Aqui descrevemos um protocolo para o isolamento de subconjuntos de precursor células B do sangue do cordão umbilical. A quantidade e qualidade suficientes de ácidos nucleicos podem ser extraídos a partir das células e usadas em ensaios subsequentes utilizando DNA ou RNA.
O sangue do cordão umbilical é altamente enriquecida para células progenitoras hematopoiéticas em estágios diferentes de autorização de linhagem. Nós desenvolvemos um protocolo para o isolamento de células B precursor em quatro diferentes fases de diferenciação. Porque os genes são expressos e modificações epigenéticas ocorrer de uma forma específica de tecido, que é vital para discriminar entre tecidos e tipos de células, a fim de ser capaz de identificar alterações no genoma e o epigenoma que podem levar ao desenvolvimento de doença. Este método pode ser adaptado a qualquer tipo de célula presente no sangue do cordão umbilical, em qualquer fase da diferenciação.
Este método compreende 4 passos principais. Primeiro, as células mononucleares foram separadas por centrifugação de densidade. Em segundo lugar, as células B são enriquecidas utilizando anticorpos conjugados com biotina que não reconhecem e remover as células B a partir de células mononucleares. Terceiros as células B são marcado por fluorescência, com anticorpos específicos de proteínas da superfície celular para as fases individuaisde desenvolvimento de células-B. Finalmente, as células marcadas por fluorescência são classificados e populações individuais são recuperados. As células são recuperadas da quantidade e qualidade suficiente para ser utilizado em ensaios de ácidos nucleicos a jusante.
De modo a identificar aberrações que estão presentes em doenças, é de vital importância que usamos tecidos saudáveis ou células que correspondem ao tipo de tecido ou célula afectada pela doença. Uma razão para isso é que a variação epigenética entre tipos de tecidos é responsável por regular a expressão do gene e é crítica para a diferenciação celular durante 1,2 desenvolvimento humano normal. Uma segunda razão é que a regulação aberrante do tecido gene específico pode ter consequências para o desenvolvimento normal e é conhecida por contribuir para uma multiplicidade de estados de doença, incluindo o cancro. Assim, uma melhor compreensão de uma doença que envolve as células hematopoiéticas requer o conhecimento das células hematopoiéticas saudáveis.
O desenvolvimento de células hematopoiéticas em medula óssea o produto através de uma ordem sistemática dos acontecimentos caracterizadas por alterações na expressão de marcadores de superfície celular 3. Estudos envolvendo participantes adultos têmmostrado que a medula óssea contém normalmente um número baixo de células B precursor de 4,5, ao passo que estudos envolvendo participantes pediátricos demonstraram que a percentagem de células B precursor é relativamente elevada em indivíduos com menos de 5 anos de idade 6. O sangue do cordão umbilical é usado como uma fonte de células-tronco hematopoiéticas no tratamento de distúrbios relacionados com o sangue e as doenças malignas, está prontamente disponível através dos bancos de sangue de cordão e é enriquecido para B imaturas e células T 7, que são as células alvo de várias doenças, incluindo a leucemia e linfomas.
Precursor de células B na medula óssea têm sido extensivamente fenotipado 8,9 e pode ser definida pela presença de marcadores de células de superfície específicos que podem ser usados para classificar essas células em subconjuntos distintos. Normais de células B procede de diferenciação através de uma série de fases da medula óssea que começam com as primeiras células pró-B e culminando em imaturas ou células B naïve. Segundoa van ZELM e colegas 10, células pró-B são caracterizados pela presença de CD34 e na transição para a fase 2 (Pre-BI) CD19 é adquirido. Células Fase 3 (Pré-BII) já não expressam o CD34 e começam a expressar IgM citoplasmática. Por último, uma característica essencial da fase 4 (imaturo células B) é a expressão de IgM de superfície. A estratégia de triagem descrito no presente protocolo foi descrito pela primeira vez por Caldwell e colegas 6 e inclui a utilização de apenas três marcadores de superfície das células o que reduz significativamente a complexidade e o custo de realizar as experiências de triagem de células. No seu trabalho, uma relação entre o CD45 e os estágios de diferenciação de células B foi estabelecida. Eles observaram que as células B na medula óssea, exibem níveis variáveis de expressão de CD45. Especificamente, as células que expressavam níveis elevados de CD45 correspondendo a células que expressam IgM de superfície (células B imaturas), aqueles que expressaram um nível intermédio de CD45 correspondendo a células que expressavam cytoplasmic IgM (pré-BII células), e aqueles que expressaram baixos níveis de CD45 correspondendo a células que não expressaram IgM citoplasmática (pré-BI células). Este protocolo utiliza a estratégia desenvolvida por Caldwell e colegas 6 para isolar subconjuntos de precursor de células B a partir do sangue do cordão umbilical (Figura 1), que podem ser utilizados em ensaios a jusante que requerem ácidos nucleicos de elevada qualidade, tais como o ensaio de recuperação metilado CpG-island (MIRA ) 11 e quantitativos Os ensaios de PCR em tempo real. O método emprega uma separação inicial utilizando contas magnéticas para esgotar todas as células não-B do sangue do cordão umbilical e requer coloração com apenas 3 (anticorpos CD34, CD19 e CD45). As células que são recuperadas representam quatro estágios de diferenciação de células-B: 1) CD34 +; CD19 + (tarde) pro-B e no início pré-BI, 2) CD34 -, CD19 +; CD45 baixo (final pré-BI); 3) CD34 -, CD19 +; CD45 med (pré-BII) e 4) CD34 -; CD19 +; CD45 elevado (células B imaturas).
