שיטות התרבות שהם חיוניים לצמיחה והתחזוקה של enteroids האדם וcolonoids והאסטרטגיות הניסיוניות האפשריים שבוצעו על ידי מודל זה מצליח.
שיטה זו מספקת מערכת שלמה להתרבות שושלות מעיים אפיתל ודינמיקת האפיתל המהוות כלי שימושי ללמוד ביולוגיה אפיתל במעי. השיטה המוצגת במסמך זה הותאמה מהמחקר העכברי המקורי על ידי סאטו ו -22 Clevers שיעילות התוצאות בenteroids וcolonoids האנושיים. כאן, אנו ידני הרימו את מאורות ידי microdissection להימנע מכל מזהמים סלולריים. שיטה זו מאפשרת הדמיה ישירה של מאורות ומובילה לשעות נוספות עקביות בהשוואה לאוסף קריפטה המקורי על ידי "רועד". קבוצות אחרות פיתחו טכניקה דומה תוך שימוש בגישות שונות במקצת במיוחד החלפת קלאציה על ידי EDTA עם collagenase 25. מלבד ההבדלים באוסף קריפטה, טכניקה אלה להשתמש בתקשורת מוגדרת שנדרש לגדול enteroids האדם בתרבות 22. כדי להגביר את יעילות צמיחה בזריעת קריפטה, אנו מוסיפים מעכב GSK3 (CHIR99021)ביומיים הראשונים 12.
הטיפול ברקמה או הביופסיות חשוב ובידוד קריפטה צריכה להתבצע בהקדם הרקמה מגיעה במעבדה. עם זאת, בידוד קריפטה מתעכב ותרבות יכולים להתבצע עד 24 שעות לאחר איסוף רקמות (מידע לא מוצג) כפי שתואר לעיל לרקמה עכברית 26. רקמת המעי צריכה להיות ממוקמת בצינור חרוטי מלאים לחלוטין עם DPBS על מנת למנוע פגיעה ברקמות ויש לשמור על 4 מעלות צלזיוס. ההכנה מתעכבת מאפשרת משלוח רקמות אך יש להימנע וריאציה הטמפרטורה במהלך הובלה. הזמן הכולל נדרש לציפוי קריפטה הראשוני הוא כ 2 שעות עם 15 עד 30 דקות כדי לעבד את הרקמה ו1-2 שעות לבודד וצלחת קריפטה. Microdissection של הרקמה הוא הקובע ונשוא קריטיים של הכנת קריפטה נקייה. עם זאת, שחרור קריפטה ביד רועדת, כמתואר בפרוטוקולים שונים אפשרי 22,23.
למרות קווי הדמיון עם מערכת enteroid העכברי (enteroids), enteroids האדם דורש מולקולות ספציפיות כדי לשפר ולשמר את הצמיחה שלהם לאורך זמן. גורמי הגדילה, EGF, Noggin, R-spondin משמשים באופן דומה לorganoids אפיתל העכברי. עם זאת, השימוש בWnt-3A הוא קריטי. שציינו כי ההיווצרות כמו גם את יעילות הצמיחה גדולה באמצעות מדיום מותנה Wnt-3A מאשר חלבון רקומביננטי האנושי. במקביל, הפגנו תנאי תרבות משופרים באמצעות מעכבי של קינאז synthase גליקוגן 3 (CHIR99021) 12. גורמי גדילת רקומביננטי יכולים להיות מוחלפים על ידי Wnt-3A, R-spondin, וNoggin מזגן תקשורת. קו L-תא Wnt-להביע 3A הוא זמין באופן מסחרי (ATCC). קבוצות אחרות פיתחו R-spondin 1 23,27, Noggin- 19, וWnt-3A / R-spondin3 / Noggin- 28 להביע שורות תאים. שני מעכבי מולקולה קטנים המשמשים בתרבותיdia ונחוץ לשמירה על התרבות 29. -83-01 הוא מעכב סלקטיבי של הפיכת β גורם הגדילה וActivin / קולטנים קטרים (כמו Activin-kinase 4, 5, 7) וSB202190 הוא מעכב החלבון kinase מופעל-mitogen p38 (MAPK). שני המעכבים שימשו בהתאמה לקיים אנושי תאי גזע עצמי והתחדשות pluripotent מושרה ולהקים תאים אנושיים נאיביים pluripotent גזע 30-32. כמו כן, nicotinamide, מבשר של dinucleotide nicotinamide אדנין, נדרש לשמור enteroids והרחבת colonoids באופן ארוך טווח 22,29.
קלאציה EDTA הוא צעד חשוב שיקבע את התשואה מהכנת קריפטה. אנחנו כבר מוצלחים עם 2 טיפול mM EDTA. עם זאת, ריכוז EDTA יכול להיות שונה מ2 מ"מ עד 15 מ"מ לגבי הסוג של רקמה. במקרה זה, זמן דגירה צריך להיקבע באופן אמפירי. לאחר הציפוי הראשוני, קריפטה תעגל u-p וסופו של דבר יוצר enteroids. עם זאת, enteroids או colonoids לעתים קרובות להפגין פנוטיפ "גזע" על ידי יצירת התחומים עם לא מעט תאים מובחנים. במקרה זה, בידול יכול להיות יזם על ידי נסיגת Wnt-3A, nicotinamide ומעכב MAPK p38. השימוש במעכבי Notch כגון DAPT או DBZ עוזר לשפר את הבידול בתוך enteroids 22.
