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펩타이드 농축 및 질량 분광법에 의한 단백질 유비퀴틴화 부위 검출

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Bioquímica

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JoVE Journal Bioquímica

Detection of Protein Ubiquitination Sites by Peptide Enrichment and Mass Spectrometry

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펩타이드 농축 및 질량 분광법에 의한 단백질 유비퀴틴화 부위 검출

DOI:

10.3791/59079-v

•

11:54 min

•

March 23, 2020

•

Karel Bezstarosti, Lennart van der Wal, Jeroen A. A. Demmers

¹Proteomics Center,Erasmus University Medical Center

Capítulos

00:05Introduction
01:16Sample Preparation
03:36Offline Peptide Fractionation
06:16Nanoflow LC-MS/MS
07:51Data Analysis
09:00Results: Detection of diGly Peptides Using Nanoflow LC-MS/MS
10:51Conclusion

Summary

Tadução automática

우리는 복잡한 생물학적 샘플에서 유비퀴틴화 된 단백질에서 유래 한 diGly 펩티드의 정제, 검출 및 식별방법을 제시합니다. 제시된 방법은 유비퀴티노메 분석의 깊이 수준에 대하여 공표된 방법을 재현가능하고 견고하며 능가합니다.

Tags

Keywords: Protein Ubiquitination DiGly Peptides Mass Spectrometry SILAC Protein Enrichment Lys-C Trypsin Digestion TFA Precipitation

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