Este método se explica cómo construir y operar un 13 C continua y 15 N isótopo cámara de etiquetado para el uniforme o el etiquetado de tejidos vegetales diferencial. Se discuten los resultados representativos de metabólicas y etiquetado estructural de gerardii Andropogon.
Rastreando los isótopos estables raras a partir de material vegetal a través del ecosistema proporciona la información más sensible acerca de los procesos del ecosistema, desde flujos de CO 2 y la formación de materia orgánica del suelo a pequeña escala de biomarcadores de isótopos estables de sondeo. El acoplamiento de múltiples isótopos estables tales como 13 C con 15 N, 18 O o 2 H tiene el potencial para revelar aún más información acerca de las relaciones estequiométricas complejos durante las transformaciones biogeoquímicos. Isótopos etiquetada material vegetal ha sido utilizado en varios estudios de descomposición de la hojarasca y la formación de materia orgánica del suelo 1.4. A partir de estos y otros estudios, sin embargo, se ha hecho evidente que los componentes estructurales de material vegetal comportan de forma diferente que los componentes metabólicos (es decir, compuestos de peso. Lixiviables de bajo peso molecular) en términos de utilización microbiana y almacenamiento de carbono a largo plazo 5-7. La capacidad para estudiar los componentes estructurales y metabólicaspor separado se incluye una nueva y poderosa herramienta para avanzar en la vanguardia de los estudios biogeoquímicos de los ecosistemas. Aquí se describe un método para producir 13 C y 15 N material vegetal marcado que está marcado ya sea de manera uniforme en toda la planta o marcados de forma diferencial en componentes estructurales y metabólicos vegetales.
A continuación, presentamos la construcción y operación de un 13 C y 15 N continuo cámara etiquetado que se puede modificar para satisfacer diversas necesidades de investigación. Material vegetal uniformemente marcada se produjo por medio del etiquetado continuo desde la germinación hasta la cosecha, mientras que el marcado diferencial se logra mediante la eliminación de las plantas que crecen de las semanas de la cámara antes de la cosecha. Los resultados representativos de crecimiento Andropogon gerardii Kaw demostrar la capacidad del sistema de manera eficiente el material vegetal etiqueta en los niveles previstos. A través de este método que hemos producido material vegetal con un átomo de 4,4% 13 C y 6,7% de átomos 15 </ Sup> etiqueta de la planta N uniforme, o material que es diferencialmente marcado hasta en un 1,29% de átomos de 13 C y 0,56% de átomos 15N en su metabolismo y componentes estructurales (componentes residuales de agua caliente de agua extraíble y caliente, respectivamente). Desafíos mienten para mantener la temperatura adecuada, humedad, concentración de CO 2, y los niveles de luz en un recipiente hermético 13 C-atmósfera de CO2 para la producción vegetal éxito. Esta descripción de cámara representa una herramienta útil de investigación para producir efectivamente de manera uniforme o diferencial multi-isótopo material vegetal etiquetado para su uso en experimentos en los ciclos biogeoquímicos de los ecosistemas.
Comprender la dinámica de los procesos de la planta-suelo-atmósfera es fundamental para predecir con precisión cómo el global del carbono (C) y nitrógeno (N) Ciclos de funcionamiento en condiciones ambientales actuales y futuros. Los isótopos estables son herramientas poderosas en los estudios cuantitativos de la planta-suelo-atmósfera N ciclismo C y. Rastreando los isótopos estables raras a partir de material vegetal a través del ecosistema proporciona información sensible en los estudios de los ciclos biogeoquímicos, de flujos de CO 2 y el suelo la formación de materia orgánica a pequeña escala de biomarcadores de isótopos estables de sondeo por ejemplo 4,8,9. Combinando C etiquetado 13 con 15 N etiquetado, u otros isótopos estables, tales como 2 H o 18 O en el tejido vegetal proporciona una alta detección, trazable sustrato y complejo para su uso en estudios de acoplados de la planta y la bioquímica del suelo. La capacidad para etiquetar de manera uniforme o diferencialmente anuncio material vegetal estructural y metabólicads aún más la capacidad para hacer frente a cuestiones complejas sobre C y N en bicicleta por los ecosistemas. El beneficio del uso de marcado con isótopos material vegetal en los estudios cuantitativos de la contabilidad de C y N, sin embargo, depende de la capacidad para producir 13 C y 15 N material marcado que es ya sea de manera uniforme o marcados de forma diferencial.
