Un haz molecular acoplada a espectrómetro ultravioleta de vacío ajustable masa fotoionización en un sincrotrón es una cómoda herramienta para explorar la estructura electrónica de las moléculas aisladas de fase gaseosa y clusters. Mecanismos de transferencia de protones en dímeros de bases de ADN fueron determinadas con esta técnica.
Ajustable de ionización suave acoplado a espectrometría de masas es un poderoso método para investigar moléculas aisladas, los complejos y los grupos y su dinámica y espectroscopia 1-4. Los estudios fundamentales de procesos de fotoionización de biomoléculas proporcionar información acerca de la estructura electrónica de estos sistemas. Además determinaciones de energías de ionización y otras propiedades de las biomoléculas en la fase gaseosa no son triviales, y estos experimentos proporcionan una plataforma para generar estos datos. Hemos desarrollado una técnica de vaporización térmica junto con haces moleculares supersónicos que proporciona una manera suave para el transporte de estas especies en la fase gaseosa. Combinación juiciosa de gas de la fuente y de la temperatura permite la formación de dímeros y mayores clusters de las bases de ADN. El enfoque de este trabajo en particular es sobre los efectos de las interacciones no covalentes, es decir, enlaces de hidrógeno, apilamiento y las interacciones electrostáticas, en las energías de ionización yde transferencia de protones de biomoléculas individuales, sus complejos y en micro-hidratación por agua 1, 5-9.
Se ha realizado la caracterización experimental y teórico de la dinámica de fotoionización de uracilo en fase gaseosa y dímeros 1,3-dimetiluracilo utilizando haces moleculares, junto con radiación sincrotrón en la línea de luz Dinámica Química 10 ubicada en la fuente de luz avanzada y los detalles experimentales se visualizan aquí. Esto nos permitió observar la transferencia de protones en el dímero 1,3-dimetiluracilo, un sistema con pi apilamiento geometría y sin un enlaces de hidrógeno. Haces moleculares proporcionan una manera muy conveniente y eficiente para aislar la muestra de interés de las perturbaciones ambientales que a su vez permite la comparación exacta con los cálculos de estructura electrónica 11, 12. Al ajustar la energía de los fotones del sincrotrón, una eficiencia de fotoionización (PIE) se puede trazar la curva que nos informa sobre el catiónicaelectrónicos de los estados. Estos valores se pueden comparar con los modelos teóricos y los cálculos y, a su vez, explicar en detalle la estructura electrónica y la dinámica de las especies investigadas 1, 3.
Los monómeros y dímeros se generan en una expansión de chorro supersónico que da lugar a un haz molecular. Una pequeña muestra de la base de ADN se coloca en una fuente de vaporización térmica y se calienta para generar presión de vapor suficiente. El gas argón lleva los vapores a través de un orificio de 100 micras y se pasa un skimmer mm 2 para producir un haz molecular frío 14. Alternativamente, una fuente de haz efusiva se puede utilizar, donde la muestra se coloca en un horno calentado unido a…
Los experimentos se llevaron a cabo en la línea de luz Dinámica Química de la fuente de luz avanzada, Lawrence Berkeley National Laboratory y el apoyo de la Oficina de Ciencia, Oficina de Ciencias Básicas de la Energía, del Departamento de Energía de EE.UU. bajo el Contrato No. DE-AC02-05CH11231, a través de la División de Ciencias Químicas.
Name of Reagent/Material | Company | Catalog Number | Comments |
Uracil | Sigma | U0750 | |
1,3-Dimethyluracil | Aldrich | 349801 |