脱壳是在HIV – 1生命周期的早期阶段的重要一步,并定义为衣壳外壳的拆卸和释放病毒核蛋白复合物(vRNP)。在这里,我们展示了隔离HIV – 1病毒颗粒的完整的核心和量化其脱壳技术<em>在体外</em>。
的逆转录病毒的基因组是由脂质包膜包围一个衣壳,包裹。慢病毒,如HIV – 1,锥形衣壳外壳组成的六角晶格排列的CA蛋白。衣壳是关闭的7 pentamers广泛年底,在窄的一端的锥1,2 5。在这衣壳外壳外壳是病毒的核蛋白复杂,和他们一起组成的核心。
HIV – 1病毒膜与靶细胞膜的融合,是释放到细胞质。衣壳,然后拆卸 3中的可溶性形式释放游离Ca简称为脱壳的过程。细胞内的位置和HIV – 1脱壳的时间是知之甚少。在CA的单一氨基酸替换改变衣壳的稳定性也削弱的HIV – 1感染细胞的能力4。这表明衣壳的稳定性是HIV – 1感染的关键。 </p>
HIV – 1脱壳已经很难研究由于缺乏这个过程中的敏感和可靠的检测。在这里,我们描述了一个定量方法研究使用体外传染性的HIV – 1颗粒分离的核心脱壳。该方法涉及了一层洗涤剂,并通过集中的病毒颗粒的沉淀核心的隔离成线性蔗糖梯度,在寒冷的。要量化脱壳,孤立的核心是在37 ° C的各种时间间隔,随后离心沉淀。脱壳程度上清液中的CA的一小部分通过量化分析。已采用这种方法分析HIV – 1衣壳的稳定性4,5,6的病毒突变的影响。研究HIV – 1脱壳的细胞因子的作用,还应该有用。
这里描述的方法来净化HIV – 1核心,研究在体外脱壳研究这种HIV – 1生命周期的阶段,特别是由于没有一个有效的方法来分析靶细胞的HIV – 1脱壳。虽然这种方法使用平衡离心净化核心,其他人使用简要裂解后直接制粒,1%的Triton – X – 100 12 13或通过造粒蔗糖垫覆盖0.1%的Triton X – 100 的14,15 。
通过这种方法获得的内核的复苏是受实验误差。一个变量是在这个协议…
The authors have nothing to disclose.
HIV – 1脱壳在艾肯实验室的研究是由NIH的拨款AI40364,AI50423和AI076121支持。几个关键材料,包括在P24 ELISA试剂,由美国国立卫生研究院艾滋病研究和参考程序,艾滋病司,NIAID的,国立卫生研究院提供。
Name of the reagent | Company | Catalog number | Comments (optional) |
DMEM | Cellgro | 10-013-CV | |
PBS | Cellgro | 21-031-CV | |
Triton-X-100 | Mallinckrodt Baker Inc | 9002-93-1 | |
Tween 20 | Acros | 9005-64-5 | |
0.25% Trypsin-EDTA | Cellgro | 25-053-CI | |
2XBBS | Composition: 50mM BES [pH 6.95], 280 mM NaCl and 1.5 mM Na2HPO4. Adjust pH to 6.95 at room temperature. Filter sterilize & store in aliquots at -20°C. | ||
Coating antibody: Monoclonal antibody to p24 (183-H12-5C) | NIH AIDS Research and Reference Reagent Program | 3537 | |
Primary antibody: HIV-Ig (hyperimmune human patient serum) |
NIH AIDS Research and Reference Reagent Program |
3957 | |
Secondary antibody: Goat anti-human IgG, peroxidase conjugated |
Pierce | 31130 | |
HRP substrate | KPL Inc | 50-76-11 | |
Immulon 2HB 96 well plates | Thermo Scientific | 3455 | |
SW32Ti and SW32.1 Ti rotors and compatible ultracentrifuge | Beckman Coulter | ||
TLA-55 rotor and tabletop ultracentrifuge | Beckman Coulter | ||
High speed microfuge tubes | Beckman Coulter | 326823, 358123, 357448 | |
Auto-Densi Flow density gradient fractionator | Labconco Corp. | 4517000 | |
Gradient Former | CBS Scientific Co. Inc. | GM-20 |