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Análise de microbiota usando PCR de duas etapas e sequenciamento do gene 16S rRNA de próxima geração
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Biologia
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JoVE Journal Biologia
Microbiota Analysis Using Two-step PCR and Next-generation 16S rRNA Gene Sequencing
DOI:

11:22 min

October 15, 2019

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Capítulos

  • 00:04Título
  • 01:25Extraction of DNA from Fecal Sample
  • 02:2916S rRNA Gene Amplification (PCR1) and DNA Library Construction (PCR2)
  • 03:57Clean-up of Indexed PCR (PCR2) and Quantification
  • 06:03Sequence Analysis
  • 07:49Results: Quality Profile and Statistical Analysis
  • 09:29Conclusion

Summary

Tadução automática

É descrito aqui um procedimento de funcionamento padrão simplificado para o perfilamento do microbioma usando o sequenciação metagenômica 16s rRNA e a análise usando ferramentas livremente disponíveis. Este protocolo ajudará os investigadores que são novos ao campo do microbioma assim como aqueles que exigem actualizações em métodos para conseguir o perfilamento bacteriano em uma definição mais elevada.

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