El etiquetado de isótopos se ha utilizado en estudios relacionados con la planta C y la asimilación de N 10, la asignación de 11 y rhizodeposition 12. Material vegetal marcado uniformemente 13 C y 15 N proporciona un complejo sustrato marcado para los estudios de descomposición de la hojarasca 1,4, formación de materia orgánica del suelo 2,6, CO 2 emisiones 4, Estudios Alimentarios web del suelo 13, y estudios de suelo C los tiempos de residencia del suelo 2,14. Los estudios que utilizan 13 biochar C marcada del material vegetal etiquetado también están comenzando a revelar nueva información sobre antiguamente por altopiscinas carac suelo 15. Mientras que 15 N, 2 H, y 18 O etiquetado son relativamente fáciles de lograr a través de tratamiento de agua y fertilizantes, existe el reto en la producción de material vegetal uniformemente 13 C etiquetados a través de 13 C-fijación de CO 2.
El etiquetado de isótopos continua desde plántulas hasta la madurez en una cámara sellada produce el etiquetado de isótopos uniforme en toda la planta. Otros métodos, como el etiquetado repetida de pulsos 16 y la aplicación foliar o mecha 17,18 no producen material vegetal isótopo marcado uniformemente, ni claro etiquetado diferencial de C-compuestos específicos (por ejemplo metabólico vs estructural) 19. Una consideración importante en el etiquetado de isótopos está etiquetado de la eficiencia, debido al alto costo de los compuestos enriquecidos de isótopos raros utilizados en el etiquetado. Aunque el etiquetado 13 C en continuo se ha utilizado en el pasado 2-4,20, no hay a nuestro conocimientouna publicación descripción técnica detallada de una cámara de etiquetado continuo con la evidencia de la eficacia alta el etiquetado y el control preciso de la cantidad y uniformidad de etiquetado de isótopos.
En la vanguardia de la descomposición de la hojarasca y el suelo de investigación formación de materia orgánica es el concepto de que el material vegetal metabólica (es decir lixiviables, compuestos de peso molecular lábiles, bajos) y material vegetal estructural (es decir. Lignina, celulosa, hemicelulosa) se procesan de forma diferente en términos de microbios eficiencia en el uso, la formación de materia orgánica del suelo, como a largo plazo del carbono del suelo de almacenamiento 5-7. El material vegetal que está marcado diferencialmente en sus componentes estructurales y metabólicas, por lo tanto, es una herramienta útil en la promoción de descomposición de la hojarasca y el suelo investigación formación de materia orgánica. Etiquetado diferencial con isótopos duales permite el seguimiento de los componentes estructurales y metabólicas por separado a través del ecosistema utilizando un isótopo techniqu múltiples piscinae 21.
El etiquetado de isótopos continua con 13 C y otros isótopos en una cámara sellada requiere una cuidadosa atención a plantar condiciones fisiológicas para maximizar la productividad de la planta y la eficiencia etiquetado de isótopos. Picos de temperatura durante el día deben ser controlados para evitar daños a las plantas cuando crecen en una cámara hermética. Se requiere un rango óptimo de humedad y de temperatura para mantener estomas de la planta abierta y absorción de CO 2 22. Los altos niveles de humedad causa el empañamiento de las paredes de la cámara, lo que minimiza la disponibilidad de luz y puede dañar la estructura de la cámara. La consideración cuidadosa y el isótopo etiquetado de eficiencia mediante la eliminación de los isótopos naturales de abundancia de la cámara (por ejemplo, procedentes de plantación en macetas con la materia orgánica del suelo) y la prevención de la exposición al aire exterior es importante cuando se trabaja con un isótopo pesado compuestos marcados caros.
A continuación, presentamos un método para la construcción y operación de unadual continuo 13 C y 15 N isótopo cámara de etiquetado para la producción de material vegetal que está marcado ya sea de manera uniforme o tiene sus componentes estructurales y metabólicos marcados en niveles distintos. C etiquetado 13 se controla en el nivel de la cámara, mientras que la fertilización y 15 N etiquetado es vigilada en el plano bote individual. Los resultados representativos se muestran para demostrar la capacidad de este método para controlar la temperatura, humedad, y concentración de CO 2 a lo largo de la temporada de crecimiento. Los resultados de crecimiento gerardii Andropogon, Kaw también demuestran la capacidad de este método para producir material vegetal de manera uniforme o diferencialmente etiquetados. El esquema específico diseño de la cámara y la operación descrita se puede modificar para crecer diferentes especies de plantas, así como para acomodar 2 o H 18 O etiquetado.
