Journal
/
Química
/
使用 UMD 软件包分析 Ab Initio 分子动力学模拟中的熔体和流体
JoVE Journal
Química
This content is Free Access.
JoVE Journal Química
Analyzing Melts and Fluids from Ab Initio Molecular Dynamics Simulations with the UMD Package
Please note that all translations are automatically generated. Click here for the English version.

使用 UMD 软件包分析 Ab Initio 分子动力学模拟中的熔体和流体

DOI:
10.3791/61534-v

•

06:37 min

•

September 17, 2021

•

, , , , ,
1Ecole Normale Supérieure de Lyon, Laboratory of Geology of Lyon UMR5276,CNRS, 2Centre for Earth Evolution and Dynamics (CEED),University of Oslo, 3CEA, DAM, DIF

Capítulos

  • 00:05Introduction
  • 00:24Analysis of the Molecular-dynamics Runs
  • 01:15Perform the Structural Analysis
  • 02:05Perform the Speciation Analysis
  • 02:51Compute Diffusion Coefficients
  • 03:27Time Correlation Functions
  • 04:04Thermodynamic Parameters Stemming from the Simulations
  • 04:29Results: Lifetime of the Si-O Chemical Species
  • 05:59Conclusion

Summary

Tadução automática

Tadução automática

熔体和流体是自然系统中无处不在的质量传递载体。我们开发了一个开源软件包来分析此类系统的分子动力学模拟。我们计算结构（键合，聚类，化学形态），传递（扩散，粘度）和热力学性质（振动光谱）。

Tags

Ab Initio Molecular DynamicsUMD PackagePhysical PropertiesChemical PropertiesFluidsPython ScriptsMD SimulationVASPPair Distribution FunctionInteratomic Bond DistancesCoordination PolyhedraPolymerizationMean Square DisplacementSelf-diffusivityDiffusion Coefficients

Article

Embed

ADICIONAR À PLAYLIST

Usage Statistics

Vídeos Relacionados

隔离和脂质A的化学表征革兰氏阴性菌

使用氢交换质谱分析蛋白质动力学

点击化学可视化植物木动力学: 双标记是幸福!

燃料燃烧化学: 用耦合分子束质谱仪从大气高温流反应器中获得的定量形态数据

用扫描隧穿显微镜和光谱法探讨界面水的结构和动力学

一种用于分析单纳米粒子的闭式无线纳米粒子电极

利用密度泛函理论和力场分子动力学对多相水-金属催化剂接口进行多尺度采样

开发用于在水有条件条件下进行太阳能驱动 H2生产的光敏剂-钴氧混合剂

N719-色光/钛合金界面的振动光谱，来自经验-电位分子动力学模拟，由室温离子液体解低

来自甲流热化学分子簇的大气浓度计算

Read Article