התמרה חלבון ומאפשרת העברה ישירה של חלבונים פעילים ביולוגית לתוך התאים. בניגוד לשיטות קונבנציונליות כגון transfection DNA נגיפי או התמרה זו פרדיגמה פולשנית מאפשרת מניפולציה הסלולר היעילה ביותר באופן titratable עקיפת רעילות הסלולר את הסיכון של שינוי בשעור על ידי הנדסה גנטית קבע.
הטכניקה התמרה חלבון ומאפשרת העברה ישירה של החומר הפעיל מבחינה ביולוגית לתוך בתאי יונקים [לבדיקה לראות 1,2]. עבור אחד זה יכול לעשות שימוש ביכולת translocating של המכונים פפטידים בתא החודר (CPPs), המיועד גם התמרה תחומים חלבון (PTDs). TAT-CPP נגזר סוג נגיף הכשל החיסוני האנושי 1 (HIV-1) תאת (טרנס activator של שעתוק) חלבון כבר בשימוש נרחב. תאת חיובי ומקדם חדירות התא ובכך להתגבר על מחסומים של קרום התא על ידי אנדוציטוזה ו / או חדירה קרום ישיר 2. בשילוב עם אות לוקליזציה גרעיני (NLS) חלבונים היתוך מסוגלים להיכנס פונקציונליות גרעין בתערוכה. מצגת וידאו שלנו מוכיח, כמו הדגמה של הנדסה של התא חדיר חלבונים, הבנייה, ייצור ויישום של גרסת התא חדיר של שינוי ה-DNA אנזים Cre.
Cre הוא recombinase אתר ספציפי כי הוא מסוגל לזהות recombine 34 זוג בסיס אתרי loxP בתאי יונקים במבחנה in vivo. לכן מערכת Cre / loxP נעשה שימוש נרחב על תנאי להשרות מוטציות בגנום של תאים חיים 3,4. מסירת פעיל Cre recombinase לתאים, לעומת זאת, מהווה מגבלה.
אנו מתארים את מערכת וקטור pSESAME, המאפשר החדרה ישירה של הריבית גנים של מספק פלטפורמה במהירות שיבוט תחומים שונים ותגי בשימוש בתוך וקטור בצורה נוחה סטנדרטית. סידור מחדש של תגים שונים הוכח כדי לשנות את המאפיינים הביוכימיים של חלבונים היתוך מתן אפשרות להשיג תשואה גבוהה יותר מסיסות טובה יותר. אנו מדגימים כיצד לבטא ולטהר רקומביננטי התא permeant חלבונים מ החיידק. הפונקציונליות של החלבון Cre רקומביננטי הוא תוקף בסופו של דבר על ידי הערכת הפעילות recombinase תאיים בתרבות התא.
במהלך תהליך טיהור של החלבון היתוך Cre חשוב לא להשמיט את התוספת של חיץ קרח כפות קר לפני צנטריפוגה. אחרת Cre recombinase נוטה לשקוע בתוך למאגר גליצרול.
אם חלק eluate מופיע להיות עכורים בשל ריכוז גבוה של חלבון חיץ היתוך elution נוספים יש להוסיף עד לפתרון פינתה שוב.
היישום של 10 מיקרומטר של חלבון היתוך Cre בדרך כלל התוצאות יעילות רקומבינציה של 80% עד 100. עוברית עגל סרום (FCS) להיות מרכיב מרכזי של המדיום הסלולרי ES מאוד מעכב חלבון התמרה. לכן ריכוז גבוה של Cre recombinase היה לשמש. כאשר עובדים בסרום ללא תנאים פחות חלבון (0.5-2 מיקרומטר) ניתן להשתמש כדי להשיג יעילות רקומבינציה דומה.
עם מערכת וקטור pSESAME ב מצד אחד יכול ליישם את הטכניקה של התמרה החלבון לחלבונים אחרים, כולל גורמי שעתוק כגון Oct4 ו Sox2 7 ו – 8 Scl/Tal1.
אנו מודים אוליבר Brüstle וכל חברי קבוצת תא גזע להנדסה, אוניברסיטת בון, לתמיכה ודיונים יקר. אנו מודים סבין שנק להכנת SDS-PAGE ותמיכה מתמשכת לאורך הפרויקט. ניקול ראס ואנה Magerhans סיפק תמיכה טכנית מעולה. יתר על כן, אנו רוצים להודות אנדריאס בר שילה Mertens להפקת הסרט. עבודה זו נתמכה על ידי מענקים מקרן פולקסווגן (Az I/77864) ומשרד הגרמני לחינוך ולמחקר (BMBF, 01 GN 0813).
Material Name | Type | Company | Catalogue Number | Comment |
---|---|---|---|---|
TUNER (DE3) pLacI | Novagen | 70625 | ||
Glycerol | Carl Roth | 3783.2 | ||
Na2HPO4 | Roth | T876.1 | ||
Trizma Base | Sigma-Aldrich | T1503 | ||
HCl | Roth | 4625.1 | ||
Imidazol | Roth | X998.4 | ||
NaCl | Roth | 9265.2 | ||
Yeast Extract | Roth | 2363.4 | ||
Trypton/Pepton | Roth | 8952.4 | ||
K2HPO4 | Roth | P749.2 | ||
KH2PO4 | Roth | 3904.1 | ||
Ampicillin | Sigma | A9518 | ||
Carbenicillin | Sigma | 6344.2 | ||
HEPES | Sigma | H3375 | ||
Lysozyme | Sigma | 62971 | ||
Benzonase | Novagen | |||
L-Tartaric acid, disodium salt | Sigma | |||
50% Ni-NTA slurry | Invitrogen | R901-15 | ||
EconoPac columns | Biorad | 732-1010 | ||
Sterile filter 0,22μm | Whatman | |||
Paraformaldehyde (PFA) | Sigma | |||
LB medium | Yeast extract, Trypton/Pepton, NaCl | |||
TB medium | Yeast extract, Trypton/Pepton, Glycerol, K2HPO4, KH2PO4 | |||
Lysis Buffer | 50 mM Na2HPO4, 5 mM Tris, pH 7.8 | |||
Tartaric Salt Buffer (TSB) | PTB containing 2 M L-Tartaric acid, disodium salt, and 20 mM Imidazol | |||
Washing Buffer | PTB, 500 mM NaCl, 15 mM Imidazol | |||
Elution Buffer | PTB, 500 mM NaCl, 250 mM Imidazol | |||
High Salt Buffer | 600 mM NaCl, 20 mM HEPES, pH 7.4 | |||
Gylcerol Buffer | 50% glycerol, 500 mM NaCl, 20 mM HEPES, pH 7.4 | |||
TrypLE™ Express | Invitrogen | |||
ESGRO (LIF) | Millipore | |||
NEAA | Gibco | 11140035 | ||
L-Glutamin | Gibco | 25030024 | ||
β-Mercaptoethanol | Gibco | 31350010 | ||
DMEM | Gibco | 11960044 | ||
PBS | Gibco | |||
Fetal Calf Serum (FCS) | PAA | |||
X-Gal staining solution: | 4 mM K3(FeIII(CN)6), 4 mM K4(FeII(CN)6), 2mM MgCl2 0.4 mg/mL X-Gal solved in PBS |
|||
K3(FeIII(CN)6) | Sigma | P-3367 | ||
K4 (FeII(CN)6) | Sigma | P-9387 | ||
MgCl2 | Sigma | M8266 | ||
X-Gal | Sigma | B4252 |