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Une plate-forme de spectrométrie de masse d’échange hydrogène-deutérium (HDX-MS) pour étudier les enzymes biosynthétiques peptidiques
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JoVE Journal Bioquímica
A Hydrogen-Deuterium Exchange Mass Spectrometry (HDX-MS) Platform for Investigating Peptide Biosynthetic Enzymes
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Une plate-forme de spectrométrie de masse d’échange hydrogène-deutérium (HDX-MS) pour étudier les enzymes biosynthétiques peptidiques

DOI:
10.3791/61053-v

•

11:32 min

•

May 04, 2020

•

,
1Department of Chemistry,McGill University

Capítulos

  • 00:04Introduction
  • 00:36Bottom-Up Liquid Chromatography-Mass Spectrometry (LC-MS) Reference Sample Workflow Preparation
  • 01:18Reference Data Processing and Peptide List Definition
  • 05:05Hydrogen-Deuterium Exchange (HDX) Reactions
  • 06:36HDX Data Processing, Analysis, and Visualization
  • 09:03Results: Reapresentative HDX-MS Peptide Biosynthetic Enzyme Evaluation
  • 10:44Conclusion

Summary

Tadução automática

Tadução automática

Les synthetases de lanthipeptide catalysent les réactions en plusieurs étapes pendant la biosynthèse des produits naturels peptidiques. Ici, nous décrivons un flux de travail continu, ascendant, de spectrométrie de masse d’échange hydrogène-deutérium (HDX-MS) qui peut être employé pour étudier la dynamique conformationnelle des synthetases de lanthipeptide, aussi bien que d’autres enzymes semblables impliquées dans la biosynthèse de produit naturel de peptide.

Tags

Keywords: Hydrogen-Deuterium Exchange Mass Spectrometry (HDX-MS)Protein Conformational DynamicsProtein Of InterestQuench BufferBottom-up Liquid Chromatography Mass SpectrometryProteomic Software ProgramFASTA FormatElectrospray MSEGlucan One Fiber No Peptide BNonspecific DigestCarbamidomethyl CApex 3DPeptide 3DIon Accounting

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