Tegumento mammiferi contiene lipidi solventi estraibili che possono fornire le composizioni chimiche caratteristiche delle singole specie. Questo articolo presenta un metodo di routine per separare ampie classi lipidiche isolate da tessuti tegumentario mediante cromatografia su strato sottile e determinare il profilo triacylglyceride laser desorbimento / ionizzazione spettrometria di massa matrix-assisted tempo di volo.
Il tegumento mammiferi comprende ghiandole sebacee che secernono un materiale oleoso sulla superficie della pelle. Produzione di sebo è parte del sistema immune innato che è protettiva contro i microbi patogeni. Produzione di sebo anomala e la composizione chimica sono anche un sintomo clinico di malattie della pelle specifici. Il sebo contiene una miscela complessa di lipidi, tra cui trigliceridi, che è specie-specifico. Le proprietà chimiche di massima esposti da diversi classi di lipidi ostacolano la specifica determinazione della composizione del sebo. Tecniche di analisi per i lipidi in genere richiedono derivatizations chimici che sono i costi di preparazione dei campioni aumento alta intensità di lavoro e. Questo documento descrive come estrarre lipidi dal tegumento mammiferi, classi di lipidi ampi separati mediante cromatografia su strato sottile, e il profilo dei contenuti triacylglyceride utilizzando la spettrometria di massa matrix-assisted laser desorbimento / ionizzazione di tempo di volo. Questo metodo robusto consente una determinazione direttadei profili triacylglyceride tra specie e individui, e può essere facilmente applicato a qualsiasi gruppo tassonomico di mammiferi.
Tessuti tegumentario mammiferi comprendono l'epidermide, strutture cheratinose (ad esempio capelli e unghie), e delle ghiandole esocrine. Ghiandole esocrine sebacea tipo sono associati con follicoli piliferi, che sono indicate collettivamente come unità pilo-sebaceo 1. Ghiandole sebacee rilasciare un essudato oleoso sulla superficie della pelle denominata sebo. Il sebo è composto in gran parte da glycerolipids (ad esempio trigliceridi [tag]), acili grassi liberi (FFA), esteri di steroli / cera, e squalene. Composizione chimica del sebo è 2 specie-specifico. Oltre ad essere parte del sistema immune innato e modalità funzione antimicrobica 3, lipidi sebacee influenzano importanti processi fisiologici tra cui la perdita per evaporazione dell'acqua attraverso la pelle 4, integrità cellulare e regolazione genica 5, 6 e l'assorbimento del farmaco. Composizioni lipidiche sebacee possono anche servire come marcatori di malattia. Rapporti e quantità di sebacea b Alteredclassi di lipidi stradali sono segni clinici di malattie come l'acne vulgaris 7, 8 forfora, dermatite seborroica 8, asteatosis 9, tra gli altri 10. Tessuti epidermici e asciugacapelli includono profili variabili contenenti steroli e derivati, TAG, FFAs, ceramidi, fosfolipidi e altri componenti lipidici minori. Poiché lipidi tegumentario possono funzionare in processi patologici, determinando differenze di composizione chimica dei TAG tra individui sani e malati può essere utile per la diagnosi clinica di malattia.
I lipidi sono generalmente definiti come composti organici insolubili in acqua con sostituenti sia polare o non polare polari 11. Strutture lipidiche possono essere lunghe catene di idrocarburi, alcani ossigenati (compresi esteri cerosi, FFAs, alcoli, chetoni e aldeidi) o strutture ad anello complesse come il colesterolo 12. Ci sono otto classi principali di lipidi in base alla struttura (FFA, glycerolipids [GL], glicerofosfolipidi [GP], sfingolipidi [SP], lipidi steroli [ST], lipidi prenol [PR], saccharolipids [Sl], e polichetidi [PK]), che presentano una vasta gamma di proprietà chimiche a seconda delle classe 13. A causa della grande variazione delle proprietà chimiche delle classi lipidiche, profilazione diretta senza previa derivatizzazione di molecole lipidiche si desidera. Un metodo emergente nella ricerca lipidi è cromatografia su strato sottile (TLC) in combinazione con matrix-assisted laser desorbimento / ionizzazione spettrometria tempo di volo di massa (MALDI-TOF MS) 14.
