integument יונקים מכיל שומני ממס לחילוץ שיכול לספק אופייני הרכב כימי של מינים בודדים. מאמר זה מציג שיטה שגרתית להפרדת כיתות שומנים רחבות בודדו מרקמות הכסות באמצעות כרומטוגרפיה בשכבה דקה וקביעת פרופיל triacylglyceride ידי ספקטרומטריית בסיוע מטריקס לייזר desorption / יינון הזמן של הטיסה המונית.
Integument היונקים כולל בלוטות החלב שמפרישות חומר שמנוני על פני העור. ייצור החלב הוא חלק ממערכת החיסון המולדת, כי הוא מגן מפני חיידקים פתוגניים. ייצור החלב נורמלי והרכב כימי הם גם סימפטום קליני של מחלות עור מסוימות. החלב מכיל תערובת מורכבת של שומנים, כולל triacylglycerides, אשר הוא מינים ספציפיים. התכונות כימיות רחבות הוצגו על ידי שיעורי שומנים מגוונים לעכב את הקביעה הספציפית של הרכב חלב. שיטות אנליטיות לשומנים בדרך כלל דורשות derivatizations כימי שהם עתירי עבודה ועלויות הכנת מדגם עלייה. מאמר זה מתאר כיצד לחלץ שומנים מintegument יונקים, כיתות שומנים רחבות נפרדות על ידי כרומטוגרפיה בשכבה דקה, ופרופיל תוכן triacylglyceride באמצעות ספקטרומטריית מסת הזמן של טיסת desorption הלייזר בסיוע מטריקס / יינון. שיטה חזקה זו מאפשרת קביעה ישירהשל פרופילי triacylglyceride בין מינים וליחידים, וזה יכול להיות מיושם בקלות לכל קבוצה הטקסונומי של יונקים.
רקמות הכסות של יונקים כוללות את האפידרמיס, מבני keratinous (למשל שיער וציפורניים), ובלוטות אקסוקרינית. בלוטות אקסוקרינית החלב מסוג המשויכות זקיקי שיער, אשר יכונו יחידת pilosebaceous 1. בלוטות החלב לשחרר exudate שומני על פני העור המכונה חלב. החלב מורכב ברובו מglycerolipids ([תגיות] למשל triacylglycerides), acyls שומן חופשי (חומצות שומן חופשיות), אסטרים סטרולים / שעווה, וסקוואלין. ההרכב הכימי של החלב הוא מינים ספציפיים 2. בנוסף להיותו חלק ממערכת החיסון המולדת ומתן פונקציה מיקרוביאלית 3, שומני החלב משפיעים על תהליכים פיסיולוגיים חשובים, כולל ירידה באידוי מים דרך עור 4, יושרת הסלולר ורגולציה של גני 5, וספיגת תרופת 6. קומפוזיציות שומנים החלב יכולות גם לשמש כסמני מחלה. יחסים וכמויות של החלב ב Alteredכיתות שומנים כביש הן סימנים קליניים של מחלות כגון אקנה דלקתי 7, 8 קשקשים, seborrheic dermatitis 8, asteatosis 9, בין יתר 10. רקמות באפידרמיס ושיער כוללות פרופילים משתנים המכילים סטרולים ונגזרים, תגיות, חומצות שומן חופשיות, סרמידים, פוספוליפידים ומרכיבי שומנים קטין אחרים. בגלל שומני הכסות יכולים לתפקד בתהליכי מחלה, קביעת הבדלים בהרכב כימי של תגים בין אנשים בריאים וחולים עשויה להיות שימושית לאבחון קליני של מחלה.
שומנים בדרך כלל מוגדרים כתרכובות אורגניות לא מסיסים במים עם מתמירים או פולריים או פולריים קוטביים 11. מבני שומנים בדם עשויים להיות שרשרות ארוכות פחמימנים, אלקאנים מחומצן (כולל אסטרים שעווה, חומצות שומן חופשיות, כהלים, קטונים ואלדהידים), או מבני טבעת מורכבים כגון כולסטרול 12. ישנם שמונה סוגים עיקריים של שומנים המבוססים על מבנה (חומצות שומן חופשיות, glycerolipids [GL], glycerophospholipids, sphingolipids [SP], שומנים [GP] סטרולים [ST], שומני prenol [יח"צ], saccharolipids [SL], וpolyketides [PK]), אשר תערוכת מגוון רחב של תכונות כימיות בהתאם כיתה 13. בשל השונות הגדולות בתכונות כימיות של כיתות שומנים בדם, פרופיל ישיר ללא derivatization המוקדם של מולקולות שומנים הוא רצוי. שיטה מתהווה אחד במחקר שומנים היא כרומטוגרפיה בשכבה דקה (TLC) בשילוב עם ספקטרומטריית הלייזר desorption בסיוע מטריקס / יינון הזמן של בריחה ההמונית (MALDI-TOF MS) 14.