O factor de maior impacto sobre o sucesso do protocolo é a presença de contaminação de detritos. Se solicitando sangue a partir de um banco de sangue do cordão umbilical, é importante para que o sangue fornecido como logo após a colheita quanto possível. Além disso, as amostras classificadas como linfocitose conter um maior número de linfócitos, no entanto, estes exemplos não têm um número suficiente de células B precursor e não devem ser usados. Para aumentar a probabilidade de se obter um número suficiente de células para cada um dos subconjuntos precursores É aconselhável começar com, pelo menos, 85 ml de sangue de cordão umbilical.
É importante notar que, ao contrário dos adultos separações de sangue periférico, quando do fraccionamento de sangue de cordão umbilical a camada mononuclear é frequentemente contaminado com células vermelhas do sangue 12. Este protocolo inclui uma etapa de lavagem adicional para remover as plaquetas contaminantes. Protocolos descrevem separações mononucleares do sangue do cordão sugerem incluindo um passo de lise to Remover indesejadas células vermelhas. Não é recomendável este passo porque produz detritos contaminantes e tem um impacto negativo sobre o sucesso do tipo de célula.
A fim de reduzir o número de células que têm de ser distinguidos através de citometria de fluxo que é necessário realizar um enriquecimento de células B antes da separação de células. O protocolo fornecido pela Miltenyi Biotec, que acompanha o kit de isolamento de célula B (B-CLL), foi optimizado para o sangue periférico, e recomenda o uso de 10 ul de B-CLL cocktail de anticorpos de biotina por cada 10 milhões de células. Este passo utiliza anticorpos contra CD2 (células T, células NK), CD4 (células T), CD11b (granulócitos, monócitos, macrófagos), CD16 (células NK; macrófagos; mastócitos), CD36 (plaquetas), CD235a (células eritróides) para esgotar as células não-B a partir do sangue do cordão umbilical. É importante a utilização do kit descrito e não o isolamento de células B kit II porque o kit primeiro contém um anticorpo contra CD43, que está presente em células pró-B. Durante a nossa optimization deste protocolo, verificou-se que um total de 40 ul de B-CLL cocktail anticorpo biotina é suficiente para produzir um resultado positivo tipo de célula. Além disso verificou-se que usando tão pouco como 5 pi mais do cocktail de anticorpos B-CLL biotina tinha efeitos adversos sobre o tipo de célula. Portanto, é altamente recomendável usar 40 ul de B-CLL cocktail de anticorpos biotina para o total de número de células mononucleares entre 175-250000000. Se começar com números mais baixos ou mais altos de células pode ser necessário para escalar os reagentes em conformidade.
Há inúmeras publicações que descrevem conflitantes os marcadores que podem ser utilizados para distinguir sub-populações de células-B. A maior parte da discrepância pode ser explicada pelo facto de que a diferenciação é um processo contínuo e que a presença ou ausência de marcadores de superfície celular ocorre de forma gradual, em vez de numa maneira de tudo ou nada. Neste protocolo CD34 – / CD19 + e o nível de intensidade de CD45 + (expressão baixa, média e alta) foi utilizada para distinguir pré-BI, BII e pré-células B imaturas com um aumento no nível de expressão de CD45 correspondendo a progressão da diferenciação 6. Células pró-B, foram descritas por alguns como sendo CD19 + / CD34 + 13, enquanto outros têm mostrado que a pró-células B são CD19 – / CD34 + e células pré-BI são CD19 + / CD34 + 9,10. Com base nestas diferenças nós designamos os CD19 + / CD34 + como tardios células pró-B / BI iniciais pré-células. É importante notar que esta estratégia foi desenvolvida para isolar subconjuntos de precursor de células B que correspondem às células afectadas pela doença de leucemia linfoblástica aguda. No entanto, existem várias estratégias de triagem que podem ser empregues dependendo do subtipo de células de interesse.
