複数のバイオマーカー候補のハイスループットの検証は凍結/融解サイクルを最小限に抑え、貴重な血漿検体を使用するために、シーケンシャルELISA法により行うことができる。ここでは、連続して6つの異なる検証血漿バイオマーカーのELISAを実行する方法を示し<sup> 1月3日</sup>移植片対宿主病(GVHD)の<sup> 4</sup>同じ血漿試料に。
公平ディスカバリープロテオミクス戦略は臨床現場での診断および予後のテストを改善することができ、治療的介入を導くのを助けることができる新たなバイオマーカーの大規模な番号を識別するために可能性を秘めている。候補タンパク質の大規模な番号が識別されると、それはそのような急性の発症として有限体積の、イベントドリブンとかけがえのない患者の血漿サンプルから、タイムリーかつ効率的な方法でバイオマーカー候補を検証することは困難である移植片対宿主病(GVHD)、同種造血幹細胞移植(HSCT)の潜在的に生命を脅かす合併症。
最小限にするために順番に、IL-2Rα5、TNFR1 6、HGF 7、IL-8の8、エラフィン2、REG3α3(またPAP1として知られている):ここでは、6つの検証済みの移植片対宿主病(GVHD)のタンパク質を市販のELISAを行う処理を記述凍結融解サイクル、プラズマ時間と血漿の使用量を解凍した。最適なシーケンシャルELISAの性能を容易にするためのマイナーな調整とメーカーのELISAキットとプロトコルを使用して我々の研究室で確立されたサンプルの希釈率によって決定されるように、この手順のために私達は順番にELISAを行う。得られた血漿バイオマーカーの濃度は、患者コホート内の重要な発見のためにコンパイルして解析することができます。これらのバイオマーカーは、研究目的のために現在であるが、臨床ケアへの取り込みは、現在臨床試験で検討されている。
この手法は、同じ試料上の関心のある複数のタンパク質/サイトカインのELISAを実行するために適用することができます(複数可)提供されたサンプルは、他の試薬と混合する必要はありません。 ELISAキットがプレコーティングされたプレート、96ウェルハーフウェルプレートまたは384ウェルプレートが付属していない場合は、さらにサンプル/試薬の使用を最小限に抑えるために使用することができます。
急性移植片対宿主病(GVHD)、同種造血幹細胞移植(HSCT)後の非再発死亡率(NRM)の主要な原因は、3臓器系の機能不全によって測定される:皮膚、肝臓、消化管(GI)路4。急性GVHDは、通常2〜8週間、移植後に発生したが、後に発生する可能性があり、しばしばこのようなコンディショニングレジメンの毒性、感染症や薬の副作用などの他のポスト造血幹細胞移植の合併症から臨床的に区別することはできません。プロテオミクス戦略とシーケンシャルELISA法を用いた高スループット検証を使用することにより、我々はその濃度GVHDの臨床症状の発症時に上昇している6タンパク質を同定した。 IL-2Rα、TNFR1、4バイオマーカーパネルにまとめ、HGFおよびIL-8は、臨床症状の発症時GVHD診断できるとGVHDの重症度1の独立後の造血幹細胞の生存率を予測することができます。エラフィン、SKの移植片対宿主病(GVHD)のためのバイオマーカーには、このような薬疹など他の原因によるGVHDの発疹と発疹を区別することができ、移植の生存率2を予測することができます。我々は最近、下部消化管、最もNRMに関連付けられた標的臓器の移植片対宿主病(GVHD)のバイオマーカーとしてREG3α同定した。プラズマREG3α濃度は確実にポストHSCT下痢の原因として、GVHDを特定し、診断腸の生検に移植片対宿主病(GVHD)の組織学的重症度に相関させることができます。 GIの移植片対宿主病(GVHD)の発症時REG3α濃度もGVHDの治療とNRM 3への反応を予測することができます。臨床ケアにこれらの検証移植片対宿主病(GVHD)のバイオマーカーの取り込みは、現在臨床試験で検討されている。
これらの実験は、かけがえのないと数量限定となっており、GVHD発症時の2000年から2010年の間に造血幹細胞移植を受けた患者から採取した小さなプラズマアリコートで行った。これらのサンプルの貴重な自然のために、我々はMETを開発した過剰凍結融解サイクル、解凍時間と血漿の使用状況を解消するための効率的、再現可能な方法で、複数の血漿タンパク質濃度を測定hodで。この手法は、同じ試料上の関心のある複数のタンパク質/サイトカインのELISAを実行するために適用することができます(複数可)提供されたサンプルは、他の試薬と混合する必要はありません。 ELISAキットがプレコーティングされたプレート、96ウェルハーフウェルプレートまたは384ウェルプレートが付属していない場合は、さらにサンプル/試薬の使用を最小限に抑えるために使用することができます。本稿では、移植片対宿主病(GVHD)のバイオマーカーを測定することの技術的側面に焦点を当てています。
ここに提示され、順次、ELISA法を得ることが困難および/ またはそのような稀な疾患またはマウス9,10から得られた血漿サンプルでのヒト被験者から採取したサンプルのようにかけがえのないかもしれないプラズマの小さなボリュームに複数の血漿タンパク質の測定が可能になる。シーケンシャルELISAは、一般的に希釈した血漿を必要とするELISA法で、増加血漿希釈係数の順序で実行されます。≥必要に応じてこれを行うことができますが、1時10分は、典型的には、再利用することする必要はない。シーケンシャルELISAを実行する能力がプラズマは他の試薬、または異なる希釈バッファはプラズマのため必要とされるために混合されているELISAキット/プロトコルによって制限されますが、これは、その互換性の懸念のために再利用するサンプルにablilityを排除バッファ/試薬は、特定のテストのパフォーマンスを妨害する可能性があります。綿密な計画と、10以上のELISAは同じ血漿試料に対して行ってもよい。
