Journal
/
Química
/
AB Initio Moleküler Dinamik Simülasyonlarından Eriyik ve Sıvıların UMD Paketi ile Analizi
JoVE Journal
Química
This content is Free Access.
JoVE Journal Química
Analyzing Melts and Fluids from Ab Initio Molecular Dynamics Simulations with the UMD Package
Please note that all translations are automatically generated. Click here for the English version.

AB Initio Moleküler Dinamik Simülasyonlarından Eriyik ve Sıvıların UMD Paketi ile Analizi

DOI:
10.3791/61534-v

•

06:37 min

•

September 17, 2021

•

, , , , ,
1Ecole Normale Supérieure de Lyon, Laboratory of Geology of Lyon UMR5276,CNRS, 2Centre for Earth Evolution and Dynamics (CEED),University of Oslo, 3CEA, DAM, DIF

Capítulos

  • 00:05Introduction
  • 00:24Analysis of the Molecular-dynamics Runs
  • 01:15Perform the Structural Analysis
  • 02:05Perform the Speciation Analysis
  • 02:51Compute Diffusion Coefficients
  • 03:27Time Correlation Functions
  • 04:04Thermodynamic Parameters Stemming from the Simulations
  • 04:29Results: Lifetime of the Si-O Chemical Species
  • 05:59Conclusion

Summary

Tadução automática

Tadução automática

Eriyikler ve sıvılar doğal sistemlerde kütle taşımacılığının her yerde bulunan vektörleridir. Bu tür sistemlerin ab initio moleküler-dinamik simülasyonlarını analiz etmek için açık kaynaklı bir paket geliştirdik. Yapısal (yapıştırma, kümelenme, kimyasal belirtim), taşıma (difüzyon, viskozite) ve termodinamik özellikleri (titreşim spektrumu) hesaplıyoruz.

Tags

Ab Initio Molecular DynamicsUMD PackagePhysical PropertiesChemical PropertiesFluidsPython ScriptsMD SimulationVASPPair Distribution FunctionInteratomic Bond DistancesCoordination PolyhedraPolymerizationMean Square DisplacementSelf-diffusivityDiffusion Coefficients

Article

Embed

ADICIONAR À PLAYLIST

Usage Statistics

Vídeos Relacionados

Gram-negatif bakterilerin izolasyonu ve Lipid A kimyasal karakterizasyonu

Hidrojen Değişim Kütle Spektrometre Kullanarak Protein Dinamiği Analizi

Lignification Dynamics ile tıklatın kimya tesislerinde görselleştirme: Çift etiketleme BLISS olduğunu!

Yakıtların yanma kimya: bir atmosferik yüksek sıcaklık akışı reaktör ile elde edilen nicel Türleşme veri birleştiğinde ışın moleküler Kütle Spektrometre

Tarama tünelleme mikroskobu ve spektroskopi ile Interfacial su dinamiği ve yapısını sondalama

Tek nano tanecikleri analiz etmek için kapalı tip kablosuz Nanopore elektrot

Türdeş olmayan su/Metal Catalyst arabirimi yoğunluğu fonksiyonel teorisi ve güç alanı moleküler dinamik kullanarak multiscale örnekleme

Sulu Aerobik Koşullarda Güneş Odaklı H2 Üretimi için Photosensitizer-Cobaloxime Hybrids geliştirme

Bir Oda Sıcaklığı iyonik Sıvı ile solvated Ampirik-Potansiyel Moleküler Dinamiksimülasyon bir N719-Kromofor / Titania Arayüzü Titreşimsel Spectra

Ab initio Termochemistry'den Moleküler Kümelerin Atmosferik Konsantrasyonlarının Hesaplanması

Read Article