MALDI-TOF MS è ampiamente utilizzato nella ricerca proteomica per identificare le proteine e associarli a specifiche sequenze di aminoacidi a causa del molto accurate di massa "impronte digitali" peptide ioni generati dalle proteine tripsina-digerito 15. MALDI-TOF MS può anche essere usato per profilare altre classi di biomolecole, comprese lipidi come TAG 16-18. MALDI è necessario l'utilizzo di una matrice, tipcamente un composto organico che contiene le strutture doppio legame aromatiche e coniugati. Le molecole della matrice servono per trasferire delicatamente l'energia del laser per gli analiti, promuovere il trasferimento di protoni, e produrre singolarmente praticati ioni in fase gassosa 19-21. Gli ioni sono sottoposti ad un campo di alta tensione sotto alto vuoto ed accelerati in un analizzatore di massa TOF dove gli ioni vengono successivamente separati da differenze di velocità che sono proporzionali alle loro rapporti tra massa e carica. Anche molto grandi biomolecole possono essere ionizzati con poca frammentazione, specie da produzione di ioni molecolari singolarmente praticati per l'analisi dello spettro semplificata. La capacità di analizzare molecole lipidiche direttamente senza previa derivatizzazione ha promosso adozione immediata di MALDI-TOF MS nella ricerca lipidomico 18.
Questo articolo presenta un metodo di routine per isolare e analizzare lipidi tegumentario dai capelli, le secrezioni sebacee e plagiopatagium del pipistrello rosso orientale (Lasiurus Borealis). Questo viene utilizzato per determinare le variazioni interspecifici a pipistrello lipidi tegumentario per chiarire il processo della malattia della Sindrome White-Nose (WNS) 22. WNS è una malattia fungina di pipistrelli ed è causata dalla specie psicrofile descritti di recente Geomyces destructans 23-25. WNS ha causato la morte di oltre 5 milioni di pipistrelli della caverna del Nord America e minaccia l'estinzione di specie di pipistrelli vulnerabili, con potenziali impatti economici di miliardi di dollari di danni al settore agricolo 26,27. Per studiare i passaggi in G. destructans infezione, lipidi sono stati estratti dai capelli e ala tessuti di pipistrelli rossi orientali e separati in classi di lipidi di massima mediante TLC per isolare la frazione TAG per la successiva analisi mediante MALDI-TOF MS. TAG contengono catene di acidi brevi e sono facilmente rilevati da MALDI-TOF MS con poca interferenza matrice.
Questo articolo presenta un metodo semplice e robusto per separare ampie classi di lipidi isolati da mammiferi tegumento mediante TLC preparativa e determinazione profili TAG mediante MALDI-TOF MS, senza dispendio di tempo derivatizzazione delle molecole lipidiche. Le fasi critiche produrre spettri qualità di TAG con MALDI-TOF MS seguenti: 1) estrazione di successo del composto con contaminazione minima o ossidazione; 2) separazione sufficiente e l'isolamento mediante cromatografia e 3) ad alta risoluzione e precisione di massa MALDI-TOF MS.
Questo documento viene illustrato il metodo per l'estrazione e la separazione della frazione lipidica neutro dal plagiopatagium del pipistrello rosso orientale per ottenere profili MS TAG. Mentre il presente studio ha utilizzato una specie di pipistrelli (Mammalia: Chiroptera) questi metodi possono essere estesi a studiare i lipidi tegumentario di qualsiasi specie di mammifero. Bat tegumento si caratterizza per essere prevalentemente colesterolo, con minori quantità di TAG, FFAs, squaLene, e steroli / esteri di cera. Rapporti di sebo lipidi nel pipistrelli differiscono dagli esseri umani in che lo squalene è presente in basse quantità (al contrario di fino al 16% nell'uomo), mentre il colesterolo si verifica in rapporti più grandi (1-7% negli esseri umani, ma 26-62% nei pipistrelli) 22 , 31. Capelli umani contengono circa il 3% TAG, mentre i rapporti fino al 28% si trovano in capelli pipistrello rosso orientale. L'estrazione di campioni di lipidi dai pipistrelli è simile per le altre specie. Mentre in questo studio batuffoli di cotone imbevuto di solvente sono usati per rimuovere sebo, si può anche invertire un tubo fiala o campione contenente il solvente sulla superficie del tegumento più volte. Prodotti a nastro specializzati forniscono anche mezzi alternativi per estrarre lipidi di superficie 32. Una parte fondamentale di una corretta estrazione dei lipidi è quello di minimizzare la contaminazione da oli per la pelle. Questo è facilmente realizzabile mantenendo una bottiglia a spruzzo con metanolo e spruzzare tutti i bicchieri e utensili, pulire gli utensili con un fazzoletto tra tutti i campioni e indossando i guanti. Ossidazione of acili polinsaturi è impedito attraverso l'aggiunta di BHT, e dovrebbe essere utilizzato indipendentemente dalla temperatura campioni vengono conservati a.
