We describe a method to establish human enteroids from small intestinal crypts and colonoids from colon crypts collected from both surgical tissue and biopsies. In this methodological article, we present the culture modalities that are essential for the successful growth and maintenance of human enteroids and colonoids.
The epithelium of the gastrointestinal tract is constantly renewed as it turns over. This process is triggered by the proliferation of intestinal stem cells (ISCs) and progeny that progressively migrate and differentiate toward the tip of the villi. These processes, essential for gastrointestinal homeostasis, have been extensively studied using multiple approaches. Ex vivo technologies, especially primary cell cultures have proven to be promising for understanding intestinal epithelial functions. A long-term primary culture system for mouse intestinal crypts has been established to generate 3-dimensional epithelial organoids. These epithelial structures contain crypt- and villus-like domains reminiscent of normal gut epithelium. Commonly, termed “enteroids” when derived from small intestine and “colonoids” when derived from colon, they are different from organoids that also contain mesenchyme tissue. Additionally, these enteroids/colonoids continuously produce all cell types found normally within the intestinal epithelium. This in vitro organ-like culture system is rapidly becoming the new gold standard for investigation of intestinal stem cell biology and epithelial cell physiology. This technology has been recently transferred to the study of human gut. The establishment of human derived epithelial enteroids and colonoids from small intestine and colon has been possible through the utilization of specific culture media that allow their growth and maintenance over time. Here, we describe a method to establish a small intestinal and colon crypt-derived system from human whole tissue or biopsies. We emphasize the culture modalities that are essential for the successful growth and maintenance of human enteroids and colonoids.
Das Epithel des Magen-Darm-Trakt ist im ständigen Erneuerung. Dieser Prozess wird durch die Proliferation von Darmstammzellen (ISCs), die kontinuierlich zu erzeugen Nachkommen rasch ersetzen das Darmepithel, während es über dreht ausgelöst. Die proliferative Fach, umfassend die ISCs ist an der Unterseite der Krypten beschränkt. Die ISCs ergeben sich Nachkommen, die schließlich in die absorbierend oder sekretorischen Linien zu unterscheiden. Auszug aus der Krypta und auf den Zotten oder Oberflächenepithel, unterscheiden Zellen progressiv, wie sie nach oben wandern, bevor Peeling in das Lumen 1. ISCs ergeben sich alle Darmepithelzellen Zelltypen, einschließlich Enterozyten, microfold Zellen, enteroendokrinen Zellen, Becherzellen, Büschel Zellen und Paneth-Zellen. Der Doppelpunkt wird durch längliche Krypten meist Kolonozyten und Becherzellen zusammengesetzt, mit verstreuten enteroendokrinen und Büschel Zellen 2, dadurch gekennzeichnet.
Ex-vivo-cultur-Systeme bilden vielversprechendes Werkzeug für die Untersuchung ISC Wartung und Darmgewebe Homöostase. Jedoch ist es schwierig, auf Gewebekulturtechniken stützen als physiologischen Bedingungen nicht vollständig wiedergegeben, und die epithelialen Mikro oft verändert 3,4. Ein großer Fortschritt in der ISC-Feld war die Gründung der Gewebekulturtechniken zu erhalten und auszubauen einzelnen murine ISCs mit definierten Wachstumsfaktoren, die normalen Darmnischen Signale zu ersetzen. Langzeitkulturbedingungen wurden von Sato et al., In denen einzelne Krypten oder isolierten Stammzellen aus dem Darmepithel wachsen, um 3-dimensionale epithelialen Strukturen einschließlich mehrerer Krypta-ähnlichen Domänen 5-7 bilden. Diese dreidimensionale Strukturen unterziehen Spaltereignisse kontinuierlich ausbauen. Interessanterweise werden alle Darmzelle spezifisch für die Ursprungsgewebe Typen produziert und ebenso in ein Lumen 8 extrudiert. Verwendung Modifikationen dieses Systems, epithelialeOrganoide aus Magen, Dünndarm und Dickdarm erzeugt werden. Genauer epithelialen Organoiden aus dem Dünndarm sind enteroids 9, und die von dem Dickdarm sind colonoids 9,10. Diese epithelialen organoide Kultursystemen verwendet worden, um die Fähigkeit der isolierten Einzelzellen als Stammzellen in vitro zu funktionieren, damit die Prüfung der "Stammzell-Seins" isolierter Zellen 5,6,10-15 testen. Andere Forscher haben sowohl enteroids und colonoids verwendet, um die Funktion der einzelnen Epithelzellen 16-21 untersuchen. So können enteroid und colonoid Kulturen verwendet, um sowohl Stamm- und Nicht-Stammzellfunktionen zu bewerten und geben neue Einblicke in die grundlegenden zellulären Interaktionen im Darm werden.
