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JUMPn : Une application simplifiée pour le regroupement de la co-expression des protéines et l’analyse des réseaux en protéomique
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JUMPn : Une application simplifiée pour le regroupement de la co-expression des protéines et l’analyse des réseaux en protéomique
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07:28 min
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October 19, 2021
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Nous présentons un outil de biologie des systèmes JUMPn pour effectuer et visualiser l’analyse de réseau pour des données protéomiques quantitatives, avec un protocole détaillé comprenant le prétraitement des données, le regroupement de co-expression, l’enrichissement des voies et l’analyse du réseau d’interaction protéine-protéine.
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Vanderwall, D., Suresh, P., Fu, Y., Cho, J., Shaw, T. I., Mishra, A., High, A. A., Peng, J., Li, Y. JUMPn: A Streamlined Application for Protein Co-Expression Clustering and Network Analysis in Proteomics. J. Vis. Exp. (176), e62796, doi:10.3791/62796 (2021).
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