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UMD 패키지로 Ab Initio 분자 역학 시뮬레이션에서 용융 및 유체 분석
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Analyzing Melts and Fluids from Ab Initio Molecular Dynamics Simulations with the UMD Package
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UMD 패키지로 Ab Initio 분자 역학 시뮬레이션에서 용융 및 유체 분석

DOI:
10.3791/61534-v

•

06:37 min

•

September 17, 2021

•

, , , , ,
1Ecole Normale Supérieure de Lyon, Laboratory of Geology of Lyon UMR5276,CNRS, 2Centre for Earth Evolution and Dynamics (CEED),University of Oslo, 3CEA, DAM, DIF

Capítulos

  • 00:05Introduction
  • 00:24Analysis of the Molecular-dynamics Runs
  • 01:15Perform the Structural Analysis
  • 02:05Perform the Speciation Analysis
  • 02:51Compute Diffusion Coefficients
  • 03:27Time Correlation Functions
  • 04:04Thermodynamic Parameters Stemming from the Simulations
  • 04:29Results: Lifetime of the Si-O Chemical Species
  • 05:59Conclusion

Summary

Tadução automática

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용융 및 유체는 자연 시스템에서 대량 수송의 유비쿼터스 벡터입니다. 우리는 이러한 시스템의 ab initio 분자 역학 시뮬레이션을 분석하기 위해 오픈 소스 패키지를 개발했습니다. 우리는 구조 (접합, 클러스터화, 화학 적 분석), 운송 (확산, 점도) 및 열역학 적 특성 (진동 스펙트럼)을 계산합니다.

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Ab Initio Molecular DynamicsUMD PackagePhysical PropertiesChemical PropertiesFluidsPython ScriptsMD SimulationVASPPair Distribution FunctionInteratomic Bond DistancesCoordination PolyhedraPolymerizationMean Square DisplacementSelf-diffusivityDiffusion Coefficients

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