Im Jahr 2011, Sato und Mitarbeiter erzeugten Langzeitkultur von Epithelzellen Organoide aus menschlichen Dünndarm und Dickdarm 22,23 abgeleitet. Neben Unterschieden in der Medienzusammensetzung, die menschlichen Epithelzellen enteroidsund colonoids weisen die gleichen Funktionen wie die murine Gegenstück. Weiterhin können sie aus erkrankten Geweben, wie Barrett-Ösophagus, Adenom oder Adenokarzinom und Mukoviszidose 22,24 erzeugt werden. Menschen enteroids eine wertvolle System Darmstammzellen und epithelialen Schleimhaut Biologie zu studieren und als neuartige experimentelle System, um sowohl normale und abnormale Magen-Darm-Physiologie 3 studieren.
Hier beschreiben wir Methoden, um enteroids und colonoids aus menschlichen Dünndarm und Dickdarm Krypten (Abbildung 1) zu etablieren. In diesem methodischen Überprüfung unterstreichen wir die Krypta Sammlung von ganzes Gewebe und Biopsien. Wir rekapitulieren die Kultur Modalitäten, die für die erfolgreiche Entwicklung und Pflege der menschlichen enteroids und colonoids und den von diesem Modell durchgeführt mögliche experimentelle Strategien sind.
Diese Methode bietet ein komplettes System reproduzieren Darmepithelzellen Linien und epithelialen Dynamik, die ein nützliches Instrument, um Darmepithelzellen Biologie studieren bilden. Die hier vorgestellte Methode wurde von der ursprünglichen Maus-Studie, die von Sato und Clevers 22, die effizient führt zu menschlichen enteroids und colonoids angepasst. Hier haben wir von Hand hob die Krypten durch Mikrodissektion, alle zellulären Verunreinigungen zu vermeiden. Diese Methode ermöglicht eine direkte Visualisierung der Krypten und führt zu einer Konsistenz von Überstunden im Vergleich zum ursprünglichen Krypta Sammlung durch "Schütteln". Andere Gruppen entwickelt ähnliche Technik mit leicht unterschiedlichen Ansätze vor allem Austausch der Chelat von EDTA mit Collagenase 25. Neben den Unterschieden in Krypta Sammlung, diese Technik mit einem definierten Medien, die erforderlich sind, um die menschliche enteroids in Kultur 22 wachsen. Um das Wachstum Effizienz bei Krypta Aussaat zu erhöhen, haben wir ein GSK3-Inhibitor hinzufügen (CHIR99021)in den ersten beiden Tagen 12.
Die Handhabung des Gewebes oder Biopsien ist wichtig und die Krypta Isolierung sollte, sobald das Gewebe gelangt im Labor durchgeführt werden. Allerdings könnte verzögert Krypta Isolierung und Kultivierung von bis zu 24 Stunden nach der Gewebesammlung durchgeführt werden (Daten nicht gezeigt), wie zuvor für murinen Gewebe 26 beschrieben. Das Darmgewebe ist in einem konischen Rohr vollständig mit DPBS gefüllte Gewebezerstörung zu vermeiden, und bei 4 ° C gehalten werden, aufgestellt werden. Die verzögerte Vorbereitung ermöglicht Gewebe Verschiffen aber Temperaturschwankungen sollten während des Transports zu vermeiden. Die Gesamtzeit für die ursprüngliche Krypta Beschichtung benötigt wird, ist ca. 2 h bei 15 bis 30 Minuten, um das Gewebe und 1 bis 2 Stunden zu isolieren und die Platte die Krypta zu verarbeiten. Die Mikrodissektion des Gewebes ist ein kritischer Faktor und Prädikat eines sauberen Krypta Zubereitung. Allerdings ist die Krypta Freigabe durch Händeschütteln in verschiedenen Protokolle beschrieben möglich 22,23.
