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Analyse des fusions et des fluides à partir de simulations de dynamique moléculaire Ab Initio avec le package UMD
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Analyzing Melts and Fluids from Ab Initio Molecular Dynamics Simulations with the UMD Package
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Analyse des fusions et des fluides à partir de simulations de dynamique moléculaire Ab Initio avec le package UMD

DOI:
10.3791/61534-v

•

06:37 min

•

September 17, 2021

•

, , , , ,
1Ecole Normale Supérieure de Lyon, Laboratory of Geology of Lyon UMR5276,CNRS, 2Centre for Earth Evolution and Dynamics (CEED),University of Oslo, 3CEA, DAM, DIF

Capítulos

  • 00:05Introduction
  • 00:24Analysis of the Molecular-dynamics Runs
  • 01:15Perform the Structural Analysis
  • 02:05Perform the Speciation Analysis
  • 02:51Compute Diffusion Coefficients
  • 03:27Time Correlation Functions
  • 04:04Thermodynamic Parameters Stemming from the Simulations
  • 04:29Results: Lifetime of the Si-O Chemical Species
  • 05:59Conclusion

Summary

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Les fusions et les fluides sont des vecteurs omniprésents de transport de masse dans les systèmes naturels. Nous avons développé un progiciel open source pour analyser les simulations de dynamique moléculaire ab initio de tels systèmes. Nous calculons les propriétés structurelles (liaison, clusterisation, spéciation chimique), de transport (diffusion, viscosité) et thermodynamiques (spectre vibratoire).

Tags

Ab Initio Molecular DynamicsUMD PackagePhysical PropertiesChemical PropertiesFluidsPython ScriptsMD SimulationVASPPair Distribution FunctionInteratomic Bond DistancesCoordination PolyhedraPolymerizationMean Square DisplacementSelf-diffusivityDiffusion Coefficients

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