Este diseño para una cámara de etiquetado de isótopos continua se utilizó para producir de manera uniforme y diferencialmente 13 C y 15 N etiquetada A. gerardii para su posterior campo y experimentos de laboratorio. Durante tres temporadas de crecimiento de la operación, la cámara se ha mantenido con éxito la temperatura, la humedad y concentraciones de CO 2 dentro de los parámetros establecidos (Figura 2). La fiabilidad del sistema de control de la temperatura es fundamental durante el pico de verano, cuando la alta radiación solar puede causar un sobrecalentamiento en la cámara hermética. Eliminar el exceso de humedad causada por la transpiración de las plantas en crecimiento asegura que los estomas de la planta permanezca abierta para la absorción fotosintética 22 y que la condensación de agua no inhibe la penetración de la luz o de dañar la estructura de la cámara.
El monitoreo continuo en la zona de concentración de CO 2 por el software IRGA mantiene continua13 C etiquetado de las plantas durante su crecimiento en la cámara. Debido a la alta actividad fotosintética de A. gerardii creciente en esta cámara, el CO2 se inyecta en el sistema con frecuencia durante las horas del día de la temporada alta de crecimiento cuando la actividad fotosintética dibujó concentraciones de CO 2 a 360 ppm, aproximadamente cada 15 a 20 min. La medición de la abundancia natural enriquecido y 13 C-CO 2 tanques permitidos para un átomo de 4,4% ambiente 13 C controlado a través de la estación de crecimiento para el etiquetado del tejido de la planta uniforme. 13 C-producción de CO 2 también se puede lograr mediante la mezcla de 13-C de sodio bicarbonato o carbonato de 13 C-sodio y ácido clorhídrico, sin embargo, este tipo de sistema es más complicado y requiere más vigilancia y el mantenimiento, por lo que recomendamos el uso de 13 C-CO 2 gas. Una consideración importante para el control de CO 2 concentrations utilizando un IRGA es que los analizadores infrarrojos pierden dos tercios de su sensibilidad en la medición de 13 C-CO 2. Esta subestimación de aproximadamente 2,9% ppm para nuestra mezcla de 4,4% de 13 C-CO 2 no era de gran preocupación para nosotros, pero podría convertirse en un problema más significativo al etiquetar a mayores niveles de 13 C 27.
A. gerardii es una estación cálida tallgrass perennes pradera especies graminoides. El diseño de esta cámara se optimiza para A. producción gerardii (Figura 1). El tamaño y la altura de la cámara se eligieron teniendo en cuenta para la productividad máxima altura de A. gerardii en el campo, así como para la producción de biomasa de la planta deseada para futuros experimentos. A. gerardii es conocida por ser la luz limitada en el campo de 24,25. PAR dentro de un invernadero puede ser disminuida por 30-47% en comparación con los niveles exteriores 26. Desde nuestra plantas se cultivaron en una cámara de vidrio acrílico dentro de un invernadero, la limitación PAR era una preocupación. Cuando se enciende, las luces fluorescentes aumentaron PAR dentro de la cámara de un 9,5%, lo que puede haber contribuido a aumentar la productividad de esta especie sensibles a la luz. Al utilizar este diseño de la cámara de crecer otro tipo de plantas de las necesidades fisiológicas específicas, tales como el tamaño, la iluminación, la demanda de nutrientes, sensibilidad a la temperatura y la humedad del suelo debe ser realizado a medida cuidadosamente para mantener las condiciones óptimas de crecimiento para las plantas.
Cuando se trabaja con compuestos marcados isotópicamente caros, tales como 10% átomo de 13 C-CO 2 y 98% atómico 15 N-KNO 3, la eficiencia de etiquetado es una consideración importante. Este diseño de la cámara optimiza C etiquetado 13, haciendo todos los esfuerzos para sellar la cámara y minimizar las fugas de aire dentro y fuera de la cámara. Si esta cámara no se abre durante la temporada de crecimiento, entonces ninguno de la etiqueta 13 Ced CO 2 de la cámara se filtró a la atmósfera. El CO 2 se acumule durante la respiración durante la noche no parece dañar las plantas que crecen y se absorbe rápidamente después de la salida del sol (Figura 2). Durante el etiquetado diferencial, la cámara se abre brevemente para quitar las macetas marcadas diferencialmente, pero esto no parece para diluir el objetivo átomo de 4,4% 13 C etiquetado de las plantas etiquetadas de forma continua (Tabla 1). C etiquetado 13 también se optimizó por la depuración a cabo la aire atmosférico inicial atrapado en la cámara de sellado al. Durante las pruebas preliminares sobre la cámara sin una limpieza inicial de CO 2 en la atmósfera, se midieron las plantas para tener un nivel de 13 C diluida en las primeras hojas producidas que en las hojas posteriores producidos. El matorral inicial de CO 2 en la atmósfera cuando se cierra la cámara parece eliminar este problema al permitir que para el etiquetado 13 C continua desdela germinación hasta la madurez. El mantenimiento de una mezcla para macetas, suelo libre de arena, vermiculita, arcilla y también elimina la abundancia natural de CO 2 la contaminación de la respiración del suelo. La eliminación del suelo desde el sistema no requiere consideraciones de fertilización e inoculación cuidadosas, que puede ser única para diferentes especies de plantas. 15 N etiquetado a través del 7% en átomos solución de N Hoegland 15 dirigida producido material vegetal altamente marcado en 6,7% en átomos de 15 N (Tabla 1). Una ligera dilución de la etiqueta 15 N dirigido puede ser causada por algunos abundancia natural N en la mezcla de tierra o de la inoculación suelo nativo.