מודל זה מסכם את הפיסיולוגיה מעיים עם אירועים מתמשכים ניצנים-קריפטה הנובעים מתא בתאי גזע, כמו גם תחומים כמו אפיתל-סיסי המכילים את שני הקליטה ושושלות הפרשה מובחנת. מעניין, מערכת זו אינה מכילה את כל תאי mesenchymal ומשתמשת תנאי תקשורת ספציפיים כדי לעמוד בדרישות אות נישה.
כמו המודל העכברי, יכול להיות שנוצר מתאי אפיתל במעי מבודדים enteroids אדם כדי לבדוק את יכולתם של תאים אלה לתפקד כתאי גזע. Seveמחקרי RAL השתמשו מקבץ של סמני בידול (CD44, CD24 או CD166) ותאים חיוביים EPHB2 להעשיר לתאים עם תכונות גזע 12,23,33. יחד, מחקרים אלה להדגים את התועלת של תרבויות enteroids אדם לבדיקת stemness. חוקרים אחרים משתמשים במודל זה כדי לחקור מחלות מעיים כגון מחלות זיהומיות שלשולים, סיסטיק פיברוזיס, או סרטן מעי גס 22,34-37. מחקרים אלה מראים כי enteroids האנושי מהווה מודל מחלה אנושי אמין עם אפשרות לנוע לעבר הקרנה אישית. enteroids אדם יכול להיות מהונדס גנטי באמצעות transfection DNA או זיהום בחלקיקים נגיפיים 38. זה מספק כלי רב עוצמה כדי ללמוד פונקציות גן ספציפי בתוך organoids אפיתל האדם או מוטציות גנטיות נכונות. לאחרונה, שוונק ועמיתים הדגימו את האפשרות לערוך את הגנום עם CRISPR / מערכת Cas9 ולתקן את המוטציה בגן CFTR ac גורםסיסטיק ystic 24. enteroids האנושי מהווה מערכת רבת ערך כדי ללמוד בתאי גזע במעי וביולוגיה רירית אפיתל וישמש כמערכת ניסיונית רומן ללמוד פיזיולוגיה של מערכת העיכול הן נורמלית ולא נורמלית.
The authors have nothing to disclose.
We gratefully acknowledge Dr. Hans Clevers (Hubrecht Institute for Developmental Biology and Stem Cell Research, Netherlands) for the kind gift of TOPflash cells.
This project was supported in part by NIH-R01DK083325 (MAH); NIH P30 DK078392 (Digestive Health Center); NIH UL1RR026314 (CTSA).
Name of Reagent | Company | Catalog Number |
Dulbecco’s Phosphate buffered saline Ca2+, Mg2+ free (DPBS) | Life technologies; Gibco | 14190-144 |
Ethylenediaminetetraacetic acid (EDTA) | Sigma-Aldrich | 431788 |
Sorbitol | Fischer Scientific | BP439-500 |
Sucrose | Fischer Scientific | BP220-1 |
Bovine serum albumin (BSA) Fraction V | Fischer Scientific | BP1600-100 |
Gzntamycin/Amphotericin B solution | Life technologies; Gibco | R-015-10 |
Wnt-3A conditionned medium | in house | – |
Advanced DMEM/F12 | Life technologies; Gibco | 12634-028 |
HEPES 1M | Life technologies; Gibco | 15630-080 |
GlutaMAX (glutamine) | Life technologies; Gibco | 35050-061 |
Penicillin-Streptomycin (10,000 U/mL) | Life technologies; Gibco | 15140-148 |
N2 Supplement | Life technologies; Gibco | 17502-048 |
B27 Supplement | Life technologies; Gibco | 17504-044 |
N-Acetylcysteine | Sigma-Aldrich | A9165-5G |
Nicotidamide | Sigma-Aldrich | N0636 |
Matrigel, GFR, Phenol free (basement membrane matrix) | Corning | 356231 |
human recombinant Noggin | R&D | 6057-NG/CF |
human recombinant R-Spondin | Preprotech | 120-38 |
human recombinant EGF | Sigma-Aldrich | E9644-.2MG |
Y-27632 | Sigma-Aldrich | Y0503-1MG |
A-83-01 | Tocris | 2939 |
SB202190 | Sigma-Aldrich | S7067-5MG |
human [Leu]15-Gastrin 1 | Sigma-Aldrich | G9145-.1MG |
CHIR99021 | Stemgent | 04-0004 |
Thiazovivin | Stemgent | 04-0017 |
TrypLE Express Enzyme (1X), phenol red (cell dissociation enzyme) | Life technologies; Gibco | 12605-010 |
Fetal Bovine Serum | Life technologies; Gibco | 10082-147 |
CTS Synth-a-Freeze Medium (freezing medium) | Life technologies; Gibco | A13713-01 |
L Wnt-3A cell line | ATCC | CRL-2647 |
Renilla luciferase assay | Promega | E2710 |
human recombinant Wnt-3A | R&D | 5036-WN/CF |
HEK293 TOPflash cell line | – | – |