Analisi di biomolecole di solito richiede un passo cromatografica alle molecole separate di interesse da contaminanti. TLC è usato in questo metodo, che evita requisiti strumentazione per gascromatografia, la cromatografia liquida e richiede meno esperienza tecnica per ottenere risultati affidabili e ripetibili. A seconda della classe di lipidi di interesse, molte diverse fasi mobili possono essere incorporati. Inoltre, l'utilizzo di piastre HPTLC e scansione densitometria può essere utilizzato per ottenere risultati quantitativi. Mentre le variazioni dei metodi di TLC sono troppo numerosi da elencare qui, alcune fasi mobili comuni utilizzati in lipidi TLC includono cloroformio: metanolo: acqua per la separazione dei fosfolipidi e glicolipidi o isooctane: etere etilico per la separazione dei lipidi non-polari 28. In termini di separare TAG da altre classi di lipidi, la H: E: A in modosistema lvent lavora costantemente e fornisce risultati comparabili.
Un altro vantaggio nell'usare TLC è che le bande di interesse possono essere rapidamente profilati mediante MALDI-TOF MS senza previa derivatizzazione degli analiti. In questo studio, la silice viene tolto dalla piastra TLC, e l'analita viene eluito da esso mediante sonicazione in un solvente e successiva centrifugazione per separare l'adsorbente ed evaporazione del solvente di eluizione. In alternativa, matrice può essere applicato direttamente su bande analita separati su lastre TLC e poi direttamente analizzati mediante MALDI-TOF MS 33. Profili di successo, MALDI-TOF MS non si basa su sufficienti preparazione del campione e la competenza dell'operatore con la sintonizzazione e la calibrazione dello strumento. Lo strumento deve essere calibrato ogni giorno con le norme riguardanti molecolare gamma di peso appropriato per le molecole di interesse. La sensibilità e risoluzione adatto (ad es ≥ 10.000) dell'apparecchiatura dovrebbero essere confirmeD al giorno con ACTH.
I costituenti lipidici sebacee presenti sulla superficie del tegumento dei mammiferi possono svolgere un ruolo nella colonizzazione da patogeni batterici / fungini. Pertanto, la conoscenza della composizione chimica tra le specie e gli individui possono fornire indizi sui processi di malattie umane e della fauna selvatica. Differenze intraspecifici tra gli individui malati e sani possono rappresentare segni clinici che aiutano nella individuazione della malattia e la diagnosi. Inoltre, se composti specifici che inibiscono la crescita microbica sono presenti, essi possono essere identificati per l'uso nel trattamento e prevenzione di malattie.
The authors have nothing to disclose.
L'assistenza è stata fornita da Scott Treece, Katelyn Arter, Jeremy Ragsdell, Tony Lamark James, Amy Fischer, Hannah Blair, e Cheyenne Gerdes durante lo sviluppo di metodi di laboratorio. Vorremmo ringraziare la Medina-Bolivar Laboratory (Luis H. Nopo-Olazabal, Arkansas Biosciences Institute) per l'assistenza con TLC scansione densitometria. MALDI-TOF MS utilizzato per questo progetto è stato fornito attraverso il NSF EPSCoR, RII: Arkansas ASSET Iniziativa P3 Center (EPS-0701890) in Arkansas Biosciences Institute. Il finanziamento è stato fornito da una pesca degli Stati Uniti e Wildlife Service / Arkansas State Wildlife Grant, la Nazionale Società Speleologica, e The Center for North American Bat Ricerca e Conservazione presso l'Indiana State University.
Name of the reagent | Company | Catalogue number | Comments (optional) |
Butylated Hydroxytoluene | MP Biomedicals, LLC | 101162 | www.mpbio.com |
TLC Flexible Plates | Whatman | 4410-222 | www.whatman.com |
ACTH | Sigma-Aldrich Chem. Co. | A8346-5X1VL | www.sigmaaldrich.com |
Triolein | Sigma-Aldrich Chem. Co. | 44895-U | |
TLC Lipid Standard | TLC 18-1 | www.nu-chekprep.com | |
MALDI TAG Standard | Nu-Check Prep., Inc. | NIH Code 53B | |
MALDI TAG Standard | Sigma-Aldrich Chem. Co. | 17810-1AMP-S | |
Glass Vials with Teflon Cap | U.S. National Scientific Co. | B7800-2 | www.nationalscientific.com/ |
DHB | Sigma-Aldrich Chem. Co. | 50862-1G-F | |
CHCA | Sigma-Aldrich Chem. Co. | C8982-10X10 mg | |
Sebutape | CuDerm | S100 |