Journal
/
Ambiente
/
Utvikling og testing av artsspesifikke kvantitative PCR-analyser for miljø-DNA-applikasjoner
JoVE Journal
Ambiente
This content is Free Access.
JoVE Journal Ambiente
Development and Testing of Species-specific Quantitative PCR Assays for Environmental DNA Applications

Utvikling og testing av artsspesifikke kvantitative PCR-analyser for miljø-DNA-applikasjoner

DOI:
10.3791/61825-v

•

08:54 min

•

November 05, 2020

•

, , ,
1Columbia Environmental Research Center,U.S. Geological Survey

Capítulos

  • 00:04Introduction
  • 01:18Generation of a Sequence Database of Mitochondrial DNA Sequences from Target and Non-target Species of Interest
  • 02:03Assay Design
  • 03:56Assay Screening and Optimization
  • 06:21Results: A. ligamentina qPCR Assay
  • 08:23Conclusion

Summary

Tadução automática

Tadução automática

Miljø-DNA-analyser krever streng design, testing, optimalisering og validering før innsamling av feltdata kan begynne. Her presenterer vi en protokoll for å ta brukerne gjennom hvert trinn for å designe en artsspesifikk, sondebasert qPCR-analyse for deteksjon og kvantifisering av et målarts-DNA fra miljøprøver.

Tags

Keywords: Environmental DNAEDNAQuantitative PCRQPCRSpecies-specific AssayAssay DesignSequence AlignmentNCBIGeneiousMUSCLEPrimer DesignProbe DesignContaminationConservationWildlife Management

Article

Embed

ADICIONAR À PLAYLIST

Usage Statistics

Vídeos Relacionados

check_url/pt/61825?article_type=v

Protokoller for Robust herbicidresistens Testing i ulike Ugressarter
check_url/pt/61825?article_type=v

Utarbeidelse og testing av Impedans baserte fluidic biochips med RTgill-W1 Cells for Rapid Evaluering av drikkevann Prøver for Toxicity
check_url/pt/61825?article_type=v

Samtidig DNA-RNA Utvinning fra Kyst Sedimenter og kvantifisering av 16S rRNA gener og transkripsjoner av Real-time PCR
check_url/pt/61825?article_type=v

Bruk av en filterpatron for filtrering av vannprøver og Utvinning av Miljø DNA
check_url/pt/61825?article_type=v

En Gjennomstrømning Eksponering system for evaluering suspenderte sedimenter effekter på akvatisk liv
check_url/pt/61825?article_type=v

Evaluere effekten av miljø Kjemikalier på Honey Bee utvikling fra den enkelte til Colony nivå
check_url/pt/61825?article_type=v

Spredning av nanomaterialer i vandige Media: mot protokollen optimalisering
check_url/pt/61825?article_type=v

Utarbeidelse av DMMTAV og DMDTAV bruker DMAV for miljømessige programmer: syntese, rensing og bekreftelse
check_url/pt/61825?article_type=v

Oppstandelsen av sovende Daphnia magna: protokollen og programmer
check_url/pt/61825?article_type=v

Protokoll for akutt og kronisk Forurenset emballasje Testing av turkis Killifish Nothobranchius furzeri

Read Article