ENT ">個々の研究室では、被験者から採取したサンプル中の目的のタンパク質の予想される血漿中濃度に基づいて解釈可能な結果を得るために、血漿希釈液を調整する必要があります。実験装置の違いは、インキュベーション及び比色開発を最適化するために必要になることがあり回、洗浄の回数および/または任意の与えられたELISA法を最適化するために時間を浸し洗浄する。高スループット能力と精度を向上させるために、費用対効果の高い方法で解析を実行するために、384ウェルプレート上で解析し、スタッキングユニットと自動プレート洗浄が可能なロボットのリキッドハンドリングプラットフォームの利用が推奨されています。この装置は、複数のユーザーによって実行された分析の正確さと精度を向上させ、間およびアッセイ内変動を低減するために分析の一貫性を提供するのに役立ちます。
我々は2つの理由のために利用できる多重プラットフォーム上でシーケンシャルELISAを使用した:1)のほとんどは、新規タンパク質に対する抗体のペアは、簡単にビーズまたは他の材料と同様にかかり、高価で時間通りにコンジュゲートすることができない、2)個々のELISAアッセイは、交差反応性11の不在に二次多重マイクロアレイまたはビーズよりも正確です。信頼性の高い方法が多重、ビーズベースのマイクロアレイを行うために設立されている場合は、シーケンシャルのELISAプロセスを置き換えることができるかもしれませんが、ビーズに抗体をコンジュゲートする能力によって、および/またはであることが所望のタンパク質の数が制限される場合があり分析した。
The authors have nothing to disclose.
NIHの助成金RC1-HL-101102、P01-CA039542、T32-HL007622、ハートウェル財団、ドリス·デューク慈善財団によってサポートされています。博士PaczesnyはエリックハートウェルファンドとエイミーStrelzer Manasevit研究プログラムの研究者でもある。
Name of the reagent | Company | Catalogue number | Comments |
Human IL-2 R alpha Duoset | R&D Systems | DY223 | |
Human HGF Duoset | R&D Systems | DY294 | |
Human IL-8 OptEIA KIT II | Becton Dickinson | 550999 | |
Ab-Match ASSEMBLY Human PAP1 (REG3α) Kit | MBL International | 5323 | |
Ab-Match UNIVERSAL Kit | MBL International | 5310 | |
Human sTNFRI/TNFRSF1A Duoset | R&D Systems | DY225 | |
Human Trappin-2/Elafin Duoset | R&D Systems | DY1747 | |
96-well polystyrene conical bottom plates | Thermo Scientific | 249570 | Used for plasma source plates |
Costar half-well high-binding 96-well plates | Corning | 3690 | For IL-2Rα, HGF, TNFR1 and elafin ELISAs |
Nunc 384-well MaxiSorp plates | Nunc | 464718 | For REG3α Elisa |
HyClone Phosphate Buffered Saline, 1x | Thermo Scientific | SH30256.02 | |
Bovine Serum Albumin, Fraction V, Heat Shock Treated | Fisher Scientific | BP1600-100 | |
Blocker BLOTTO in TBS | Thermo Scientific | 37530 | Blocking agent for IL-2Rα HGF and TNFR1 ELISAs |
Dulbecco’s Phosphate-Buffered Saline | Gibco | 21600-069 | Wash buffer for IL-2Rα, HGF, Elafin and TNFR1 ELISAs |
TMB Peroxide Susbtrate | Kirkegaard and Perry Laboratories | 50-76-00 | |
Tween 20 | Acros Organics | 233362500 | Wash buffer for IL-2Rα, HGF, Elafin and TNFR1 ELISAs |
Sulfuric Acid | Sigma-Aldrich | 84720 | (Diluted to 2N) for stop solution |