我们描述了使用聚乙二醇(PEG)的钝化玻璃表面的方法。该协议涵盖了表面清洗,表面功能化和PEG涂层。我们引进用于治疗表面与PEG分子过两轮,比现有的方法而产生钝化优质的新战略。
单分子荧光光谱法已被证明是有助于理解在纳米级范围广泛的生物现象。什么这种技术可以产生对生物科学的重要例子是在蛋白质 – 蛋白质和蛋白质 – 核酸相互作用的机械见解。当蛋白质的相互作用是探测在单分子水平,蛋白质或它们的底物通常是固定在玻璃表面,使之有一个长期观察。这种固定方式可能会引入不必要的表面假象。因此,有必要以钝化玻璃表面,使之惰性的。使用聚乙二醇(PEG)表面涂层突出其高性能防止蛋白质从与玻璃表面的非特异性相互作用。然而,该聚合物涂层过程是困难的,由于从一系列的表面处理和严格要求的表面需要是产生的并发症是不含任何荧光分子在该过程的结束。在这里,我们提供了一个强大的协议有一步一步的指示。它涵盖表面清洁,包括食人鱼蚀刻,表面功能化与胺基团,终于PEG涂层。要获得的PEG层的高密度,我们引入了两轮,显着提高了钝化的质量对表面进行处理与PEG分子的新战略。我们提供有代表性的结果,以及每个关键步骤的实用建议,让任何人都可以实现高品质的表面钝化。
进行单分子蛋白质研究时,必须达到表面钝化的高品质,使得实验不受任何表面诱导的蛋白质功能失常或变性1,2。而与表面活性剂,如牛血清白蛋白处理后的玻璃表面,通常用于单分子核酸研究3中 ,其钝化的程度还不够高蛋白质的研究。涂有聚合物(聚乙二醇,PEG)玻璃表面优异的钝化性能4-6。因此,它已成为普遍适用于单分子蛋白质的研究自从它被引入到一个单分子荧光研究7-10。聚合物涂层过程需要多个表面处理7,11,12。因此,难以追随整个过程,而不进行详细说明。根据该协议,我经常上的表面钝化的程度各不相同秒,然后。在这里,我们提出了一个强大的协议有一步一步的指示,这将消除单分子蛋白质研究的主要瓶颈之一。参见图1概述。
本协议中的关键步骤
它是必不可少的氨基硅烷化反应之前,使表面具有亲水性。这是通过在食人鱼蚀刻,产生在玻璃/石英表面上的游离羟基基团来实现。建议不要保留食人鱼蚀刻表面暴露于H 2 O或空气中的时间,因为表面的亲水性长期逐渐下降。
在NHS-酯PEG分子反应。这是应使等份,并将它们存储在氮气中于-20ºC。在化学APTES在室温下的保存期很短。这是应了一个新的每月更换。
本协议的修改
当你不能使用食人鱼蚀刻任何实际的原因,您可能会使用蚀刻KOH一段较长时间( 如 Ôvernight),这也将使得羟基露出。这种替代方法的缺陷是滑盖后由于严重的划痕数再回收变得不可用。
它经常练习使用丙烷火炬,这是有效地消除荧光有机材料7烧玻璃/石英表面。这个程序是不包括在此协议,因为它是多余的食人鱼腐蚀。注意,该步骤将可能导致的羟基的氧化。因此,这个程序应该不会进行一次表面用KOH或食人鱼溶液蚀刻。
当pH值低于7的缓冲液是用于单分子成像,PEG的构象从“蘑菇”改变为“刷”,这降低了钝化的程度。因此,当pH值低于7.0时,则建议进一步钝化用二琥珀酰亚胺基酒石酸盐<表面SUP> 7。
观点
这项工作提供了强大的协议实现高品质的表面钝化。该协议将是那些涉及蛋白质14以及细胞提取物中的蛋白复合物和免疫沉淀15单分子荧光的研究很有用。它将被广泛用于如力量光谱和扭矩光谱其他16个单分子技术。它也将是用于防止细胞从吸附到表面17是有用的。
在这项工作中提供的协议,要求其多步程序。使用脂质-PEG 8和多聚赖氨酸的PEG 9的表面钝化,可作为一种替代的方法。因为,它们不需要任何化学反应,它是很容易实现。然而,钝化的程度没有那么高,通过化学MODIF实现ication表面的。
The authors have nothing to disclose.