Trotz der Ähnlichkeiten mit dem murinen enteroid (enteroids) System, die menschliche enteroids erfordern spezifische Moleküle zu fördern und zu erhalten ihr Wachstum im Laufe der Zeit. Die Wachstumsfaktoren sind EGF Noggin, R-spondin ähnlich wie die murine Epithelzellen Organoide verwendet. Jedoch ist die Verwendung von Wnt-3A kritisch. Wir haben festgestellt, dass die Bildung als auch die Wachstumseffizienz größer Verwendung eines Wnt-3A konditionierten Medium als das menschliche rekombinante Protein. Begleitend haben wir gezeigt, verbesserte Kulturbedingungen unter Verwendung eines Inhibitors der Glycogensynthasekinase 3 (CHIR99021) 12. Rekombinante Wachstumsfaktoren könnte durch Wnt-3A, R-spondin und Noggin Anlage-Medien ersetzt werden. A Wnt-3A-exprimierenden L-Zelllinie ist im Handel erhältlich (ATCC). Andere Gruppen haben R-spondin 1- 23,27, Noggin- 19 entwickelt und Wnt-3A / R-spondin3 / Noggin- 28 exprimierenden Zelllinien. Zwei kleine Molekül-Inhibitoren sind in der Kultur verwendet michdia und sind für die Aufrechterhaltung der Kultur 29 notwendig. A-83-01 ist ein selektiver Inhibitor des transformierenden Wachstumsfaktors β und Activin / Nodal Rezeptoren (Activin-like kinase 4, 5, 7) und SB202190 ist ein p38 mitogen-aktivierte Proteinkinase-Inhibitor (MAPK). Beide Inhibitoren wurden jeweils verwendet, um menschlichen induzierten pluripotenten Stammzellen Selbsterneuerung zu erhalten und die menschliche naiv pluripotenten Stammzellen 30-32 etablieren. Auch Nicotinamid, ein Vorläufer von Nicotinamidadenindinucleotid, ist erforderlich, um enteroids und colonoids Expansion in einer langfristigen Weise 22,29 aufrechtzuerhalten.
Die EDTA-Chelat ist ein wichtiger Schritt, da sie die Ausbeute von Krypta Zubereitung bestimmt. Wir waren mit 2 mM EDTA Behandlung erfolgreich. Jedoch können EDTA-Konzentration von 2 mM bis 15 mM in Bezug auf die Art des Gewebes, modifiziert werden. In diesem Fall muss die Inkubationszeit empirisch ermittelt werden. Nach der ersten Beschichtung wird die Krypta runden-up und bilden schließlich enteroids. Allerdings sind die enteroids oder colonoids zeigen oft einen "Stamm" Phänotyp durch Bildung von Kugeln mit wenig bis gar keine differenzierten Zellen. In diesem Fall kann die Differenzierung durch Abziehen Wnt-3A, Nicotinamid und das p38-MAPK-Inhibitor ausgelöst werden. Die Verwendung von Notch-Inhibitor, wie DAPT oder DBZ hilft Verbesserung der Differenzierung innerhalb der enteroids 22.
Dieses Modell rekapituliert die Darmphysiologie mit kontinuierlichen Krypta-angehende Ereignisse, die sich aus einer Stammzelle Fach sowie villus artigen epithelialen Domänen, die sowohl Absorptions- und sekretorischen differenzierten Linien. Interessanterweise hat das System keine mesenchymalen Zellen enthalten, und ein bestimmter Datenträger verwendet Bedingungen, um die Nische Signalanforderungen zu erfüllen.
