00:56Developing and Running a SeqAPASS Query: Level 1
02:43Developing and Running a SeqAPASS Query: Level 2
03:47Accessing and Understanding the Data: SeqAPASS Level 1 and Level 2
05:54Manipulating Data Settings and Visualizing the Data: SeqAPASS Level 1 and Level 2
07:23Developing and Running a SeqAPASS Analysis: Level 3
08:28Identify Critical Amino Acid Residues through a Literature Search
10:54Visualizing Level 3 SeqAPASS Data and Interpretation of Results
13:45Results: SeqAPASS Level 1, 2, and 3 Analyses of the Conservation of Amino Acid Residues and Level 1 and 2 Analyses of μ Opioid Receptor Conservation Across Taxonomic Groups
Här presenterar vi ett protokoll för att använda den senaste versionen av verktyget US Environmental Protection Agency Sequence Alignment to Predict Across Species Susceptibility (SeqAPASS). Detta protokoll visar tillämpningen av onlineverktyget för att snabbt analysera proteinbevarande och ge anpassningsbara och lättolkade förutsägelser om kemisk mottaglighet mellan arter.