تيسير تحليل البيانات مناعية مع التقنيات التحليلية البصرية
Summary
تحليلات بصرية (VA) هو نهج جديد من تحليل البيانات بشكل تفاعلي. في هذا الفيديو ، نناقش مشكلة الزائد البيانات الناتجة عن الإنتاجية العالية التجارب البيولوجية ، واقتراح VA كحل لمشكلة من هذا القبيل. شريط الفيديو يظهر تحليل داخل وبين مجموعات البيانات المناعية باستخدام أداة تسمى VA تابلوه.
Abstract
وقد ظهرت تحليلات بصرية (VA) بوصفه وسيلة جديدة لتحليل بيانات كبيرة من خلال العرض المرئي التفاعلي. أثبتنا فائدة ومرونة نهج VA في تحليل قواعد البيانات البيولوجية. أمثلة من هذه المجموعات في علم المناعة وتشمل التدفق الخلوي ، والبيانات Luminex ، والتنميط الجيني (على سبيل المثال ، تعدد الأشكال النوكليوتيدات واحد) البيانات. خلافا لنهج المعلومات التصور التقليدي ، VA استعادة السلطة في أيدي تحليل المحلل المحلل بالسماح للانخراط في الوقت الحقيقي عملية التنقيب عن البيانات. اخترنا البرنامج VA دعا تابلوه بعد تقييم VA أدوات عدة. وقد برهنت على نوعين من التحليل تحليل المهام داخل وبين قواعد البيانات في عرض الفيديو باستخدام هذا النهج دعا تحليل المقترنة. تحليل مقترن ، على النحو المحدد في فرجينيا ، هو نهج التحليل الذي خبير VA أداة تعمل جنبا إلى جنب مع خبراء المجال أثناء التحليل. الخبير المجال هو ذاك الذي يدرك أهمية البيانات ، ويطلب من الأسئلة التي قد تعالج البيانات التي تم جمعها. الخبير أداة ثم يخلق تصورات للمساعدة على إيجاد أنماط في البيانات التي قد تجيب على هذه الأسئلة. على المدى القصير الفجوة الزمنية بين الجيل فرضية وعرض سريع للبيانات البصرية هي الميزة الرئيسية للنهج فرجينيا.
Protocol
Discussion
أدى ظهور الإنتاجية العالية التكنولوجيا في البحوث الطبية الحيوية الحديثة في انفجار بيانات البحوث التي تتطلب طريقة أكثر فعالية من التحليل. تحليلات بصرية (VA) هو علم المنطق التحليلي ييسرها واجهات البصرية التفاعلية (1). نهج VA يستعيد السلطة التحليلية في يد المحلل الإنسان ،…
Disclosures
The authors have nothing to disclose.
Acknowledgements
نود أن نشكر أعضاء معهد فانكوفر التحليلات البصرية (فيفا) لتقديم التعليقات والمشورة للمشروع. على وجه الخصوص ، نود أن نشكر جون الشبت ، برايان فيشر ، وDarvill ديفيد. نود أيضا أن نشكر أعضاء المختبر Kollmann لما قدموه من دعم ومناقشات مفيدة. وأيد هذا العمل في جزء من المعهد الوطني للحساسية والأمراض المعدية ، المعهد الوطني للصحة منح N01 AI50023 ؛ المنح NCE حساسية A1A 07 – 07 وB2B ؛ ومايكل سميث مؤسسة للبحوث الصحية. ويدعم TRK جزئيا على جائزة شهادة في العلوم الطبية الحيوية من إعلان صندوق بوروز ويلكوم من قبل المعاهد الكندية لأبحاث الصحة الكندية منح تدريبية في برنامج الصحة عالم الطفل الطبيب ، في شراكة مع أطفال المرضى ، مؤسسة الطفل والأسرة معهد بحوث ( كولومبيا البريطانية) ، والمرأة والطفل الصحة معهد بحوث (البرتا) ، ومانيتوبا معهد صحة الطفل.
References
- Thomas, J., Cook, K. Illuminating the Path: The Research and Development Agenda for Visual Analytics. , (2005).
- Steed, C., Swan, J., Jankun-Kelly, T., Fitzpatrick, P. Guided Analysis of Hurricane Trends Using Statistical Processes Integrated with Interactive Parallel Coordinates. IEEE Symposium on Visual Analytics Science and Technology. , 19-26 (2009).
- Saraiya, P., North, C., Lam, V., Duca, K. An Insight-Based Longitudinal Study of Visual Analytics. IEEE Transactions on Visualization and Computer Graphics. 12, 1511-1522 (2006).
- Kollmann, T. R., Crabtree, J., Rein-Weston, A., Blimkie, D., Thommai, F., Wang, X. Y., Lavoie, P. M., Furlong, J., Fortuno, E. S., Hajjar, A. M., Hawkins, N. R., Self, S. G., Wilson, C. B. Neonatal innate TLR-mediated responses are distinct from those of adults. J. Immunol. 183, 7150-7160 (2009).
