Este artículo describe un método para obtener una imagen tridimensional (3D), estructura de las moléculas helicoidales ensamblados con crio-microscopía electrónica. En este protocolo, el uso de conjuntos de la cápside del VIH-1 para ilustrar el procedimiento detallado de reconstrucción 3D para el logro de un mapa de densidad por el método iterativo helicoidal reconstrucción del espacio real.