SDC,ACH,和CJ是由通过欧洲研究理事会资助启动(ERC-STG-2012-309509)的支持。 J.-MN是由韩国国家研究基金会(NRF)(2011-0018198)的支持;并通过韩国NRF的先锋研究中心计划(2012-009586)资助由科技部,信息通信技术,与未来规划(MSIP)。这项工作也是由中心由韩国MSIP作为全球前沿项目(H-GUARD_2013-M3A6B2078947)资助的生物纳米健康卫士支持。刘和J.-HH是由首尔市,韩国首尔科技奖学金计划的支持。标记的Rep蛋白是从苏阿MYONG博士一份厚礼。
1. Slide preparation and cleaning | |||
Acetone | Sigma | 32201 | 1 L |
Coverslips | VWR | 631-0136 631-0144 631-0147 | 24x32mm2, 22x40mm2, 24x50mm2 (No.1½, Rectangular) |
Diamond drill bits | MTN-Giethoorn, The Netherlands | LA-0564-00DB | 3/4 mm |
Duran slide holder | LGS, The Netherlands | 213170003 | |
Glass staining dishes | Fisher Scientific | 300101 | |
H2O2 | Boom | 6233905 | Opened bottles should be stored at 4 °C. 1 L, hydrogen peroxide 30% |
H2SO4 | Boom | 80900627.9010 | Sulfuric acid 95-98% |
KOH | Sigma | 30603 | Potassium hydroxide |
Methanol | Sigma | 32213 | 1 L |
Sonicator | Branson | Tabletop ultrasonic cleaner, 3510 | |
Quartz slides | Finkenbeiner | 1” x 3”, 1 mm thick | |
2. Coverslip cleaning | |||
Duran slide holder | LGS, The Netherlands | 213170003 | |
KOH | Sigma | 30603 | Potassium hydroxide |
Sonicator | Branson | Tabletop ultrasonic cleaner, 3510 | |
3. Amino-silanization of slides and coverslips | |||
Acetic acid | Sigma | 320099-500ML | Acetic acid, glacial |
APTES | Sigma-Aldrich | 281778-100ML | Store at the room temperature under N2 . Replace once in a month. 3-aminopropyl trimethoxysilane |
Flask (200mL) | VWR | Flask (200 mL) | Have one flask dedicated for aminosilanization. Pyrex flask |
Methanol | Sigma | 32213 | 1 L |
Sonicator | Branson | Tabletop ultrasonic cleaner, 3510 | |
4. Surface passivation using polymer (the first round) | |||
Biotin-mPEG | Laysan Bio | Biotin-PEG-SVA-5000-100mg | Store aliquots of 1-2 mg (enough for 10 slides) at -20 °C under N2. Biotin-PEG-SVA, MW 5,000 Da |
mPEG | Laysan Bio | MPEG-SVA-5000-1g | Store aliquots of 80 mg (enough for 10 slides) at -20 °C under N2. mPEG-succinimidyl valerate (SVA), MW 5,000 Da |
Sodium bicarbonate | Sigma | S6014-500G | |
6. Surface passivation (the second round) | |||
DMSO | Sigma-Aldrich | D8418-100ML | Dimethyl sulfoxide BioReagent, for molecular biology, ≥99.9% |
DST | Pierce | 20589 | Disuccinimidyl tartarate |
MS4-PEG | Pierce | 22341 | Dissolve 100 mg MS4-PEG in 1.1 mL DMSO. Store 20 mL aliquots at -20 °C. Short NHS-ester PEG, MW 333 Da |
Sodium bicarbonate | Sigma | S6014-500G | |
7. Assembling a microfluidic chamber | |||
Double sticky tape | Scotch | 10mm wide | |
Epoxy | Thorlabs | G14250 | Devcon 5 minute epoxy |
NaCl | Sigma-Aldrich | S9888-1 KG | Sodium chloride |
Neutravidin | Pierce | 31000 | Stock in 5 mg/mL in H2O at 4 °C. ImmunoPure NeutrAvidin Biotin-Binding protein |
Streptavidin | Invitrogen | S-888 | Stock 5 mg/mL in H2O or T50 at 4 °C. |
Trizma base | Sigma-Aldrich | T1503-1 KG | Tris |