להקל על ניתוח נתונים החיסוני עם טכניקות Analytic חזותית
Summary
ניתוח חזותי (VA) היא גישה חדשה לניתוח נתונים באופן אינטראקטיבי. בסרטון הזה, אנו דנים את הבעיה עומס הנתונים שהובאו על ידי תפוקה גבוהה ניסויים ביולוגיים, ולהציע VA כפתרון לבעיה כזו. הסרטון מדגים ניתוח בתוך ובין מערכי נתונים החיסונית באמצעות כלי VA נקרא המחזה.
Abstract
ניתוח חזותי (VA) התפתחה בדרך חדשה לניתוח במערך גדול באמצעות תצוגה ויזואלית אינטראקטיבית. אנחנו הדגימו את התועלת ואת הגמישות של גישה VA בניתוח מערכי נתונים ביולוגיים. דוגמאות של מערכי נתונים אלה כוללים באימונולוגיה cytometry זרימה, נתונים Luminex ו genotyping (למשל, פולימורפיזם נוקלאוטיד בודד) הנתונים. בניגוד לגישה המסורתית מידע חזותי, VA משחזר את כוח ניתוח בידי האנליסט בכך שהוא מאפשר למטפל לעסוק בתהליך נתונים בזמן אמת חקירה. בחרנו את התוכנה VA נקרא המחזה לאחר הערכת הכלים VA מספר. שני סוגים של משימות ניתוח ניתוח בתוך ובין מערכי נתונים היו הפגינו במצגת וידאו באמצעות גישה המכונה ניתוח לזווג. ניתוח מותאמים, כהגדרתו VA, היא גישה לניתוח שבו מומחה כלי VA עובד Side-by-הצד עם מומחה תחום במהלך הניתוח. מומחה תחום הוא זה שמבין את המשמעות של הנתונים, ושואלת את השאלות הנתונים שנאספו אולי הכתובת. מומחה כלי מכן יוצר חזותיים כדי לעזור למצוא דפוסים בנתונים שעשויים לענות על השאלות האלה. זמן קצר בפיגור בין הדור השערה ואת התצוגה החזותית מהירה של נתונים היא היתרון העיקרי של גישה VA.
Protocol
Discussion
הופעת הטכנולוגיה תפוקה גבוהה במחקר ביו המודרנית הובילה לפיצוץ של נתוני מחקר הדורש דרך יעילה יותר של ניתוח. ניתוח חזותי (VA) היא מדע חשיבה אנליטית בהנחייתם של ממשקים ויזואליים אינטראקטיביים (1). הגישה VA משחזר את כוח אנליטי בידי האנליסט אדם, בניגוד לגישה המסורתית כדי לזה?…
Disclosures
The authors have nothing to disclose.
Acknowledgements
ברצוננו להודות לחברי ונקובר המכון חזותית Analytics (VIVA) להנפקה הערות ועצות עבור הפרויקט. בפרט, אנו רוצים להודות ג'ון דיל, בריאן פישר, דוד Darvill. אנו רוצים גם להודות לחברי המעבדה קולמן על תמיכתם דיונים מועילים. עבודה זו נתמכה בחלקה על ידי המכון הלאומי לאלרגיה ומחלות זיהומיות, המכון הלאומי לבריאות גרנט N01 AI50023: NCE אלרגן מענקים 07-A1a ו 07-B2B, ואת מייקל סמית הקרן לחקר בריאות. TRK הוא נתמך בחלקו על ידי פרס קריירה בתחום המדע ביו מן המודעה קרן Wellcome בורוז על ידי מכוני קנדי למענק מחקר בריאות הדרכה בתוכנית הקנדי לבריאות הילד המדען המטפל, בשיתוף עם ילדים חולים, קרן הילד והמשפחה מכון המחקר ( קולומביה הבריטית), נשים בריאות ילדים מחקר של המכון (אלברטה), ו מניטובה המכון לבריאות הילד.
References
- Thomas, J., Cook, K. Illuminating the Path: The Research and Development Agenda for Visual Analytics. , (2005).
- Steed, C., Swan, J., Jankun-Kelly, T., Fitzpatrick, P. Guided Analysis of Hurricane Trends Using Statistical Processes Integrated with Interactive Parallel Coordinates. IEEE Symposium on Visual Analytics Science and Technology. , 19-26 (2009).
- Saraiya, P., North, C., Lam, V., Duca, K. An Insight-Based Longitudinal Study of Visual Analytics. IEEE Transactions on Visualization and Computer Graphics. 12, 1511-1522 (2006).
- Kollmann, T. R., Crabtree, J., Rein-Weston, A., Blimkie, D., Thommai, F., Wang, X. Y., Lavoie, P. M., Furlong, J., Fortuno, E. S., Hajjar, A. M., Hawkins, N. R., Self, S. G., Wilson, C. B. Neonatal innate TLR-mediated responses are distinct from those of adults. J. Immunol. 183, 7150-7160 (2009).