Wie das Mausmodell kann menschliche enteroids aus isolierten Darmepithelzellen erzeugt werden, um die Kapazität dieser Zellen als Stammzellfunktion zu testen. Several Studien Cluster von Differenzierungsmarker (CD44, CD24 oder CD166) und EPHB2 positiven Zellen verwendet werden, um Zellen mit Stamm Eigenschaften 12,23,33 bereichern. Zusammen zeigen diese Studien zeigen die Nützlichkeit der menschlichen enteroids Kulturen zum Testen der stemness. Andere Forscher sind mit diesem Modell zu Darmerkrankungen wie infektiöse Durchfallerkrankungen, zystische Fibrose, oder Darmkrebs 22,34-37 zu untersuchen. Diese Studien zeigen, dass das menschliche enteroids bilden eine zuverlässige menschlichen Krankheitsmodell mit der Möglichkeit, auf eine persönliche Vorführung zu bewegen. Menschliche enteroids genetisch modifiziert werden unter Verwendung von DNA-Transfektion oder Infektion mit Viruspartikeln 38. Dies bietet ein leistungsfähiges Werkzeug, um Gen-spezifische Funktionen innerhalb der humanen epithelialen Organoide oder richtige genetische Mutationen zu untersuchen. Vor kurzem Schwank und Kollegen gezeigt, die Möglichkeit, das Genom mit dem CRISPR / Cas9 System bearbeiten und korrigieren Sie die Mutation des CFTR-Gens verursacht acystic Fibrose 24. Menschliche enteroids eine wertvolle System Darmstammzellen und epithelialen Schleimhaut Biologie studieren und dienen als neue experimentelle System, sowohl normale als auch abnormale gastrointestinalen Physiologie zu untersuchen.
The authors have nothing to disclose.
We gratefully acknowledge Dr. Hans Clevers (Hubrecht Institute for Developmental Biology and Stem Cell Research, Netherlands) for the kind gift of TOPflash cells.
This project was supported in part by NIH-R01DK083325 (MAH); NIH P30 DK078392 (Digestive Health Center); NIH UL1RR026314 (CTSA).
Name of Reagent | Company | Catalog Number |
Dulbecco’s Phosphate buffered saline Ca2+, Mg2+ free (DPBS) | Life technologies; Gibco | 14190-144 |
Ethylenediaminetetraacetic acid (EDTA) | Sigma-Aldrich | 431788 |
Sorbitol | Fischer Scientific | BP439-500 |
Sucrose | Fischer Scientific | BP220-1 |
Bovine serum albumin (BSA) Fraction V | Fischer Scientific | BP1600-100 |
Gzntamycin/Amphotericin B solution | Life technologies; Gibco | R-015-10 |
Wnt-3A conditionned medium | in house | – |
Advanced DMEM/F12 | Life technologies; Gibco | 12634-028 |
HEPES 1M | Life technologies; Gibco | 15630-080 |
GlutaMAX (glutamine) | Life technologies; Gibco | 35050-061 |
Penicillin-Streptomycin (10,000 U/mL) | Life technologies; Gibco | 15140-148 |
N2 Supplement | Life technologies; Gibco | 17502-048 |
B27 Supplement | Life technologies; Gibco | 17504-044 |
N-Acetylcysteine | Sigma-Aldrich | A9165-5G |
Nicotidamide | Sigma-Aldrich | N0636 |
Matrigel, GFR, Phenol free (basement membrane matrix) | Corning | 356231 |
human recombinant Noggin | R&D | 6057-NG/CF |
human recombinant R-Spondin | Preprotech | 120-38 |
human recombinant EGF | Sigma-Aldrich | E9644-.2MG |
Y-27632 | Sigma-Aldrich | Y0503-1MG |
A-83-01 | Tocris | 2939 |
SB202190 | Sigma-Aldrich | S7067-5MG |
human [Leu]15-Gastrin 1 | Sigma-Aldrich | G9145-.1MG |
CHIR99021 | Stemgent | 04-0004 |
Thiazovivin | Stemgent | 04-0017 |
TrypLE Express Enzyme (1X), phenol red (cell dissociation enzyme) | Life technologies; Gibco | 12605-010 |
Fetal Bovine Serum | Life technologies; Gibco | 10082-147 |
CTS Synth-a-Freeze Medium (freezing medium) | Life technologies; Gibco | A13713-01 |
L Wnt-3A cell line | ATCC | CRL-2647 |
Renilla luciferase assay | Promega | E2710 |
human recombinant Wnt-3A | R&D | 5036-WN/CF |
HEK293 TOPflash cell line | – | – |