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Analisando derretimentos e fluidos de simulações de dinâmica molecular da Ab Initio com o pacote UMD
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Analyzing Melts and Fluids from Ab Initio Molecular Dynamics Simulations with the UMD Package

Analisando derretimentos e fluidos de simulações de dinâmica molecular da Ab Initio com o pacote UMD

DOI:
10.3791/61534-v

•

06:37 min

•

September 17, 2021

•

, , , , ,
1Ecole Normale Supérieure de Lyon, Laboratory of Geology of Lyon UMR5276,CNRS, 2Centre for Earth Evolution and Dynamics (CEED),University of Oslo, 3CEA, DAM, DIF

Capítulos

  • 00:05Introduction
  • 00:24Analysis of the Molecular-dynamics Runs
  • 01:15Perform the Structural Analysis
  • 02:05Perform the Speciation Analysis
  • 02:51Compute Diffusion Coefficients
  • 03:27Time Correlation Functions
  • 04:04Thermodynamic Parameters Stemming from the Simulations
  • 04:29Results: Lifetime of the Si-O Chemical Species
  • 05:59Conclusion

Summary

Tadução automática

Tadução automática

Derretimentos e fluidos são vetores onipresentes do transporte em massa em sistemas naturais. Desenvolvemos um pacote de código aberto para analisar simulações de dinâmica molecular ab initio de tais sistemas. Calculamos propriedades estruturais (ligação, clusterização, especiação química), transporte (difusão, viscosidade) e propriedades termodinâmicas (espectro vibracional).

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Ab Initio Molecular DynamicsUMD PackagePhysical PropertiesChemical PropertiesFluidsPython ScriptsMD SimulationVASPPair Distribution FunctionInteratomic Bond DistancesCoordination PolyhedraPolymerizationMean Square DisplacementSelf-diffusivityDiffusion Coefficients

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