Här presenterar vi ett protokoll där enstaka celler övervakas för akuta händelser och produktiv HIV-1-infektion på en nanofluidisk enhet. Bilddata definierar interaktioner mellan virusvärdreceptorer och signalvägsdynamik. Detta är den första metoden för nanofluidisk hög genomströmnings longitudinell encellig kultur och avbildning för att studera signaleringsk kinetik och molekylära interaktioner.