Journal
/
Bioquímica
/
Label-fri Immunutfelling masse massespektrometri arbeidsflyt for stor skala kjernefysisk Interactome profilering
JoVE Journal
Bioquímica
This content is Free Access.
JoVE Journal Bioquímica
Label-Free Immunoprecipitation Mass Spectrometry Workflow for Large-scale Nuclear Interactome Profiling

Label-fri Immunutfelling masse massespektrometri arbeidsflyt for stor skala kjernefysisk Interactome profilering

DOI:
10.3791/60432-v

•

11:19 min

•

November 17, 2019

•

, ,
1Department of Molecular, Cellular and Developmental Biology,University of Colorado, 2Linda Crnic Institute for Down Syndrome,University of Colorado School of Medicine

Capítulos

  • 00:04Título
  • 01:07Preparation of Nuclear Extract
  • 03:45Immunoprecipitation of Endogenous Nuclear Bait Protein
  • 07:01Sample Preparation and LC/MS System Suitability
  • 09:09Results: A Single-bait Single-antibody IP-MS Experiment
  • 10:25Conclusion

Summary

Tadução automática

Tadução automática

Beskrevet er en Proteomikk arbeidsflyt for å identifisere protein interaksjon partnere fra en kjernefysisk subcellulære brøkdel ved hjelp av immunoaffinity berikelse av en gitt protein av interesse og etikett-fri masse massespektrometri. Arbeidsflyten inkluderer subcellulære fraksjonering, immunutfelling, filter hjulpet prøve forberedelser, frakoblet opprydding, masse massespektrometri og en nedstrøms bioinformatikk rørledning.

Tags

Label-freeImmunoprecipitationMass SpectrometryNuclear InteractomeProtein-protein InteractionsSubcellular FractionationAffinity PurificationProteomics WorkflowCell LysisNuclear LysateDounce Homogenization

Article

Embed

ADICIONAR À PLAYLIST

Usage Statistics

Vídeos Relacionados

Sheathless Kapillær elektroforese-massespektrometri for Metabolsk profilering av biologiske prøver

Time-løst elektrospray-ionisering Hydrogen-deuterium Veksling massespektrometri for å studere Protein struktur og dynamikk

Løse affinitetsrenset protein komplekser av Blå Native PAGE og Protein korrelasjon Profiling

Lipid Droplet Isolasjon for Quantitative massespektrometri analyse

Dyp proteom profilering av isobar merking, omfattende flytende Ture, massespektrometri og Software-baserte kvantifisering

Optimal utarbeidelse av Formalin fast prøver for peptid basert Matrix assistert Laser desorpsjon/ionisering massespektrometri Imaging arbeidsflyter

Nitropeptide profilering og identifisering illustrert av angiotensin II

Prøve forberedelse til sonde elektrospray ionisering massespektrometri

Kvantitativ analyse av cellulær lipidom eav saccharomyces cerevisiae ved hjelp av flytende kromatografi kombinert med tandem massespektrometri

Trinnvis Doseringsprotokoll for økt gjennomstrømming i etikettfrie impedansbaserte GPCR-analyser

Read Article