Anticorpo-fluorocromo combinações devem ser selecionados com base nas capacidades do seleccionador de células disponíveis. Como génerosl regra, a mais brilhante fluorocromo no seu painel deve ser usado para rotular o antígeno menos populoso e vice-versa. Na detecção de dupla manchadas de populações, especialmente eventos raros, como estes, gibão discriminação (Figura 2B) é uma parte vital da estratégia de aquisição electrónica. Isto assegura que os eventos de duplo-positivas são as células coradas verdadeiramente único com ambos os anticorpos e não meramente duas single-coradas células aderidas umas às outras.
Alta velocidade, 4 vias de separação de células necessariamente cria um ambiente de aerossol controlada. Portanto, a classificação de células vivas humana deve ser feita com cautela. Diretrizes publicadas segurança e descontaminação estão disponíveis e devem ser revistos e aplicados antes de o tipo 14. Aprovação de Comitês Institucionais de Biossegurança ou seus equivalentes pode ser necessária antes da classificação. Para a descontaminação adequada após separação, lixívia deve ser adicionado ao recipiente de lixo para uma concentração final de 10%. Similarly, todos os tubos de amostras, bem como todas as superfícies na área imediata deve ser completamente descontaminado com uma solução de lixívia a 10%, recentemente feita.
Em resumo, este protocolo proporciona uma estratégia para a obtenção de populações raras de precursor de células B e pode ser modificada para isolar uma população rara presente no sangue de cordão, incluindo as células estaminais hematopoiéticas e as células T imaturas. Recentemente, células B imaturas foram identificados no sangue periférico de indivíduos com VIH avançada 15. Por conseguinte, a utilidade deste método ultrapassa o estudo dos cancros do sangue. Finalmente, não foram ainda realizados isolamentos de RNA nas células de fluxo classificados, no entanto, este método deve ser adaptável com a ressalva de que, durante a separação de células das células deve ser seleccionada directamente em Trizol ou uma solução equivalente de ARN compatível, tal como o kit de RLT RNeasy disponível através da Qiagen.
The authors have nothing to disclose.
Este trabalho foi financiado pelos Institutos Nacionais de Saúde (NCI R00 CA132784) para KT
Name of Reagent/Material | Company | Catalog Number | Comments |
DPBS (1X) | Gibco by Life Technologies | 14190-144 | |
Ficoll-Paque PLUS | GE Healthcare Bio-Sciences AB | 17-1440-03 | |
LS Column | MACS Miltenyi Biotec | 130-042-401 | |
MACS Multi Stand | MACS Miltenyi Biotec | 130-042-303 | |
MidiMACS Separator | MACS Miltenyi Biotec | 130-042-302 | |
B-Cell Isolation Kit (B CLL) | MACS Miltenyi Biotec | 130-093-660 | |
Fetal Bovine Serum | ATLANTA Biologicals | S11195 | |
Microcentrifuge tube (1.5 ml) | MIDSCI | SS1500 | |
BD Pharmingen 7-AAD (7-Aminoactinomycin D) | BD Biosciences | 559763 | |
DB Pharmingen APC Mouse Anti-Human CD19 | BD Biosciences | 555415 | |
DB Pharmingen PE Mouse Anti-Human CD34 | BD Biosciences | 560941 | |
CD45 FITC | BD Biosciences | 347463 | |
autoMACS Rinsing Solution | MACS Miltenyi Biotec | 130-091-222 | |
MACS BSA Stock Solution | MACS Miltenyi Biotec | 130-091-376 | |
BD Falcon 5 ml Polystyrene Round-Bottom Tube | BD Biosciences | 352058 | |
BD Falcon 50 ml Tube | BD Biosciences | 352098 | |
PuraFlow Sheath Fluid, 8X | Beckman Coulter | CY30230 | |
FlowCheck Alignment beads | Beckman Coulter | 6605359 | |
Ultra Rainbow Alignment beads | Spherotech | URFP-30-2 | |
ViroSafe Aerosol Evacuation Filter | Beckman Coulter | ML01330 | |
ABC Mouse bead kit | Invitrogen | A-10344 | |
40 μm cell strainer | Fisher Scientific | 22363547 | |
Fisher Scientific Hemocytometer | Fisher Scientific | 267110 | |
Microscope | |||
accuSpin Model 3R Benchtop Centrifuge | Fisher Scientific | 13-100-516 | |
MoFlo XDP flow Cytometer | Beckman Coulter | ML99030 | |
Aerosol Evacuation Unit | Beckman Coulter |