Journal
/
Ambiente
/
Un flusso di lavoro metaproteomica Aquatic microbica: dalle celle ai Trittico Peptidi per l'analisi basata su spettrometria di massa tandem
JoVE Journal
Ambiente
É necessária uma assinatura da JoVE para visualizar este conteúdo.  Faça login ou comece sua avaliação gratuita.
JoVE Journal Ambiente
An Aquatic Microbial Metaproteomics Workflow: From Cells to Tryptic Peptides Suitable for Tandem Mass Spectrometry-based Analysis
Please note that all translations are automatically generated. Click here for the English version.

Un flusso di lavoro metaproteomica Aquatic microbica: dalle celle ai Trittico Peptidi per l'analisi basata su spettrometria di massa tandem

DOI:
10.3791/52827-v

•

08:09 min

•

September 15, 2015

•

,
1Department of Biology,Concordia University

Capítulos

  • 00:05Título
  • 01:06Perform Cell Lysis in Catridge Filter Unit with Cells Preserved in RNA Stabilization Solution
  • 04:07Protein Precipitation and Peptide Extraction
  • 05:25DNA Precipitation
  • 06:49Results: Taxonomic and Functional Analysis of Arctic Ocean Microbial Communities
  • 07:50Conclusion

Summary

Tadução automática

Tadução automática

This protocol is for the extraction and concentration of protein and DNA from microbial biomass collected from seawater, followed by the generation of tryptic peptides suitable for tandem mass spectrometry-based proteomic analysis.

Tags

Keywords: Aquatic Microbial MetaproteomicsMetaproteomicsMetagenomicsMetatranscriptomicsMarine Microbial CellsSterivex FilterRNA StabilizationPeptide DigestionTandem Mass SpectrometryDatabase Search

Article

Embed

ADICIONAR À PLAYLIST

Usage Statistics

Vídeos Relacionados

check_url/pt/52827?article_type=v

Caratterizzazione e applicazione di passivi Campionatori per il monitoraggio dei pesticidi in acqua
check_url/pt/52827?article_type=v

Metodo alternativo di rimozione otoliti da Sturgeon
check_url/pt/52827?article_type=v

Estrazione e l'analisi delle microbica fosfolipidi acidi grassi nei terreni
check_url/pt/52827?article_type=v

Un sistema di esposizione di flusso-through per valutare sospeso Sedimenti Effetti sulla vita acquatica
check_url/pt/52827?article_type=v

Ricerca di base in medicina al Plasma - un approccio di Throughput da liquidi a celle
check_url/pt/52827?article_type=v

Caratterizzazione di biofilm acquatici con citometria a flusso
check_url/pt/52827?article_type=v

Isolamento ed analisi di comunità microbiche nel suolo, rizosfera e radici negli esperimenti di erba perenne
check_url/pt/52827?article_type=v

Protocollo sperimentale per l'esame di profili di risposta comportamentale nel pesce larvale: applicazione alla caffeina Neuro-stimolante
check_url/pt/52827?article_type=v

Combinare i dati di tracciamento degli occhi con un'analisi dei contenuti video da Free-visualizzazione di un video di una passeggiata in un ambiente parco urbano
check_url/pt/52827?article_type=v

Composizione e analisi della distribuzione di Bioaerosols in diverse condizioni ambientali

Read Article