Durante la biosíntesis de compuestos, la discriminación natural de 13 C (o 15 N) se produce como resultado de fraccionamiento cinética y la distribución de isótopos no estadística en los compuestos sintetizados. Por lo tanto, en el caso de C, los productos secundarios (por ejemplo, lípidos, compuestos de fenol) generalmente se agotan en 13 C, en comparación con los productos primarios (hidratos de carbono). Esta discriminación natural de 13 C parece persistir también cuando las plantas se cultivan en un ambiente enriquecido 13 C, como se puede ver en la ligera diferencia en átomo de C 13% de los extractos de agua caliente y los residuos de agua caliente de las plantas etiquetadas de manera uniforme (Tabla 1 ). Este fraccionamiento cinética natural es muy pequeño en comparación con el enriquecimiento y no compromete la uniformidad del etiquetado.
Etiquetado diferencial de los tejidos vegetales estructurales y metabólicas es una novedosa técnica con posibilidades de estudios superiores de descomposición de la hojarasca, la ecología microbiana y la formación de materia orgánica del suelo. La diferencia de 13 C y 15 N de los extractos de agua caliente y los residuos de agua caliente indica una dilución significativa de 13 C y 15 N en el lixiviables, bajocompuestos de peso molecular (extractos de agua caliente) del material de la planta estructural (residuos de agua caliente) después de 7, 14, y 22 días de etiquetado diferencial (P <0,005). Este etiquetado diferencial de tejidos de la planta se puede utilizar para rastrear el destino de los componentes estructurales y metabólicas separado a través de un ecosistema. El etiquetado diferencial 13 C fue más extremo que 15 N etiquetado diferencial. Esto puede ser debido a la inmediatez de 13 C de dilución cuando la eliminación de las plantas de la atmósfera marcado 13 C-CO 2, mientras que la etiqueta 15 N todavía permanece en la mezcla para macetas durante algún tiempo y 15 N dilución se produce más lentamente. Para obtener más etiquetado diferencial drástica de 15 N, se puede considerar el lavado de las ollas con agua antes de la fertilización abundancia natural durante las últimas semanas de crecimiento fuera de la cámara.
El diseño y el funcionamiento de este continuo 13 </ Sup> C y 15 N sistema de etiquetado para uniforme o diferencial, metabólica y, etiquetado estructural tejido de la planta proporciona un nuevo método para la producción de material vegetal marcado isotópicamente para la investigación avanzada. El diseño y los detalles operativos de esta cámara han sido elegidos por 4,4% de átomos de 13 C y 7% atómico 15 N etiquetado de A. gerardii, pero se pueden adaptar a otros tipos de plantas y los niveles de etiquetado de isótopos. Las condiciones de cultivo descritas aquí deben adaptarse en función del tamaño, temperatura, humedad, luz, agua y nutrientes exigencias de las especies vegetales de interés en particular. Etiquetado con 18 O o 2 H también se puede lograr mediante el etiquetado del agua utilizada en el sistema de riego. El sistema descrito aquí resuelve muchos de los retos de uniforme y diferenciado 13 C etiquetado de material vegetal. Este diseño básico de cámara puede ser utilizado por otros grupos de investigación para producir material vegetal altamente etiquetado para advestudios en la biogeoquímica del ecosistema balanceado.
The authors have nothing to disclose.
Un agradecimiento especial para el Fondo para el crecimiento de las plantas y las instalaciones analítica EcoCore en la Universidad Estatal de Colorado y a los muchos estudiantes y maestros que ayudaron en este proyecto. Este trabajo está financiado por la NSF DEB subvención # 0918482, Necesidades USDA Nacional de Becas, y el fondo Cotrufo-Hoppess para la investigación ecología del suelo.
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