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プロモーター キャプチャこんにちは-c: 高解像度, ゲノム プロモーターの相互作用のプロファイリング
JoVE Journal
Genética
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JoVE Journal Genética
Promoter Capture Hi-C: High-resolution, Genome-wide Profiling of Promoter Interactions
DOI:

10:16 min

June 28, 2018

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Capítulos

  • 00:04Título
  • 00:52Formaldehyde Fixation
  • 02:14HindIII Digestion and Biotinylation of Restriction Fragment Overhangs
  • 04:09Hybrid In-solution Capture
  • 06:53Isolation of Promoter Fragment-containing Ligation Products
  • 08:55Results: IL8 PCHi-C Profile in Human Hematopoietic Cells
  • 09:34Conclusion

Summary

Tadução automática

DNA 規制要素、エンハンサーなどは、物理的にゲノム長距離にまたがる長距離染色体相互作用を介して多くの場合、ターゲット遺伝子のプロモーターに連絡して遺伝子発現を制御します。プロモーターが PCHi ハをやあ-C のキャプチャは、その標的遺伝子への潜在的な規制シーケンスの割り当てを有効にするプロモーターと遠位領域の重要な相互作用を識別します。

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