Dimostrazione dell'allineamento delle sequenze per prevedere lo strumento di suscettibilità tra le specie per una rapida valutazione della conservazione delle proteine
00:56Developing and Running a SeqAPASS Query: Level 1
02:43Developing and Running a SeqAPASS Query: Level 2
03:47Accessing and Understanding the Data: SeqAPASS Level 1 and Level 2
05:54Manipulating Data Settings and Visualizing the Data: SeqAPASS Level 1 and Level 2
07:23Developing and Running a SeqAPASS Analysis: Level 3
08:28Identify Critical Amino Acid Residues through a Literature Search
10:54Visualizing Level 3 SeqAPASS Data and Interpretation of Results
13:45Results: SeqAPASS Level 1, 2, and 3 Analyses of the Conservation of Amino Acid Residues and Level 1 and 2 Analyses of μ Opioid Receptor Conservation Across Taxonomic Groups
Qui, presentiamo un protocollo per utilizzare l'ultima versione dello strumento SeqAPASS (Sequence Alignment to Predict Across Species Suceptibility) dell'Agenzia per la protezione ambientale degli Stati Uniti. Questo protocollo dimostra l'applicazione dello strumento online per analizzare rapidamente la conservazione delle proteine e fornire previsioni personalizzabili e facilmente interpretabili della suscettibilità chimica tra le specie.