Den gjennomvåte perleanalysen innebærer målrettet levering av testreagens på ethvert utviklingsmessig tidspunkt for å studere reguleringen av celledifferensiering og morfogenese. En detaljert protokoll, som gjelder for enhver eksperimentell dyremodell, for å forberede tre forskjellige typer gjennomvåt perler og implantere disse i mellombarn av et kyllingembryo, presenteres.