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Rastreamento de pernas totalmente automatizado em insetos em movimento livre usando segmentação e rastreamento de pernas de aprendizagem de recursos (FLLIT)
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Fully Automated Leg Tracking in Freely Moving Insects using Feature Learning Leg Segmentation and Tracking (FLLIT)

Rastreamento de pernas totalmente automatizado em insetos em movimento livre usando segmentação e rastreamento de pernas de aprendizagem de recursos (FLLIT)

DOI:
10.3791/61012-v

•

08:04 min

•

April 23, 2020

•

, , ,
1Institute of Molecular and Cell Biology,Agency for Science, Technology and Research, 2Bioinformatics Institute,Agency for Science, Technology and Research, 3Department of Electrical and Computer Engineering,University of Alberta

Capítulos

  • 00:04Introduction
  • 00:43System Setup
  • 01:05Fly Preparation
  • 01:47Video Generation for Feature Learning Leg Segmentation and Tracking (FLLIT) Analysis
  • 02:52FLLIT Installation
  • 03:50Automated Leg Tracking
  • 05:13Data Processing and Video Generation
  • 05:54Representative Results: Automated Leg Movement Tracking in Freely-Moving Insects
  • 07:31Conclusion

Summary

Tadução automática

Tadução automática

Descrevemos protocolos detalhados para o uso do FLLIT, um método de aprendizado de máquina totalmente automatizado para rastreamento de movimento de garras de perna em movimento livre mente drosophila melanogaster e outros insetos. Esses protocolos podem ser usados para medir quantitativamente movimentos sutis de marcha ambulante em moscas do tipo selvagem, moscas mutantes e modelos de moscas de neurodegeneração.

Tags

Keywords: Leg TrackingFully AutomatedFeature LearningLeg SegmentationLeg TrackingFLLITGait AnalysisFreely Moving InsectsVideo RecordingHigh-speed CameraInfrared LEDAnesthetized FliesRecording ArenaLeg TipsStraight TrajectoryStrideBody LengthMrawTiffUbuntu

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