フォワード遺伝的アプローチで<em>クラミジアトラコマチス</em

関連付けられていると、米国では年間推定280万生殖路感染症（疾病管理センター）の後遺症などの骨盤内炎症性疾患、子宮外妊娠、および不妊症（1）などのための絶対細胞内細菌のクラミジアトラコマチスアカウント 。 クラミジア属はユニークを持っている感染が、非複製素体（EB）と非感染性はなく複製網状体（RB）：2つの形式で構成される二相性発達サイクルで生理。感染endoctyotosis（2）続いて上皮細胞へのEBのアタッチメントから始まります。膜結合液胞は、インクルージョンと呼ばれる中では、EBをその後二分裂によって複製RB形、に分化する。半ばサイクルで、RBの遷移当時感染の新しいラウンドを開始するために、細胞外空間に放出されているEBを、ときに宿主細胞溶解する（3）。

クラミジアですこのような細菌の遺伝学のほとんどの研究の中心となっている標的遺伝子の交換、トランスポゾン、および形質導入ファージ、などの標準的な分子遺伝学的ツールを使用してルーチン操作に耐火、それは個々のクラミジア遺伝子が自然免疫の回避に寄与する程度は不明である、栄養買収、発達トランジション、または真核生物宿主（4）内の病原体の生存のために重要な他のプロセス。したがって、この病原体はその臨床的重要性にもかかわらず、不十分な特徴のままです。

クラミジア属のゲノム。次世代シーケンシング技術を用いて配列決定、複数の種と生物型に（5）（〜1 MB）比較的小さい。 WGSによって比較ゲノム解析クラミジア種の進化にユニークな洞察を提供しており、ヒトの（6-8）へとある程度彼らの適応は病原因子のポテンシャル関数（9、10）のようないくつかの情報を提供してきました。 T臨床分離株で表示される、彼の遺伝的多様性は、このような遺伝子の変異を容易に対して選択されていたので、おそらく、体系的にほとんどの病原因子の機能をマッピングするために必要な解像度を提供していません。自然淘汰から交絡影響を与えることなく、病原性のメジャー欠陥その定義されたアッセイと相まって変異誘発の遺伝子変化は、調査することができる突然変異のスペクトルを拡張することができます。化学変異原は、特に、それらがnull、条件、hypomorphic（機能低下）を生成することができますとして有用、とhypermorphic（関数のゲイン）対立遺伝子である。堅牢な次世代のゲノム配列決定技術の到来により、そのような変異を容易に識別してマッピングすることができる。このように、強いアソシエーションが前方に遺伝的アプローチの適用を可能にする、遺伝子または遺伝子経路の変異および共通の表現型の間で行うことができる。

臨床株のゲノム配列は、モザイクBを明らかにしたetweenの血清型と頻繁な組み換えの軌跡（11）。組換えの経験的証拠は、2つの異なる抗生物質耐性株の両方株（12,13）からの遺伝的寄与を有することが判明した二重耐性子孫組換えの選択の同時感染により実証した。したがって、同時感染設定で野生型と変異株の間で遺伝子交換は、化学的に誘発される突然変異の偏析が観察された表現型につながる影響を受けた遺伝子を特定することができます。

ここでは、化学的突然変異誘発、WGS、および感染細胞内のDNA交換（14）（ 図1）のためのシステムに基づいてクラミジアの遺伝的分析を実行する方法を説明します。