Journal
/
Bioquímica
/
Label-fri immunoprecipitation masspektrometri arbetsflöde för storskalig nukleär Interactome profilering
JoVE Journal
Bioquímica
This content is Free Access.
JoVE Journal Bioquímica
Label-Free Immunoprecipitation Mass Spectrometry Workflow for Large-scale Nuclear Interactome Profiling
Please note that all translations are automatically generated. Click here for the English version.

Label-fri immunoprecipitation masspektrometri arbetsflöde för storskalig nukleär Interactome profilering

DOI:
10.3791/60432-v

•

11:19 min

•

November 17, 2019

•

, ,
1Department of Molecular, Cellular and Developmental Biology,University of Colorado, 2Linda Crnic Institute for Down Syndrome,University of Colorado School of Medicine

Capítulos

  • 00:04Título
  • 01:07Preparation of Nuclear Extract
  • 03:45Immunoprecipitation of Endogenous Nuclear Bait Protein
  • 07:01Sample Preparation and LC/MS System Suitability
  • 09:09Results: A Single-bait Single-antibody IP-MS Experiment
  • 10:25Conclusion

Summary

Tadução automática

Tadução automática

Beskrivs är ett proteomik arbetsflöde för att identifiera protein interaktion partner från en nukleär subcellulär fraktion med hjälp av immunoaffinity berikning av ett givet protein av intresse och etikettfri masspektrometri. Arbetsflödet omfattar subcellulär fraktionering, immunoprecipitation, filterstödd provberedning, offlinerensning, masspektrometri och en nedströms bioinformatik-pipeline.

Tags

Label-freeImmunoprecipitationMass SpectrometryNuclear InteractomeProtein-protein InteractionsSubcellular FractionationAffinity PurificationProteomics WorkflowCell LysisNuclear LysateDounce Homogenization

Article

Embed

ADICIONAR À PLAYLIST

Usage Statistics

Vídeos Relacionados

Sheathless kapillärelektrofores-masspektrometri för Metabolic Profiling av biologiska prover

Tidsupplöst elektrosprayjonisering Väte-deuterium Exchange-masspektrometri för att studera Protein Structure and Dynamics

Lösa affinitetsrenat proteinkomplex av Blue Native PAGE och protein Korrelation profilering

Lipid Droplet Isolation för Kvantitativ masspektrometri Analys

Djupa proteomet profilering av isobariska märkning, omfattande vätskekromatografi, masspektrometri och programvara-assisted kvantifiering

Optimal förberedelse av formalinbeständiga prover för peptid baserat Matrix assisterad Laser Desorption/jonisering masspektrometri Imaging arbetsflöden

Nitropeptid profilering och identifiering illustrerad av angiotensin II

Provberedning för probe electrospray jonisering Masspektrometri

Kvantitativ analys av cellulär lipidom e av Saccharomyces Cerevisiae med hjälp av flytande kromatografi tillsammans med Tandem Mass Spectrometri

Stegvis doseringsprotokoll för ökat dataflöde i etikettfria Impedansbaserade GPCR-analyser

Read Article