MALDI-TOF MS נעשה שימוש נרחב במחקר proteomic לזהות חלבונים ולקשר אותם לרצפי חומצות אמינו ספציפיים בשל המסה "טביעות אצבעות" מאוד מדויקות יון פפטיד שנוצרו מחלבונים מתעכל טריפסין 15. גם MALDI-TOF MS יכול לשמש לפרופיל כיתות biomolecule אחרים, כוללים שומנים כגון תגיות 16-18. MALDI דורש שימוש במטריצה, typically תרכובת אורגנית המכילה מבני קשר כפול ארומטיים ומצומדות. מולקולות המטריצה לשרת להעביר בעדינות את האנרגיה של הלייזר לanalytes, לקדם העברת פרוטון, ולייצר טעונים ביחידים יוני גז שלב 19-21. יונים חשופים לשדה מתח גבוה תחת ואקום גבוה ומואץ למנתח המוני TOF שבו יונים מופרדים לאחר מכן על ידי הבדלים במהירויות שאינם פרופורציונליים ליחסי מסה לתשלום שלהם. יכולה להיות מיונן אפילו ביומולקולות גדולה מאוד עם פיצול קטן, בהפקת טעונה ביחידים מיני יון מולקולריים לניתוח ספקטרום פשוטים. היכולת לנתח מולקולות שומנים ישירות ללא derivatization לפני קידמה אימוץ מוכן של MALDI-TOF MS במחקר lipidomic 18.
מאמר זה מציג שיטה שגרתית לבודד ולנתח שומני הכסות מהשיער, הפרשות וplagiopatagium של המחבט האדום במזרח החלב (Lasiurus borealiים). זה משמש כדי לקבוע וריאציות interspecific בשומני הכסות מחבט על מנת להבהיר את תהליך המחלה של תסמונת White-Nose (WNS) 22. WNS הוא מחלה פטרייתית של עטלפים והיא נגרמת על ידי מיני psychrophilic תיארו החדש Geomyces destructans 23-25. WNS גרם למותם של מעל 5 מיליון עטלפים במערה בצפון אמריקה ומאיים על ההכחדה של מיני עטלפים פגיעים, עם השפעות כלכליות פוטנציאליות של מיליארדים דולרים בנזק לתעשייה החקלאית 26,27. כדי לחקור את השלבים בג destructans זיהום, שומנים הוצאו משיער ואגף הרקמות של עטלפים אדומים במזרח ומופרדים לכיתות שומנים רחבות על ידי TLC לבודד את החלק היחסי TAG לניתוח שלאחר מכן על ידי MALDI-TOF MS. תגיות להכיל רשתות acyl קצרות ומזוהות בקלות על ידי MALDI-TOF MS עם הפרעות מטריצה קטנות.
מאמר זה מציג שיטה פשוטה וחזקה להפרדת כיתות שומנים רחבות מבודדות מintegument היונקים ידי TLC preparative וקביעת פרופילי TAG ידי MALDI-TOF MS, ללא derivatization של מולקולות השומנים זמן רב. השלבים הקריטיים בהפקת ספקטרום איכות תגיות עם MALDI-TOF MS כוללים: 1) חילוץ מוצלח של המתחם עם זיהום או חמצון מינימאלי; 2) הפרדה מספקת ובידוד על ידי כרומטוגרפיה: 3) ברזולוציה גבוהה ודיוק המוני על ידי MALDI-TOF טרשת נפוצה.
מסמך זה מדגים את השיטה על ידי מיצוי ומפריד את החלק היחסי של שומנים הניטרלי מplagiopatagium של המחבט האדום במזרח כדי להשיג פרופילי MS TAG. בעוד שהמחקר הנוכחי השתמש במיני עטלפים (יונקים: Chiroptera) ניתן להאריך בשיטות אלה כדי ללמוד שומני הכסות של כל מיני יונקים. integument בת מאופיין בהיותו בעיקר כולסטרול, עם כמויות נמוכות יותר של תגיות, חומצות שומן חופשיות, squaLene, וסטרולים / שעוות אסטרים. יחס שומנים החלב בעטלפים שונה מבני האדם בסקוואלין שהוא מצויה בכמויות נמוכות (בניגוד לעד 16% בבני אדם), ואילו כולסטרול מתרחש ביחסים גדולים יותר (1 – 7% בבני אדם אלא 26-62% בעטלפים) 22 , ביום 31. שערות אדם מכילות תגים כ -3%, ואילו יחסים עד 28% נמצאים בשיער מחבט אדום במזרח. החילוץ של דגימות שומנים מעטלפים הוא דומה למינים אחרים. בעוד שבמחקר זה כדורי צמר גפן טבול בחומר ממס משמשים כדי להסיר את חלב, אפשר גם להפוך צינור בקבוקון או מדגם המכיל ממס על פני השטח של מספר רב של פעמים integument. מוצרי קלטת מיוחדים גם לספק אמצעים חלופיים כדי לחלץ שומני משטח 32. חלק קריטי של שאיבת שומנים נכונה הוא למזער את הזיהום משמני עור. המטרה זו מושגת בקלות על ידי שמירה על בקבוק לחיץ עם מתנול וריסוס כל כלי הזכוכית וכלי, מנגב את הכלים עם רקמה בין כל הדגימות ובדיקה הכפפות לובשות. o חמצוןacyls רב בלתי רווי F הוא למנוע באמצעות התוספת של BHT, ויש להשתמש בו ללא קשר לטמפרטורה דגימות נשמרות ב.
