שיטה גמישה ויעילה לאפיון של לוקליזציה סוג ספציפי חלבון התא nucleocytoplasmic הלוך ושוב מתואר. גישה זו משתמשת heterokaryon חלבונים היתוך fluorescently-שכותרתו לגרסאות המגוירות חלבון תמונה לאחר איחוי תאים. פרוטוקול ניתנת היציב לגרסאות המגוירות או קביעות יותר דינמי המבוסס על הדמיה תא חי.
מספר משמעותי של חלבונים מוסדרים על ידי סחר subcellular או nucleocytolasmic הלוך ושוב. חלבונים אלה להציג מגוון רחב של תפקודים תאיים כולל לייבא גרעיני / יצוא של רנ"א וחלבונים, תקנה תעתיק, ו אפופטוזיס. מעניין, וארגון מחדש הסלולר הגדולות, כולל חלוקת התא, בידול ושינוי, לעתים קרובות כרוך פעילויות כגון 3,4,8,10. מחקר מפורט של החלבונים האלה מנגנוני הרגולציה שלהם יכול להיות מאתגר כמו גירוי על שינויים אלה לוקליזציה יכול להיות חמקמק, והתנועות עצמם יכולים להיות דינמי די קשה לעקוב. מחקרים שכללו oncogenesis הסלולר, למשל, ממשיכים ליהנות מסלולים הבנה ופעילויות חלבון שונים בין תאים ראשוניים נורמליים ותאי שינה 6,7,11,12. כאשר חלבונים רבים מראים לוקליזציה שינו במהלך טרנספורמציה או כתוצאה של שינוי, שיטות כדי לאפיין ביעילות אלה חלבונים המסלולים שבהם הם משתתפים עומדים לשפר את ההבנה של oncogenesis ושטחים פתוחים תרופה חדשה המיקוד.
כאן אנו מציגים שיטה לניתוח סחר חלבון הלוך ושוב בין פעילות בתאי יונקים העיקרי והפך. שיטה זו משלבת את דור fusions heterokaryon עם מיקרוסקופ פלואורסצנטי לספק פרוטוקול גמיש שניתן להשתמש בהם כדי לזהות לגרסאות המגוירות חלבון היציב או דינמי. כפי שמוצג באיור 1, שני סוגי תאים נפרדים transfected transiently עם בונה פלסמיד הנושא גן fluoroprotein המצורפת הגן של עניין. אחרי הביטוי, התאים הם התמזגו באמצעות פוליאתילן גליקול, ואת לגרסאות המגוירות חלבון עלול אז להיות צילמו באמצעות מגוון של שיטות. הפרוטוקול המובא כאן הוא גישה בסיסית אשר בטכניקות מיוחדות ניתן להוסיף.
פרוטוקול heterokaryon המובא כאן מספק שיטה יעילה לפרש בקלות עבור אפיון של התנהגות מסוג מסוים לוקליזציה התא וכן פעילות nucleocytoplasmic הלוך ושוב. שיטה זו מנצלת את הרגישות של ניתוח הקרינה, כמו גם את היכולת תאים התמונה לחיות ולבצע מחקרים של הדינמיקה חלבון. הטכניקה היא מותאמת בקלות הרבה סוגי תאים שונים, והוא מקובל גם הדמיה תא חי וקבוע. לדוגמה, מיקרוסקופ פלואורסצנטי הפוך יכול לשמש הדמיה לחיות זמן לשגות לכידת וידאו. לעומת זאת, התאים רכוב ניתן להשתמש במיקרוסקופ או epifluorescence לקביעת מצב יציב לגרסאות המגוירות או הדמיה confocal מפורטת יותר של לגרסאות המגוירות בדידים. יתר על כן, טכניקות כגון התאוששות הקרינה לאחר photobleaching (FRAP), או הפסד הקרינה photobleaching (FLIP) יכול לשמש בקביעת קינטיקה לוקליזציה 1. שילוב של fluorophores חלופי בפרוטוקול תאפשר אינטראקציה ניסויים כגון חלבון פלואורסצנטי תהודה העברת אנרגיה (סריג), שתבוצע בקונצרט 2. מעכבי שונים של סחר בבני הסלולר כגון B leptomycin או דומיננטי שלילי רן בונה GTPase ניתן להשתמש כדי להקים את התלות ביבוא מסוים או מסלולים יצוא 5,6,9.
The authors have nothing to disclose.
ברצוננו להודות הפוליטכני וורצ'סטר מכון המחלקה לכימיה וביוכימיה למימון.
Material Name | Type | Company | Catalogue Number | Comment |
---|---|---|---|---|
Effectene reagent | Qiagen | 301425 | ||
Phosphate buffered saline (PBS) | Sigma-Aldrich | P5493 | ||
Trypsin | Fisher | SH3023602 | ||
Dulbecco’s modified Eagle’s medium (DMEM) | Fisher | SH30243FS | High glucose | |
paraformaldehyde | FisherChemical | O4042-500 | ||
4’,6-diamidino-2-phenylindole (DAPI) | Sigma-Aldrich | D9542-10MG | ||
Hyclone Serum (fetal bovine) | Thermo Scientific | SH3008803HI | ||
Falcon 6-well plates | Fisher | 08-772-1B | ||
Polyethylene glycol 1000 | Fisher | 528875-25GM | ||
Cover slips | Fisher | 12-545-85 | ||
DABCO | Sigma-Aldrich | D2522-25G | ||
Nucleofector HDF kit | Lonza | VPD-1001 |