ניתוח Biomolecule בדרך כלל דורש צעד chromatographic למולקולות נפרדות של ריבית ממזהמים. TLC משמש בשיטה זו, אשר תמנע דרישות מכשור לגז או כרומטוגרפיה נוזלית ודורשת ניסיון טכני פחות כדי להשיג תוצאות חזקות ודיר. בהתאם למחלקת השומנים של עניין, ניתן לשלב בשלבים שונים של התקנים ניידים רבים. יתר על כן, השימוש בצלחות HPTLC וצפיפות סריקה יכול לשמש כדי להשיג תוצאות כמותיות. בעוד הווריאציות של שיטות TLC הן רבות מדי לרשימה כאן, כמה שלבים ניידים נפוצים בשימוש בשומני TLC כוללים כלורופורם: מתנול: מים להפרדה של פוספוליפידים וglycolipids או isooctane: אתר אתיל להפרדת שומנים הלא קוטביים 28. במונחים של הפרדת תגיות מכיתות אחרות שומנים בדם, H: E: כל כךמערכת עובדת באופן עקבי lvent ומספקת תוצאות דומות.
יתרון נוסף לשימוש בTLC הוא שלהקות של עניין יכולות להיות צדודית במהירות באמצעות MALDI-TOF MS ללא derivatization המוקדם של analytes. במחקר זה סיליקה היא להסיר את צלחת TLC, ואנליטי הוא eluted ממנו על ידי sonication בצנטריפוגה ממס ולאחר מכן להפריד את כושר ספיגה ואידוי של ממס משחררי. לחלופין, מטריצה עשויה להיות מיושמת ישירות על גבי להקות אנליטי מופרד על צלחות TLC ולאחר מכן ניתחו באופן ישיר על ידי MALDI-TOF MS 33. פרופיל מוצלח על ידי MALDI-TOF MS אין להסתמך על הכנת מדגם מספיק ומיומנות של המפעיל עם כוונון וכיול המכשיר. המכשיר צריך להיות מכויל יומי עם סטנדרטים כיסוי מתאים טווח משקל מולקולרי עבור המולקולות של עניין. גם הרגישות המתאימה והרזולוציה (למשל ≥ 10,000) של הציוד צריכה להיות confirmeד יומי עם ACTH.
שומנים מרכיבי החלב נמצאים על פני השטח של integument יונקים עשויים לשחק תפקיד בהתישבות על ידי פתוגנים פטרייתי / חיידקים. לכן ידע של ההרכב הכימי בין מינים ויחידים עשוי לספק רמזים על תהליכים של מחלות בבני אדם ובעלי חיים. הבדלי Intraspecific בקרב אנשים חולים ובריאים יכולים לייצג סימנים קליניים המסייעים בזיהוי מחלה ואבחון. יתר על כן, אם תרכובות מסוימות המעכבות התפתחותם של חיידקים נמצאות, אלה עשויים להיות מזוהים לשימוש בטיפול במחלות ומניעתן.
The authors have nothing to disclose.
סיוע שניתן על ידי סקוט Treece, Katelyn arter, ג'רמי Ragsdell, טוני LaMark ג'יימס, איימי פישר, חנה בלייר, ואיינו Gerdes במהלך הפיתוח של שיטות מעבדה. ברצוננו להודות למעבדת Medina-וליבר (לואיס H. Nopo-Olazabal; ארקנסו Biosciences מכון) לקבלת סיוע בצפיפות סריקת TLC. MALDI-TOF MS משמש עבור פרויקט זה סופק באמצעות NSF EPSCoR, RII: ארקנסו ASSET יוזמת מרכז P3 (EPS-0,701,890) בBiosciences ארקנסו המכון. מימון ניתן על ידי דיג בארה"ב וחיות הבר השירות / המדינה ארקנסו טבע גרנט, אגודת speleological הלאומית, והמרכז למחקר בצפון אמריקה בת ושימור באוניברסיטת מדינת אינדיאנה.
Name of the reagent | Company | Catalogue number | Comments (optional) |
Butylated Hydroxytoluene | MP Biomedicals, LLC | 101162 | www.mpbio.com |
TLC Flexible Plates | Whatman | 4410-222 | www.whatman.com |
ACTH | Sigma-Aldrich Chem. Co. | A8346-5X1VL | www.sigmaaldrich.com |
Triolein | Sigma-Aldrich Chem. Co. | 44895-U | |
TLC Lipid Standard | TLC 18-1 | www.nu-chekprep.com | |
MALDI TAG Standard | Nu-Check Prep., Inc. | NIH Code 53B | |
MALDI TAG Standard | Sigma-Aldrich Chem. Co. | 17810-1AMP-S | |
Glass Vials with Teflon Cap | U.S. National Scientific Co. | B7800-2 | www.nationalscientific.com/ |
DHB | Sigma-Aldrich Chem. Co. | 50862-1G-F | |
CHCA | Sigma-Aldrich Chem. Co. | C8982-10X10 mg | |
Sebutape | CuDerm | S100 |